torchdrug — скилл для Claude Code: что делает и как установить
Помогает настроить пайплайны TorchDrug 0.2.1 для графов молекул и белков. Пригодится при сборке моделей прогнозирования свойств, генерации молекул и поиске ретросинтеза.
npx skills add K-Dense-AI/scientific-agent-skills --skill torchdrug -a claude-codeЧто делает torchdrug
Скилл ведёт ассистента по архитектуре TorchDrug: от загрузки наборов данных в datasets и выбора архитектуры вроде GIN до постановки задачи через tasks и обучения в core.Engine. Он подсказывает проверенные связки для скрининга свойств, молекулярной генерации на ZINC250k или предсказания центров реакций в ретросинтезе на базе USPTO50k.
Внутри заложены строгие ограничения по окружению. Релиз 0.2.1 рассчитан на Python от 3.7 до 3.10 и PyTorch от 1.8 до 2.0, а пакеты torch-scatter и torch-cluster требуют точного совпадения с установленной версией CUDA. Сборка не запустится на Apple Silicon через ускорение MPS — там возможен только CPU-режим со сборкой расширений из исходников.
Для работы требуются NumPy 1.x во избежание конфликтов ABI, библиотеки RDKit и fair-esm. Скилл сразу предостерегает от попыток ставить параллельно два разных дистрибутива RDKit в одну виртуальную среду.
Какие задачи решает
- Собрать пайплайн прогнозирования свойств молекул на базе графовых сетей
- Обучить генеративные модели молекул через GCPN или GraphAF
- Подготовить данные USPTO50k для задач ретросинтеза
- Развернуть совместимое окружение с PyTorch 2.0, RDKit и fair-esm
Примеры запросов агенту
- Собери скрипт обучения GIN на датасете ClinTox через TorchDrug Engine
- Помоги настроить генерацию молекул с помощью GraphAF на ZINC250k
- Проверь совместимость версий PyTorch и torch-scatter для TorchDrug 0.2.1
Как установить torchdrug
1Через Skills CLI (Vercel)
npx skills add K-Dense-AI/scientific-agent-skills --skill torchdrug -a claude-code2Вручную: положить файлы
~/.claude/skills/torchdrug/SKILL.mdПапка скилла целиком; для одного проекта — .claude/skills/torchdrug/
1Через Skills CLI (Vercel)
npx skills add K-Dense-AI/scientific-agent-skills --skill torchdrug -a codex2Вручную: положить файлы
.agents/skills/torchdrug/SKILL.mdДля всех проектов — ~/.agents/skills/
1Через Skills CLI (Vercel)
npx skills add K-Dense-AI/scientific-agent-skills --skill torchdrug -a cursor2Вручную: положить файлы
.cursor/skills/torchdrug/SKILL.mdCursor читает и .agents/skills/, и .claude/skills/
1GitHub CLI
gh skill install K-Dense-AI/scientific-agent-skills torchdrug2Вручную: положить файлы
.github/skills/torchdrug/SKILL.md1Через Skills CLI (Vercel)
npx skills add K-Dense-AI/scientific-agent-skills --skill torchdrug -a gemini-cli2Командой платформы
gemini skills install https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills --path skills/torchdrugВручную: положить файлы
.devin/skills/torchdrug/SKILL.mdСтарый путь .windsurf/skills/ тоже читается
Через Skills CLI (Vercel)
npx skills add K-Dense-AI/scientific-agent-skills --skill torchdrug -a opencodeClaude.ai
Упакуйте папку в zip и загрузите в Settings → Capabilities → Skills
Из того же набора120
Весь набор →Похожие
Вопросы о torchdrug
Как установить torchdrug в Claude Code?
Выполните команду npx skills add K-Dense-AI/scientific-agent-skills --skill torchdrug -a claude-code. Файл навыка появится по пути ~/.claude/skills/torchdrug/SKILL.md.
Что делает скилл torchdrug?
Он передаёт агенту правила работы с библиотекой TorchDrug 0.2.1, помогая собирать архитектуры графовых сетей, готовить биологические датасеты и избегать конфликтов зависимостей.
Работает ли TorchDrug 0.2.1 на Apple Silicon с ускорением GPU?
Нет, ускорение MPS не поддерживается. На процессорах Apple Silicon библиотеки torch-scatter и torch-cluster приходится собирать из исходников, а вычисления идут строго на CPU.
