NeVibeCode · 3 316 карточек
Скиллы, плагины, субагенты, слэш-команды и mcp-серверы для Codex
Всё, что ставится в Codex: скиллы, плагины, субагенты, слэш-команды и mcp-серверы. У каждой карточки — команда установки и примеры запросов.
open-gstack-browser скилл Скилл запускает управляемый ИИ браузер Chromium с встроённым расширением GStack sidebar. Нужен, если вам требуется, чтобы агент открывал веб-страницы и взаимодействовал с ними во время работы.
Claude Code Cursor GitHub Copilot
318установок
email-and-password-best-practices скилл Настраивает подтверждение почты, сброс паролей и политики безопасности в Better Auth. Пригодится при сборке входа по логину и паролю.
Claude Code Cursor GitHub Copilot
46 600установок
rowan скилл Запускает облачные расчёты молекулярной динамики, докинга и предсказания pKa через Python API. Помогает моделировать молекулы без локального GPU-кластера.
Claude Code Cursor GitHub Copilot
1 900установок
qutip скилл Скилл помогает моделировать квантовую динамику в QuTiP 5 и проверять физические допущения, размерности и сходимость расчётов.
Claude Code Cursor GitHub Copilot
1 900установок
opentrons-integration скилл Скилл для написания, проверки и отладки протоколов Opentrons Protocol API v2 на Python. Работает с жидкостными манипуляторами Flex и OT-2, помогает настроить деку, пипетки, модули и параметры запуска.
Claude Code Cursor GitHub Copilot
1 900установок
dnanexus-integration скилл Скилл автоматизирует работу с геномной платформой DNAnexus через dx CLI и библиотеку dxpy. Пригодится при сборке апплетов dxapp.json, контроле расходов и импорте пайплайнов Nextflow.
Claude Code Cursor GitHub Copilot
1 900установок
latchbio-integration скилл Скилл, который проводит агента по всей работе с Latch: воркфлоу на Python SDK, упаковка Nextflow и Snakemake, регистрация образа, запуск прогонов.
Claude Code Cursor GitHub Copilot
1 900установок
pyopenms скилл Обрабатывает данные масс-спектрометрии в протеомике и метаболомике через pyOpenMS. Помогает находить сигналы, идентифицировать пептиды и собирать матрицы количественного анализа.
Claude Code Cursor GitHub Copilot
1 900установок
polars-bio скилл Считает геномные интервалы в Polars DataFrame и читает биоинформатические форматы от BED до CRAM. Пригодится, когда пайплайн на Python перерос bedtools.
Claude Code Cursor GitHub Copilot
1 900установок
gtars скилл Скилл для работы с геномными интервалами, перекрытиями, консенсусом и покрытием через Python, Rust и CLI. Требует Python 3.10+ и gtars 0.10.0; локальные инструменты работают без сети.
Claude Code Cursor GitHub Copilot
1 900установок
histolab скилл Помогает подготовить гистологические WSI-снимки: находит ткани через маски, нарезает тайлы и нормализует окрашивание H&E.
Claude Code Cursor GitHub Copilot
1 900установок
qiskit скилл Скилл для разработки квантовых алгоритмов: строит схемы, транспилирует их под конкретное железо, запускает на симуляторах или реальных квантовых процессорах IBM. Нужен Python 3.10+ и опциональные компоненты в зависимости от задачи.
Claude Code Cursor GitHub Copilot
1 900установок
matchms скилл Обрабатывает, фильтрует и сравнивает тандемные масс-спектры MS/MS через библиотеку matchms. Пригодится для сопоставления спектров со справочными библиотеками и расчёта сходства.
Claude Code Cursor GitHub Copilot
1 900установок
usfiscaldata скилл Запрашивает финансовые данные Казначейства США через REST API: долг, отчёты, ставки и аукционы. Пригодится для анализа федеральной статистики без ключа API.
Claude Code Cursor GitHub Copilot
1 900установок
scvelo скилл Запускает анализ РНК-скорости по слоям spliced и unspliced для проверки траекторий дифференцировки клеток. Пригодится в биоинформатических пайплайнах с AnnData и Scanpy.
Claude Code Cursor GitHub Copilot
1 900установок
phylogenetics скилл Скилл для выравнивания последовательностей ДНК и белков, построения филогенетических деревьев с расчётом поддержки ветвей и визуализации результатов. Нужен исследователям в биоинформатике, микробиологии и молекулярной эволюции.
Claude Code Cursor GitHub Copilot
1 900установок
pytdc скилл Скилл помогает искать терапевтические датасеты Therapeutics Data Commons, готовить разбиения и запускать оракулы без лишнего скачивания гигабайтов данных.
Claude Code Cursor GitHub Copilot
1 900установок
geniml скилл Проверяет контракты BED и геномных универсумов, планирует запуски Region2Vec и scEmbed. Нужен перед локальным анализом геномных интервалов.
Claude Code Cursor GitHub Copilot
1 900установок
etetoolkit скилл Работает с готовыми филогенетическими деревьями через библиотеку ETE 4: сравнивает топологии, аннотирует узлы, находит дупликации генов, запрашивает таксономию NCBI и GTDB.
Claude Code Cursor GitHub Copilot
1 900установок
pennylane скилл Помогает строить квантовые схемы в PennyLane 0.45.1, обучать гибридные модели с PyTorch и запускать алгоритмы VQE или QAOA.
Claude Code Cursor GitHub Copilot
1 900установок
labarchive-integration скилл Скилл помогает работать с API LabArchives ELN и Inventory API v1: выбрать региональный адрес, собрать подпись и проверить план запроса.
Claude Code Cursor GitHub Copilot
1 900установок
molfeat скилл Преобразует структуры молекул в отпечатки, дескрипторы и встроенные представления для машинного обучения, поиска по сходству и виртуального скрининга. Нужен Python 3.11+, RDKit и PyTorch.
Claude Code Cursor GitHub Copilot
1 900установок
pathml скилл Скилл помогает настроить пайплайны вычислительной патологии на базе PathML 3.0.8. Он автоматизирует нарезку слайдов на тайлы, сегментацию ткани и сохранение результатов в .h5path.
Claude Code Cursor GitHub Copilot
1 900установок
cobrapy скилл Помогает анализировать метаболические модели через COBRApy: рассчитывать потоки, проверять нокауты генов и состав среды.
Claude Code Cursor GitHub Copilot
1 900установок
depmap скилл Скилл для поиска и анализа данных Cancer Dependency Map (DepMap). Помогает проверять генные зависимости, ко-эссенциальность и чувствительность опухолевых моделей к препаратам PRISM.
Claude Code Cursor GitHub Copilot
1 900установок
diffdock скилл Считает позы связывания малой молекулы с белком через DiffDock и DiffDock-L, от одной пары до батча. Нужен, когда надо получить и разобрать кандидатные позы.
Claude Code Cursor GitHub Copilot
1 900установок
pysam скилл Направляет агента при работе с геномными форматами SAM, BAM, CRAM, VCF и FASTA через библиотеку pysam. Пригодится для чтения выравниваний, фильтрации ридов и расчёта покрытия.
Claude Code Cursor GitHub Copilot
1 900установок
medchem скилл Отбирает соединения по правилам лекарственной пригодности, структурным предупреждениям и сложности. Нужен для фильтрации библиотек молекул.
Claude Code Cursor GitHub Copilot
1 900установок
dhdna-profiler скилл Скилл применяет фреймворк DHDNA для описания паттернов мышления и письма в тексте. Помогает когда нужна рефлексия о стиле рассуждения, профиль когнитивных предпочтений или сравнение текстов по способу аргументации.
Claude Code Cursor GitHub Copilot
1 900установок
neurokit2 скилл Скилл помогает выстраивать воспроизводимую обработку биосигналов в NeuroKit2 0.2.13. Защищает пайплайн от конфликта версий библиотек и ошибок в единицах измерения.
Claude Code Cursor GitHub Copilot
1 900установок
scvi-tools скилл Помогает подбирать и обучать вероятностные модели для данных single-cell omics. Нужен для интеграции партий, аннотации клеток и анализа мультимодальных измерений.
Claude Code Cursor GitHub Copilot
1 900установок
paperzilla скилл Скилл даёт агенту прямой доступ к проектам, рекомендациям и научным статьям в Paperzilla через CLI. Пригодится, если вы ищете релевантные работы, следите за фидом проекта или экспортируете результаты.
Claude Code Cursor GitHub Copilot
1 900установок
zarr-python скилл Помогает организовать хранение и выборку многомерных массивов в Zarr-Python 3. Пригодится при настройке чанков, шардинга и чтения данных из облачных хранилищ.
Claude Code Cursor GitHub Copilot
1 900установок
esm скилл Скилл для Python-SDK esm от Biohub: генерация белковых последовательностей в ESM3, эмбеддинги ESMC и предсказание структуры ESMFold2 — локально или через хостед-клиент.
Claude Code Cursor GitHub Copilot
1 900установок
torchdrug скилл Помогает настроить пайплайны TorchDrug 0.2.1 для графов молекул и белков. Пригодится при сборке моделей прогнозирования свойств, генерации молекул и поиске ретросинтеза.
Claude Code Cursor GitHub Copilot
1 900установок
pymatgen скилл Анализирует и преобразует структуры материалов и расчётные данные через pymatgen. Нужен для фазовых диаграмм, симметрии, файлов электронных расчётов и запросов к Materials Project.
Claude Code Cursor GitHub Copilot
1 900установок
imaging-data-commons скилл Скилл для поиска и загрузки открытых данных медицинских изображений из репозитория NCI Imaging Data Commons. Работает с DICOM, КТ, МР, ПЭТ и цифровой патологией без аутентификации для базовых операций.
Claude Code Cursor GitHub Copilot
1 900установок
fluidsim скилл Помогает настраивать, валидировать и перезапускать гидродинамические симуляции во FluidSim с проверкой сходимости и ресурсов перед запуском на HPC.
Claude Code Cursor GitHub Copilot
1 900установок
molecular-dynamics скилл Собирает систему для молекулярной динамики в OpenMM, гоняет минимизацию и уравновешивание, а потом считает по траекториям RMSD, RMSF и карты контактов через MDAnalysis.
Claude Code Cursor GitHub Copilot
1 900установок
pydeseq2 скилл Скилл для дифференциального анализа экспрессии генов по данным RNA-seq. Выполняет отрицательно-биномиальные GLM с учётом биологических реплик, контрастов и ковариат.
Claude Code Cursor GitHub Copilot
1 900установок
2 281–2 320 из 3 316