NeVibeCode · 676 карточек
Скиллы по теме «Наука и исследования»
Скиллы по теме «Наука и исследования»: у каждой карточки — что делает, команда установки и примеры запросов.
typst-author скилл Скилл помогает писать, править и форматировать документы Typst. Он направляет агента сверять синтаксис со справочниками и запускать проверки разметки.
CX Codex +1
1 800установок
hugging-science скилл Скилл для поиска и оценки научных датасетов, моделей и интерактивных демо через каталог Hugging Science. Пригодится, если нужен ML-ресурс для биологии, химии, геномики, материаловедения, климата или физики.
CX Codex +1
1 800установок
ginkgo-cloud-lab скилл Помогает выбрать протокол, подготовить входные данные и оформить заказы в облачной лаборатории Ginkgo Bioworks. Пригодится при синтезе РНК и экспрессии белков.
CX Codex +1
1 900установок
primekg скилл Скилл даёт Claude Code локальный доступ к PrimeKG: ищет узлы, тянет соседей и собирает карточку болезни из CSV графа. Пригодится для проверки биологических гипотез.
CX Codex +1
1 900установок
glycoengineering скилл Скилл для разбора сайтов N- и O-гликозилирования в последовательностях белков: поиск мотивов, подготовка мутаций и работа с предсказательными сервисами.
CX Codex +1
1 800установок
mathmodel-figure-templates скилл Скилл запускает готовые скрипты на Python и matplotlib для построения научных графиков в песочнице. Помогает собрать диаграммы Тейлора, матрицы корреляций и кривые ROC.
CX Codex +1
1 700установок
exa-search скилл Скилл для поиска научных и технических материалов через Exa с извлечением текста из страниц и PDF-файлов. Работает с предварительной фильтрацией по категории публикаций и академическим доменам.
CX Codex +1
1 700установок
autoskill скилл Анализирует историю работы из Screenpipe, находит повторяющиеся сценарии и готовит черновики новых скиллов. Запускается только по прямому запросу пользователя.
CX Codex +1
1 700установок
paper-spine скилл Скилл для подготовки научных статей с опорой на источники, веб-интерфейсом настроек и проверкой цитирования прямо в одной задаче.
CX Codex +1
1 200установок
tavily-research скилл Запускает глубокий поиск через Tavily CLI и собирает отчёт со ссылками на веб-источники. Помогает, когда простого поиска по одному сайту мало.
CX Codex +1
22 000установок
nextflow скилл Помогает писать, запускать и отлаживать пайплайны Nextflow DSL2 и воркфлоу nf-core. Пригодится при настройке вычислений на SLURM или в облаке.
CX Codex +1
1 400установок
pathway-enrichment скилл Запускает pathway- и gene-set-анализ списка генов или ранжированных данных, находит обогащённые GO-термины, KEGG, Reactome, MSigDB. Нужен после дифференциальной экспрессии, CRISPR-скрининга или кластеризации.
CX Codex +1
1 400установок
experimental-design скилл Помогает спланировать эксперимент до сбора данных: выбрать схему, рандомизировать, разбить на блоки и разложить комбинации факторов. Пригодится, когда исследование ещё в проекте.
CX Codex +1
1 400установок
bulk-rnaseq скилл Готовит прочтения bulk RNA-seq и выравнивание в матрицу отсчётов для дифференциальной экспрессии в PyDESeq2.
CX Codex +1
1 400установок
liteparse скилл Локальный парсер документов, который извлекает текст с координатами bbox. Нужен для RAG с привязкой к макету, OCR сканов и пакетной обработки научных статей.
CX Codex +1
1 400установок
pacsomatic скилл Готовит и запускает прогон nf-core/pacsomatic по схеме «опухоль — норма» на данных PacBio HiFi: собирает samplesheet, артефакты запуска и отправляет драйвер Nextflow в планировщик.
CX Codex +1
1 400установок
statistical-power скилл Вычисляет, сколько объектов наблюдения нужно для исследования, чтобы обнаружить значимый эффект. Помогает при подготовке протокола, гранта или pre-registration — от простых t-тестов до сложных регрессий и смешанных моделей.
CX Codex +1
1 300установок
huggingface-papers скилл Разбирает статьи Hugging Face Papers и arXiv: вытаскивает ID, читает страницу в markdown и достаёт авторов, модели и датасеты через papers API.
CX Codex +1
2 200установок
deep-research скилл Многоэтапное исследование тем с веб-поиском, проверкой кодовой базы и сохранением выводов в память агента. Помогает разобраться в сложной задаче перед написанием кода.
CX Codex +1
893установок
arbor скилл Скилл организует автономный цикл оптимизации кода, моделей и промптов через дерево гипотез. Пригодится для длинных серий экспериментов, когда ручной учёт правок заходит в тупик.
CX Codex +1
1 200установок
onekgpd скилл Инструмент обращается к выборке 1000 Genomes Project на уровне отдельных участников. Помогает находить носителей редких мутаций и сопоставлять родственные связи.
CX Codex +1
1 100установок
tamarind скилл Запускает инструменты структурной биологии и молекулярного дизайна через REST API или MCP-сервер Tamarind Bio. Пригодится для облачных задач без локальных GPU.
CX Codex +1
1 100установок
ml-paper-writing скилл Помогает подготовить статью по машинному обучению и ИИ из исследовательского репозитория, проверить ссылки и собрать финальную версию для конференции.
CX Codex +1
2 300установок
research-synthesize скилл Сводит накопленные в памяти ruflo находки в один отчёт: оценка доказательств, разбор противоречий, список следующих шагов. Пригодится после серии прогонов deep-research.
CX Codex +1
751установок
mermaid-to-proverif скилл Читает Mermaid-диаграмму криптографического протокола и собирает из неё модель ProVerif — файл .pv, готовый для проверки секретности и аутентификации.
CX Codex +1
3 900установок
huggingface-paper-publisher скилл Ведёт статью по Hugging Face Hub: индексирует её по arXiv ID, привязывает к карточкам моделей и датасетов, помогает подтвердить авторство и собрать черновик.
CX Codex +1
1 700установок
uncertainty-and-units скилл Держит единицы измерения от входа до вывода и считает погрешность по GUM: конверсия, бюджет неопределённости, аудит кода и проверка результата на вменяемость.
CX Codex +1
985установок
analytical-method-validation скилл Готовит валидацию, верификацию и перенос аналитических методик по ICH, USP, CLSI и ISO. Нужен, когда надо подтвердить пригодность метода.
CX Codex +1
970установок
genomic-intelligence скилл Скилл гоняет шесть задач по последовательности ДНК через хостинг Genomic Intelligence: промоторы, сайты сплайсинга, энхансеры, хроматин, экспрессию и аннотацию генов. Локальный GPU не нужен.
CX Codex +1
939установок
genomic-coordinates скилл Конвертирует геномные координаты между BED, VCF, GTF и другими форматами, а также выравнивает инделы. Помогает избежать ошибок сдвига на единицу и несовпадения сборок генома.
CX Codex +1
950установок
paperclip скилл Скилл подключает к агенту GXL Paperclip: поиск статей в PMC, документов FDA и клинических исследований, чтение по строкам и цитаты.
CX Codex +1
951установок
iso-standards-readiness скилл Организует evidence для стандартов ISO 13485, ISO 14971, ISO/IEC 17025 и ISO 15189. Структурирует контролируемые документы, файлы рисков и записи прослеживаемости.
CX Codex +1
950установок
ontology-term-resolution скилл Находит идентификаторы онтологий по научным названиям и проверяет CURIE через EBI OLS4. Пригодится при разметке метаданных для репозиториев вроде GEO, BioSamples и CELLxGENE.
CX Codex +1
948установок
openpiv скилл Скилл для измерения полей скоростей жидкости из пар снимков частиц. Обрабатывает корреляцию окон, валидацию векторов, расчёт вихря и турбулентности — нужен для анализа экспериментов по визуализации потоков.
CX Codex +1
943установок
pathogen-variant-surveillance скилл Запрашивает публичные данные LAPIS для наблюдения за вариантами патогенов, их линиями и долями последовательностей по неделям.
CX Codex +1
936установок
pkpd-modeling скилл Считает NCA, компартментные модели и метрики экспозиции по данным концентрация-время, а в отчёте фиксирует, на каких допущениях держатся цифры.
CX Codex +1
935установок
firecrawl-deep-research скилл Пишет аналитический отчёт по сложной теме: собирает источники по открытому вебу через Firecrawl, разбирает вопрос с разных сторон и ставит ссылку к каждому тезису.
CX Codex +1
35 400установок
firecrawl-research-papers скилл Скилл для поиска и анализа научных публикаций через Firecrawl Research. Помогает собирать обзоры литературы по базам PubMed, bioRxiv, medRxiv и arXiv.
CX Codex +1
33 800установок
deepspot-m скилл Модель предсказывает экспрессию генов по тайлу H&E 224x224: на выходе значения log1p-CPM по выбранным символам. Пригодится, если нужна виртуальная пространственная транскриптомика по срезу.
CX Codex +1
877установок
relsa-severity-assessment скилл Скилл рассчитывает многомерный индекс RELSA и строит прогнозы тяжести по модели ARIMA для лабораторных животных. Подходит для отчётов по директиве 2010/63/EU и концепции 3Rs.
CX Codex +1
874установок
161–200 из 676