NeVibeCode · 676 карточек
Скиллы по теме «Наука и исследования»
Скиллы по теме «Наука и исследования»: у каждой карточки — что делает, команда установки и примеры запросов.
literature-search-biorxiv скилл Ищет препринты в bioRxiv и medRxiv по DOI или датам. Нужен для отбора публикаций по категории, автору и ключевым словам.
CX Codex +1
2 500установок
nanogpt скилл Скилл помогает разбирать и запускать учебную реализацию GPT на PyTorch. Он пригодится для экспериментов с трансформерами и обучения на своих текстах.
CX Codex +1
956установок
transformer-lens-interpretability скилл Скилл помогает исследовать внутренние механизмы трансформеров через TransformerLens: кэшировать активации, изучать внимание и проводить activation patching.
CX Codex +1
954установок
pyvene-interventions скилл Скилл помогает настраивать каузальные интервенции в моделях PyTorch через библиотеку pyvene. Пригодится для causal tracing и поиска скрытых механизмов нейросетей.
CX Codex +1
952установок
sparse-autoencoder-training скилл Помогает обучать и исследовать разреженные автоэнкодеры через SAELens. Скилл пригодится для поиска моносемантичных признаков в активациях нейросетей.
CX Codex +1
950установок
citation-verification скилл Скилл для проверки цитирований в научных текстах: помогает не выдумывать источники и сверять метаданные по каноническим базам.
CX Codex +1
1 400установок
torchforge-rl-training скилл Скилл объясняет обучение агентных RL-моделей на PyTorch через torchforge. Пригодится для GRPO, SFT и экспериментов с распределённым обучением.
CX Codex +1
946установок
nnsight-remote-interpretability скилл Помогает исследовать и модифицировать внутренние слои нейросетей через nnsight локально или удалённо через NDIF. Пригодится для экспериментов с моделями от 70B без мощных GPU.
CX Codex +1
945установок
presenting-conference-talks скилл Скилл преобразует готовую научную статью в слайды презентации Beamer LaTeX и PPTX с заметками докладчика. Подходит для подготовки докладов на конференциях по ML и Computer Systems.
CX Codex +1
913установок
academic-pptx скилл Задаёт правила структуры и оформления академических презентаций для защиты диссертаций, докладов на конференциях и отчётов по грантам.
CX Codex +1
1 100установок
ml-training-recipes скилл Скилл содержит практические шаблоны обучения моделей на PyTorch: от настройки циклов и оптимизаторов Muon и AdamW до смешанной точности и устранения OOM.
CX Codex +1
912установок
systems-paper-writing скилл Скилл задаёт структуру академических статей на 10–12 страниц для OSDI, SOSP, ASPLOS, NSDI и EuroSys. Помогает спланировать бюджет страниц и текст каждого абзаца.
CX Codex +1
908установок
clinical-trials-database скилл Ищет клинические исследования в базе ClinicalTrials.gov через REST API v2. Помогает подбирать исследования по диагнозу, препарату, фазе и статусу набора пациентов.
CX Codex +1
2 400установок
deeppapernote скилл Скилл превращает научную статью в структурированную Markdown-заметку для Obsidian. Пригодится, когда нужен глубокий технический разбор вместо краткого пересказа.
CX Codex +1
1 500установок
fine-tuning-serving-openpi скилл Пошаговые сценарии для дообучения и запуска инференса робототехнических моделей OpenPI (pi0, pi0-fast, pi0.5). Помогает подготовить окружение, рассчитать нормализацию и поднять WebSocket-сервер.
CX Codex +1
861установок
fine-tuning-openvla-oft скилл Настраивает дообучение и оценку OpenVLA-OFT для генерации действий робота. Нужен для сценариев LIBERO и ALOHA с непрерывными действиями.
CX Codex +1
861установок
paper-polish скилл Вычитывает академический черновик: грамматика, тон, перевод с китайского на английский. Смысл автора остаётся нетронутым.
CX Codex +1
532установок
blog-notebooklm скилл Запрашивает блокноты Gemini Notebook через сессию браузера и возвращает ответы со ссылками на источники. Пригодится для работы с личной базой документов прямо в агенте.
CX Codex +1
2 500установок
human-protein-atlas-database скилл Извлекает данные об экспрессии белков и их субклеточной локализации из Human Protein Atlas. Помогает проверить наличие белка в тканях человека и опухолях.
CX Codex +1
2 200установок
opentargets-database скилл Скилл даёт агенту доступ к Open Targets Platform через GraphQL: связи ген-болезнь, данные о лекарствах и оценка перспективности мишени.
CX Codex +1
2 200установок
ensembl-database скилл Переводит символы генов в ENSG, ENST и ENSP, тянет последовательности и предсказывает эффект варианта через VEP. Нужен, когда работаешь с геномными данными из терминала.
CX Codex +1
2 200установок
clinvar-database скилл Ищет клиническую значимость и классификацию патогенности геномных вариантов в базе ClinVar. Пригодится для проверки мутаций и поиска контролей.
CX Codex +1
2 200установок
chembl-database скилл Скилл даёт агенту доступ к базе ChEMBL: молекулы, мишени, биоактивность, одобренные лекарства и поиск по структуре.
CX Codex +1
2 200установок
alphagenome-single-variant-analysis скилл Скилл разбирает эффект генетического варианта в формате chr:pos:ref>alt через AlphaGenome API: экспрессия, доступность хроматина, гистоновые метки.
CX Codex +1
2 200установок
uniprot-database скилл Скилл ищет белки, аннотации функций и последовательности в базах UniProtKB, UniParc и UniRef. Помогает сопоставлять идентификаторы и выгружать биологические данные.
CX Codex +1
2 200установок
openfda-database скилл Ищет, считает и выгружает данные из openFDA API. Нужен для запросов о препаратах, отзывах, маркировке, NDC и событиях безопасности FDA.
CX Codex +1
2 200установок
pymol скилл Скилл для PyMOL: строит изображения белковых и молекулярных структур, делает выравнивания, меряет расстояния и контакты. Пригодится, когда есть файл структуры и нужна картинка или метрика.
CX Codex +1
2 200установок
ncbi-sequence-fetch скилл Получает белковые и нуклеотидные последовательности из баз NCBI через E-utilities. Пригодится для поиска данных по номерам accession, генам, локусам, PubMed ID или патентам.
CX Codex +1
2 200установок
pubchem-database скилл Скилл для работы с базой PubChem: ищет соединения по имени, CID или SMILES и вытаскивает свойства, безопасность и биоактивность.
CX Codex +1
2 200установок
alphafold-database-fetch-and-analyze скилл Скачивает предсказанные структуры AlphaFold по UniProt ID и разбирает их: уверенность pLDDT, неупорядоченные участки, границы доменов.
CX Codex +1
2 200установок
pdb-database скилл Ищет и выгружает экспериментальные 3D-структуры белков и лигандов из RCSB PDB по атрибутам, схожести последовательностей или химическому описанию.
CX Codex +1
2 200установок
paper-writer скилл Скилл пишет текст статьи по материалам автора — от абзаца до полной рукописи. Каждое утверждение опирается на источник, а не на память модели.
CX Codex +1
500установок
deep-research скилл Ведёт исследование темы как научный обзор: замораживает вопросы, ищет с разных сторон, проверяет каждую ссылку и пишет отчёт с ответами по пунктам. Пригодится перед выбором темы или статьи.
CX Codex +1
496установок
unibind-database скилл Скилл ищет экспериментально подтверждённые сайты связывания транскрипционных факторов в UniBind и скачивает координаты BED или FASTA для локального анализа.
CX Codex +1
2 100установок
ucsc-conservation-and-tfbs скилл Тянет из UCSC Genome Browser оценки эволюционной консервации (phyloP, phastCons) и сайты связывания транскрипционных факторов. Нужен, когда разбираешь некодирующие варианты.
CX Codex +1
2 100установок
encode-ccres-database скилл Скилл ищет цис-регуляторные элементы (cCRE) в базе ENCODE через SCREEN GraphQL API и выгружает данные экспериментов. Пригодится для анализа промоторов или энхансеров.
CX Codex +1
2 100установок
gnomad-database скилл Скилл запрашивает данные gnomAD о частотах вариантов, ограничениях генов и вариантах в регионах. Нужен для генетических исследовательских задач.
CX Codex +1
2 100установок
quickgo-database скилл Ходит в REST API QuickGO и ECO: связывает гены с биологическими процессами, функциями и клеточными компонентами. Нужен, когда разбираешь аннотации генов.
CX Codex +1
2 100установок
jaspar-database скилл Скилл запрашивает базу JASPAR для поиска профилей связывания транскрипционных факторов. Пригодится, когда нужно получить матрицы PFM и PWM или сопоставить ген с ID матрицы.
CX Codex +1
2 100установок
gtex-database скилл Получает данные об экспрессии РНК и eQTL из GTEx по 54 здоровым тканям человека. Нужен для запросов по генам, вариантам и тканям.
CX Codex +1
2 100установок
241–280 из 676
