К основному содержанию
affpapa.org
RU EN
скилл Claude Code CX Codex Cursor GitHub Copilot

molfeat — скилл для Claude Code: молекулярная фичеризация

Преобразует структуры молекул в отпечатки, дескрипторы и встроенные представления для машинного обучения, поиска по сходству и виртуального скрининга. Нужен Python 3.11+, RDKit и PyTorch.

Установить в Claude Code · Через Skills CLI (Vercel) Все способы и платформы ↓ 
npx skills add K-Dense-AI/scientific-agent-skills --skill molfeat -a claude-code
Открыть на GitHub

Что делает molfeat

Скилл даёт доступ к Molfeat 1.0.0 — инструменту для превращения SMILES и RDKit-молекул в числовые признаки. Поддерживает ECFP/MACCS отпечатки, 2D/3D дескрипторы RDKit, фармакофорные пары и предтренированные встроенные представления из Hugging Face. Можно сохранять и загружать состояние фичеризатора в YAML.

В версии 1.0 убрали DGL, старый Graphormer и адаптеры для белков — если найдёте карточки моделей, ссылающиеся на них, они уже не работают. Требует Python 3.11–3.14; на Intel macOS только 3.11–3.12 с NumPy<2 и Transformers<5. Для претренированных моделей нужен интернет и место на диске; базовые отпечатки работают offline. Обязательно сохраняйте исходные ID, метки, политику обработки салей и стереохимии, версии пакетов — при миграции на 1.x нужна переvalidation.

Какие задачи решает

  • Вычислить молекулярные отпечатки (ECFP, MACCS) для датасета
  • Получить дескрипторы и фармакофорные признаки из структур
  • Загрузить претренированные встроенные представления из Hugging Face
  • Сохранить и воспроизвести конфигурацию фичеризатора между запусками
  • Выравнять результаты по идентификаторам молекул и отфильтровать ошибочные записи

Примеры запросов агенту

  • Создай ECFP отпечатки радиуса 2 для этих SMILES и отфильтруй невалидные
  • Загрузи ChemBERTa встроенные представления для моих молекул
  • Сохрани состояние фичеризатора в YAML и используй его на тестовом наборе

Как установить molfeat

1Через Skills CLI (Vercel)

npx skills add K-Dense-AI/scientific-agent-skills --skill molfeat -a claude-code

2Вручную: положить файлы

~/.claude/skills/molfeat/SKILL.md

Папка скилла целиком; для одного проекта — .claude/skills/molfeat/

Из того же набора120

Весь набор →
scientific-visualization K-Dense-AI Помогает создавать и проверять научные графики для публикаций в Matplotlib, Seaborn и Plotly с соблюдением требований к данным и контрасту. Claude Code CX Codex Cursor +1 2 400установок scientific-writing K-Dense-AI Скилл помогает писать и проверять научные рукописи и отчёты, связывая утверждения с проверенными источниками. Пригодится перед аудитом, подготовкой разделов и подачей статьи. Claude Code CX Codex Cursor +1 2 400установок statistical-analysis K-Dense-AI Проводит статистические тесты с проверкой предпосылок, расчётом размера эффекта и отчётом в формате APA. Покрывает t-тесты, ANOVA, корреляцию, регрессию, непараметрику и байесовские методы. Claude Code CX Codex Cursor +1 2 300установок scientific-brainstorming K-Dense-AI Скилл структурирует научный мозговой штурм: от независимой генерации идей до состязательного ревью и журнала решений. Помогает отобрать направления исследований без преждевременных выводов. Claude Code CX Codex Cursor +1 2 300установок literature-review K-Dense-AI Скилл ищет и систематизирует научные публикации, проверяет цитаты и помогает собрать обзор в Markdown или PDF. Подходит для воспроизводимого поиска и скрининга. Claude Code CX Codex Cursor +1 2 300установок scientific-critical-thinking K-Dense-AI Скилл для оценки научных утверждений, методологии исследований и качества доказательств. Применяет фреймворки GRADE и Cochrane Risk of Bias. Claude Code CX Codex Cursor +1 2 300установок scientific-schematics K-Dense-AI Создаёт черновики научных схем в PNG и проверяет их качество через отдельную модель. Пригодится для архитектур нейросетей, блок-схем и биологических путей. Claude Code CX Codex Cursor +1 2 200установок scikit-learn K-Dense-AI Скилл для задач машинного обучения на Python: классификация, регрессия, кластеризация, препроцессинг и сборка ML-пайплайнов с библиотекой scikit-learn 1.9.1. Claude Code CX Codex Cursor +1 2 200установок

Похожие

azure-architecture-autopilot официальный github Скилл проектирует архитектуру Azure по запросу или анализирует существующие ресурсы, затем помогает создать и проверить Bicep перед развёртыванием. Пригодится для нового проекта и изменений в текущей инфраструктуре. GitHub Copilot 1 500установок agent-owasp-compliance официальный github Проверяет кодовую базу AI-агента по 10 рискам OWASP ASI. Подойдёт для аудита перед production и подготовки отчёта по безопасности. GitHub Copilot 1 500установок rag-architect https://github.com/Jeffallan Проектирует RAG-системы: разбивает документы на чанки, генерирует эмбеддинги, настраивает векторные базы, строит гибридный поиск и оценивает качество извлечения контекста. Claude Code CX Codex Cursor +1 4 700установок ads-microsoft AgriciDaniel Проверяет кампании Microsoft Ads, Bing Ads, UET и аудиторий сети: измерения, конверсии, импорты из Google, ключевые слова, креативы, ставки и бюджеты. Только чтение; изменения делает ads-optimize. Claude Code CX Codex Cursor +1 3 800установок azure-speech-to-text calesthio Транскрибирует аудио в текст через REST API Azure AI Speech с таймкодами слов и разделением по спикерам. Помогает собирать субтитры в пайплайнах OpenMontage без долгой локальной обработки. Claude Code CX Codex Cursor +1 763установок langgraph-persistence langchain-ai Скилл по персистентности LangGraph: как подключить checkpointer, развести диалоги по thread_id и откатиться к прошлому состоянию графа. Claude Code CX Codex Cursor +1 18 000установок skill-creator официальный anthropics Помогает создать новый скилл, доработать существующий и проверить результат через тестовые промпты и оценки. Claude Code Claude.ai 414 180установок writing-for-agents Matt Pocock Помогает писать скиллы и документы с инструкциями для агентов. Пригодится при правках AGENTS.md, CLAUDE.md и связанных справочных файлов. Claude Code 466 719установок

Вопросы о molfeat

Как установить molfeat в Claude Code?

Выполни команду npx skills add K-Dense-AI/scientific-agent-skills --skill molfeat -a claude-code. Скилл появится в ~/.claude/skills/molfeat/SKILL.md.

Что требуется для работы molfeat?

Python 3.11–3.14 и пакеты: molfeat 1.0.0, RDKit, datamol, PyTorch. На Intel macOS используй Python 3.11–3.12. Для претренированных моделей нужны дополнительные extras (molfeat[transformer]) и интернет.

Чем версия 1.0.0 отличается от 0.11?

Убрали DGL, Graphormer, адаптеры для белков. Если найдёте старые карточки моделей — они уже не работают. Используй 1.0 migration guide из репозитория.

Смотрите также

Спонсоры проекта

Компании, которые помогают держать аналитику открытой
Золотой спонсор AI-аналитика спроса на iGaming — индекс, тренды, конкуренты
Nutra.Club Закрытое сообщество Nutra-вертикали от команды M1

Показы, клики и копирования кода — открытая статистика. Мы держим цифры публичными по той же логике, что и сам NeBlask. Стать спонсором