К основному содержанию
NeVibeCode · 676 карточек

Скиллы по теме «Наука и исследования»

Скиллы по теме «Наука и исследования»: у каждой карточки — что делает, команда установки и примеры запросов.

latex-posters K-Dense-AI скилл Собирает научные постеры через три LaTeX-пакета, компилирует PDF и проверяет шрифты перед отправкой в типографию. CX Codex +1 2 000установок bgpt-paper-search K-Dense-AI скилл Скилл ищет научные статьи в BGPT по темам или DOI. Он извлекает прямые факты, статистику и контекст экспериментов из полного текста публикаций. CX Codex +1 2 000установок pptx-posters K-Dense-AI скилл Собирает одностраничный научный постер в редактируемый .pptx из локального JSON-манифеста и проверяет его до печати. CX Codex +1 2 000установок scholar-evaluation K-Dense-AI скилл Скилл проводит качественный развивающий разбор научных черновиков и протоколов с привязкой к источникам. Помогает проверить рубрики оценки без метрик престижа. CX Codex +1 2 100установок pylabrobot K-Dense-AI скилл Помогает проектировать протоколы PyLabRobot, проверять геометрию планшетов и симулировать дозирование без подключения к реальным роботам. CX Codex +1 1 900установок tiledbvcf K-Dense-AI скилл Скилл хранит варианты генома в TileDB-VCF, принимает VCF/BCF и выполняет запросы по регионам и образцам. Нужен для работы с когортами. CX Codex +1 1 900установок omero-integration K-Dense-AI скилл Скилл для инвентаризации и автоматизации микроскопических данных на OMERO.server: обход объектов, экспорт метаданных, планирование импорта. CX Codex +1 1 900установок rowan K-Dense-AI скилл Запускает облачные расчёты молекулярной динамики, докинга и предсказания pKa через Python API. Помогает моделировать молекулы без локального GPU-кластера. CX Codex +1 1 900установок qutip K-Dense-AI скилл Скилл помогает моделировать квантовую динамику в QuTiP 5 и проверять физические допущения, размерности и сходимость расчётов. CX Codex +1 1 900установок opentrons-integration K-Dense-AI скилл Скилл для написания, проверки и отладки протоколов Opentrons Protocol API v2 на Python. Работает с жидкостными манипуляторами Flex и OT-2, помогает настроить деку, пипетки, модули и параметры запуска. CX Codex +1 1 900установок dnanexus-integration K-Dense-AI скилл Скилл автоматизирует работу с геномной платформой DNAnexus через dx CLI и библиотеку dxpy. Пригодится при сборке апплетов dxapp.json, контроле расходов и импорте пайплайнов Nextflow. CX Codex +1 1 900установок latchbio-integration K-Dense-AI скилл Скилл, который проводит агента по всей работе с Latch: воркфлоу на Python SDK, упаковка Nextflow и Snakemake, регистрация образа, запуск прогонов. CX Codex +1 1 900установок neuropixels-analysis K-Dense-AI скилл Ведёт обработку внеклеточных записей Neuropixels от сырых файлов до отобранных юнитов: загрузка, препроцессинг, коррекция дрейфа, спайк-сортировка, метрики качества. CX Codex +1 1 900установок pyopenms K-Dense-AI скилл Обрабатывает данные масс-спектрометрии в протеомике и метаболомике через pyOpenMS. Помогает находить сигналы, идентифицировать пептиды и собирать матрицы количественного анализа. CX Codex +1 1 900установок polars-bio K-Dense-AI скилл Считает геномные интервалы в Polars DataFrame и читает биоинформатические форматы от BED до CRAM. Пригодится, когда пайплайн на Python перерос bedtools. CX Codex +1 1 900установок gtars K-Dense-AI скилл Скилл для работы с геномными интервалами, перекрытиями, консенсусом и покрытием через Python, Rust и CLI. Требует Python 3.10+ и gtars 0.10.0; локальные инструменты работают без сети. CX Codex +1 1 900установок histolab K-Dense-AI скилл Помогает подготовить гистологические WSI-снимки: находит ткани через маски, нарезает тайлы и нормализует окрашивание H&E. CX Codex +1 1 900установок qiskit K-Dense-AI скилл Скилл для разработки квантовых алгоритмов: строит схемы, транспилирует их под конкретное железо, запускает на симуляторах или реальных квантовых процессорах IBM. Нужен Python 3.10+ и опциональные компоненты в зависимости от задачи. CX Codex +1 1 900установок lamindb K-Dense-AI скилл Ведёт реестр биологических датасетов и моделей в LaminDB: регистрация артефактов, схемы, аннотации Bionty, поиск по метаданным. CX Codex +1 1 900установок matchms K-Dense-AI скилл Обрабатывает, фильтрует и сравнивает тандемные масс-спектры MS/MS через библиотеку matchms. Пригодится для сопоставления спектров со справочными библиотеками и расчёта сходства. CX Codex +1 1 900установок protocolsio-integration K-Dense-AI скилл Скилл читает и проверяет данные protocols.io по официальным REST-контрактам, а изменения только планирует. Пригодится, если нужно выгрузить протокол или его версию. CX Codex +1 1 900установок scvelo K-Dense-AI скилл Запускает анализ РНК-скорости по слоям spliced и unspliced для проверки траекторий дифференцировки клеток. Пригодится в биоинформатических пайплайнах с AnnData и Scanpy. CX Codex +1 1 900установок phylogenetics K-Dense-AI скилл Скилл для выравнивания последовательностей ДНК и белков, построения филогенетических деревьев с расчётом поддержки ветвей и визуализации результатов. Нужен исследователям в биоинформатике, микробиологии и молекулярной эволюции. CX Codex +1 1 900установок flowio K-Dense-AI скилл Разбирает и создаёт файлы проточной цитометрии FCS 2.0, 3.0 и 3.1: метаданные, каналы, события в NumPy. Пригодится, когда нужно заглянуть внутрь FCS или подготовить данные для pandas. CX Codex +1 1 900установок pytdc K-Dense-AI скилл Скилл помогает искать терапевтические датасеты Therapeutics Data Commons, готовить разбиения и запускать оракулы без лишнего скачивания гигабайтов данных. CX Codex +1 1 900установок geniml K-Dense-AI скилл Проверяет контракты BED и геномных универсумов, планирует запуски Region2Vec и scEmbed. Нужен перед локальным анализом геномных интервалов. CX Codex +1 1 900установок etetoolkit K-Dense-AI скилл Работает с готовыми филогенетическими деревьями через библиотеку ETE 4: сравнивает топологии, аннотирует узлы, находит дупликации генов, запрашивает таксономию NCBI и GTDB. CX Codex +1 1 900установок pennylane K-Dense-AI скилл Помогает строить квантовые схемы в PennyLane 0.45.1, обучать гибридные модели с PyTorch и запускать алгоритмы VQE или QAOA. CX Codex +1 1 900установок labarchive-integration K-Dense-AI скилл Скилл помогает работать с API LabArchives ELN и Inventory API v1: выбрать региональный адрес, собрать подпись и проверить план запроса. CX Codex +1 1 900установок molfeat K-Dense-AI скилл Преобразует структуры молекул в отпечатки, дескрипторы и встроенные представления для машинного обучения, поиска по сходству и виртуального скрининга. Нужен Python 3.11+, RDKit и PyTorch. CX Codex +1 1 900установок pathml K-Dense-AI скилл Скилл помогает настроить пайплайны вычислительной патологии на базе PathML 3.0.8. Он автоматизирует нарезку слайдов на тайлы, сегментацию ткани и сохранение результатов в .h5path. CX Codex +1 1 900установок cobrapy K-Dense-AI скилл Помогает анализировать метаболические модели через COBRApy: рассчитывать потоки, проверять нокауты генов и состав среды. CX Codex +1 1 900установок treatment-plans K-Dense-AI скилл Скилл форматирует и структурно проверяет локальную документацию планов лечения, когда решения уже приняты и подтверждены врачом. Клинические решения он не принимает. CX Codex +1 1 900установок depmap K-Dense-AI скилл Скилл для поиска и анализа данных Cancer Dependency Map (DepMap). Помогает проверять генные зависимости, ко-эссенциальность и чувствительность опухолевых моделей к препаратам PRISM. CX Codex +1 1 900установок diffdock K-Dense-AI скилл Считает позы связывания малой молекулы с белком через DiffDock и DiffDock-L, от одной пары до батча. Нужен, когда надо получить и разобрать кандидатные позы. CX Codex +1 1 900установок cirq K-Dense-AI скилл Скилл по фреймворку Cirq от Google Quantum AI: сборка и симуляция квантовых схем, моделирование шума, запуск на железе. Нужен, когда проект на Python работает с квантовыми вычислениями. CX Codex +1 1 900установок pysam K-Dense-AI скилл Направляет агента при работе с геномными форматами SAM, BAM, CRAM, VCF и FASTA через библиотеку pysam. Пригодится для чтения выравниваний, фильтрации ридов и расчёта покрытия. CX Codex +1 1 900установок medchem K-Dense-AI скилл Отбирает соединения по правилам лекарственной пригодности, структурным предупреждениям и сложности. Нужен для фильтрации библиотек молекул. CX Codex +1 1 900установок neurokit2 K-Dense-AI скилл Скилл помогает выстраивать воспроизводимую обработку биосигналов в NeuroKit2 0.2.13. Защищает пайплайн от конфликта версий библиотек и ошибок в единицах измерения. CX Codex +1 1 900установок scvi-tools K-Dense-AI скилл Помогает подбирать и обучать вероятностные модели для данных single-cell omics. Нужен для интеграции партий, аннотации клеток и анализа мультимодальных измерений. CX Codex +1 1 900установок

81–120 из 676

Уточнить выбор

Спонсоры проекта

Компании, которые помогают держать аналитику открытой