К основному содержанию

NeVibeCode · 676 карточек

Скиллы по теме «Наука и исследования»

Скиллы по теме «Наука и исследования»: у каждой карточки — что делает, команда установки и примеры запросов.

paperzilla K-Dense-AI скилл Скилл даёт агенту прямой доступ к проектам, рекомендациям и научным статьям в Paperzilla через CLI. Пригодится, если вы ищете релевантные работы, следите за фидом проекта или экспортируете результаты. CX Codex +1 1 900установок zarr-python K-Dense-AI скилл Помогает организовать хранение и выборку многомерных массивов в Zarr-Python 3. Пригодится при настройке чанков, шардинга и чтения данных из облачных хранилищ. CX Codex +1 1 900установок esm K-Dense-AI скилл Скилл для Python-SDK esm от Biohub: генерация белковых последовательностей в ESM3, эмбеддинги ESMC и предсказание структуры ESMFold2 — локально или через хостед-клиент. CX Codex +1 1 900установок pyhealth K-Dense-AI скилл Собирает и проверяет пайплайны PyHealth для клинических данных: EHR, сигналы, снимки, медицинские коды. Пригодится, если считаете смертность, повторную госпитализацию или длительность пребывания. CX Codex +1 1 900установок torchdrug K-Dense-AI скилл Помогает настроить пайплайны TorchDrug 0.2.1 для графов молекул и белков. Пригодится при сборке моделей прогнозирования свойств, генерации молекул и поиске ретросинтеза. CX Codex +1 1 900установок pymatgen K-Dense-AI скилл Анализирует и преобразует структуры материалов и расчётные данные через pymatgen. Нужен для фазовых диаграмм, симметрии, файлов электронных расчётов и запросов к Materials Project. CX Codex +1 1 900установок imaging-data-commons K-Dense-AI скилл Скилл для поиска и загрузки открытых данных медицинских изображений из репозитория NCI Imaging Data Commons. Работает с DICOM, КТ, МР, ПЭТ и цифровой патологией без аутентификации для базовых операций. CX Codex +1 1 900установок fluidsim K-Dense-AI скилл Помогает настраивать, валидировать и перезапускать гидродинамические симуляции во FluidSim с проверкой сходимости и ресурсов перед запуском на HPC. CX Codex +1 1 900установок molecular-dynamics K-Dense-AI скилл Собирает систему для молекулярной динамики в OpenMM, гоняет минимизацию и уравновешивание, а потом считает по траекториям RMSD, RMSF и карты контактов через MDAnalysis. CX Codex +1 1 900установок pydeseq2 K-Dense-AI скилл Скилл для дифференциального анализа экспрессии генов по данным RNA-seq. Выполняет отрицательно-биномиальные GLM с учётом биологических реплик, контрастов и ковариат. CX Codex +1 1 900установок adaptyv K-Dense-AI скилл Скилл помогает планировать эксперименты по характеризации белков через облачную лабораторию Adaptyv Bio Foundry, оценивать стоимость и забирать результаты тестов. CX Codex +1 1 900установок arboreto K-Dense-AI скилл Считает кандидатные связи «регулятор — мишень» по данным экспрессии: GRNBoost2 на бустинге, GENIE3 на случайном лесу. Нужен, когда есть таблица генов и список факторов. CX Codex +1 1 900установок vaex K-Dense-AI скилл Скилл для работы с датасетами, которые не влезают в оперативную память. Обрабатывает HDF5, Arrow, CSV и Parquet через виртуальные выражения Vaex, ленивые вычисления и потоковую статистику. CX Codex +1 1 900установок benchling-integration K-Dense-AI скилл Помогает автоматизировать работу с лабораторными данными в Benchling через Python SDK 1.25.0 и REST API v2. Пригодится для регистрации сущностей, учёта образцов и экспорта записей ELN. CX Codex +1 1 900установок datamol K-Dense-AI скилл Помогает агенту работать с молекулярными данными через datamol и RDKit: разбирать SMILES, считать дескрипторы, строить конформеры и кластеры. CX Codex +1 1 900установок cellxgene-census K-Dense-AI скилл Скилл для программного доступа к CZ CELLxGENE Census — гигантскому каталогу стандартизированных данных по одиночным клеткам. Запрашивайте метаданные, экспрессию генов и эмбеддинги без загрузки целых датасетов. CX Codex +1 1 900установок deepchem K-Dense-AI скилл Настраивает пайплайны хемоинформатики и предсказания свойств молекул в DeepChem 2.8.0. Помогает подготовить SMILES и обучить модели ADMET. CX Codex +1 1 900установок deeptools K-Dense-AI скилл Скилл для работы с данными секвенирования: конвертирует BAM в bigWig, считает QC и рисует профили вокруг TSS и пиков. CX Codex +1 1 900установок pydicom K-Dense-AI скилл Скилл для работы с локальными наборами DICOM: проверяет заголовки, извлекает метаданные и готовит пиксельные массивы. Защищает от утечки медицинских данных в логи. CX Codex +1 1 900установок astropy K-Dense-AI скилл Помогает писать и отлаживать код анализа астрономических данных с Astropy. Пригодится для координат, FITS-файлов, таблиц и расчёта времени. CX Codex +1 1 900установок scanpy K-Dense-AI скилл Скилл с готовыми скриптами для полного цикла анализа single-cell RNA-seq: от контроля качества до маркерных генов и визуализации. Пригодится, когда нужно прогнать данные через Scanpy, не собирая пайплайн вручную. CX Codex +1 1 900установок rdkit K-Dense-AI скилл Скилл помогает агенту работать с библиотекой RDKit: разбирать структуры молекул, считать дескрипторы и строить 3D-конформации. CX Codex +1 1 900установок clinical-decision-support K-Dense-AI скилл Готовит и проверяет исследовательские артефакты клинических решений: профили доказательств, когорты, выживаемость, деидентификацию. Не для помощи пациентам. CX Codex +1 1 900установок gget K-Dense-AI скилл Скилл для поиска биоинформатических данных и вызова геномных баз через gget. Пригодится для быстрой выгрузки генов, последовательностей и белковых структур прямо в терминале. CX Codex +1 1 900установок clinical-reports K-Dense-AI скилл Скилл собирает каркас черновика клинического отчёта и проверяет его локальными скриптами. На входе — синтетические, деидентифицированные или агрегированные данные. CX Codex +1 1 900установок anndata K-Dense-AI скилл Скилл для создания, чтения и преобразования аннотированных матриц данных в формате h5ad и Zarr. Интегрируется с экосистемой scverse для анализа транскриптомики и других типов данных с метаданными. CX Codex +1 1 900установок bioservices K-Dense-AI скилл Помогает запрашивать биоинформатические базы через библиотеку BioServices в Python. Пригодится при аннотации белков, поиске путей в KEGG и маппинге химических соединений. CX Codex +1 1 900установок hypogenic K-Dense-AI скилл Скилл для аудита и планирования использования HypoGeniC — инструмента генерации гипотез из размеченных текстовых датасетов с помощью LLM. Нужен, если вы работаете с пакетом hypogenic, его конфигами или бенчмарками HypoBench. CX Codex +1 1 900установок what-if-oracle K-Dense-AI скилл Разбирает исследовательский план по веткам «что если»: благоприятной, базовой, неблагоприятной и другим. Помогает до траты ресурсов увидеть, где план сломается. CX Codex +1 1 900установок simpy K-Dense-AI скилл Помогает строить, тестировать и анализировать модели дискретно-событийного моделирования на Python с библиотекой SimPy. Пригодится для расчёта очередей и логистики. CX Codex +1 1 900установок geomaster K-Dense-AI скилл Помогает вести геопространственные исследования: работать со спутниковыми снимками, векторными и растровыми данными, CRS и пространственной статистикой. CX Codex +1 1 900установок pymoo K-Dense-AI скилл Скилл для работы с pymoo: подбор алгоритма, постановка задачи, ограничения и разбор фронта Парето. Пригодится, когда целей несколько и они конфликтуют. CX Codex +1 1 900установок scikit-bio K-Dense-AI скилл Помогает анализировать биоинформатические данные: последовательности ДНК, РНК и белков, выравнивания и филогенетические деревья. Пригодится в проектах микробиологии и экологии. CX Codex +1 1 900установок geopandas K-Dense-AI скилл Помогает анализировать векторные геоданные в Python, проверять корректность геометрий и планировать перепроецирование через локальные аудиты. CX Codex +1 1 900установок research-lookup K-Dense-AI скилл Собирает актуальные научные статьи и ссылки для рукописи или обзора, когда нужно 60+ проверенных источников. Использует параллельный поиск, извлечение данных из PDF и веб-источников, поддерживает глубокий поиск и опциональный Perplexity. CX Codex +1 1 900установок biopython K-Dense-AI скилл Скилл помогает автоматизировать задачи биоинформатики: разбирать файлы FASTA и PDB, выравнивать последовательности и запрашивать данные через NCBI Entrez. CX Codex +1 2 000установок torch-geometric K-Dense-AI скилл Помогает работать с графовыми нейросетями в PyTorch Geometric: готовить графы, выбирать слои и решать задачи классификации. Нужен при работе с torch_geometric. CX Codex +1 2 000установок venue-templates K-Dense-AI скилл Помогает готовить рукописи, тезисы конференций, постеры и гранты с актуальными требованиями площадок и встроенными LaTeX-шаблонами. Проверяет лимиты страниц, правила анонимности и форматирование перед отправкой. CX Codex +1 2 000установок open-notebook K-Dense-AI скилл Организует исследовательские блокноты с конспектами, поиском и вопросами к документам через локальные или облачные модели. Пригодится при работе с селф-хостед альтернативой NotebookLM. CX Codex +1 2 000установок sr-screener Imbad0202 скилл Скилл организует отбор научных публикаций по протоколу для систематических обзоров. Проводит независимый двойной скрининг названий, аннотаций и текстов. CX Codex +1 469установок

121–160 из 676

Уточнить выбор

Спонсоры проекта

Компании, которые помогают держать аналитику открытой

Золотой спонсор

AI-аналитика спроса на iGaming — индекс, тренды, конкуренты

Nutra.Club Закрытое сообщество Nutra-вертикали от команды M1

Показы, клики и копирования кода — открытая статистика. Мы держим цифры публичными по той же логике, что и сам NeBlask. Стать спонсором