Скиллы, плагины, субагенты, слэш-команды и mcp-серверы для задач: ии и ml

diffdock K-Dense-AI скилл Считает позы связывания малой молекулы с белком через DiffDock и DiffDock-L, от одной пары до батча. Нужен, когда надо получить и разобрать кандидатные позы. Claude Code CX Codex Cursor +1 1 900установок dhdna-profiler K-Dense-AI скилл Скилл применяет фреймворк DHDNA для описания паттернов мышления и письма в тексте. Помогает когда нужна рефлексия о стиле рассуждения, профиль когнитивных предпочтений или сравнение текстов по способу аргументации. Claude Code CX Codex Cursor +1 1 900установок scvi-tools K-Dense-AI скилл Помогает подбирать и обучать вероятностные модели для данных single-cell omics. Нужен для интеграции партий, аннотации клеток и анализа мультимодальных измерений. Claude Code CX Codex Cursor +1 1 900установок esm K-Dense-AI скилл Скилл для Python-SDK esm от Biohub: генерация белковых последовательностей в ESM3, эмбеддинги ESMC и предсказание структуры ESMFold2 — локально или через хостед-клиент. Claude Code CX Codex Cursor +1 1 900установок torchdrug K-Dense-AI скилл Помогает настроить пайплайны TorchDrug 0.2.1 для графов молекул и белков. Пригодится при сборке моделей прогнозирования свойств, генерации молекул и поиске ретросинтеза. Claude Code CX Codex Cursor +1 1 900установок imaging-data-commons K-Dense-AI скилл Скилл для поиска и загрузки открытых данных медицинских изображений из репозитория NCI Imaging Data Commons. Работает с DICOM, КТ, МР, ПЭТ и цифровой патологией без аутентификации для базовых операций. Claude Code CX Codex Cursor +1 1 900установок molecular-dynamics K-Dense-AI скилл Собирает систему для молекулярной динамики в OpenMM, гоняет минимизацию и уравновешивание, а потом считает по траекториям RMSD, RMSF и карты контактов через MDAnalysis. Claude Code CX Codex Cursor +1 1 900установок pydeseq2 K-Dense-AI скилл Скилл для дифференциального анализа экспрессии генов по данным RNA-seq. Выполняет отрицательно-биномиальные GLM с учётом биологических реплик, контрастов и ковариат. Claude Code CX Codex Cursor +1 1 900установок arboreto K-Dense-AI скилл Считает кандидатные связи «регулятор — мишень» по данным экспрессии: GRNBoost2 на бустинге, GENIE3 на случайном лесу. Нужен, когда есть таблица генов и список факторов. Claude Code CX Codex Cursor +1 1 900установок vaex K-Dense-AI скилл Скилл для работы с датасетами, которые не влезают в оперативную память. Обрабатывает HDF5, Arrow, CSV и Parquet через виртуальные выражения Vaex, ленивые вычисления и потоковую статистику. Claude Code CX Codex Cursor +1 1 900установок cellxgene-census K-Dense-AI скилл Скилл для программного доступа к CZ CELLxGENE Census — гигантскому каталогу стандартизированных данных по одиночным клеткам. Запрашивайте метаданные, экспрессию генов и эмбеддинги без загрузки целых датасетов. Claude Code CX Codex Cursor +1 1 900установок deepchem K-Dense-AI скилл Настраивает пайплайны хемоинформатики и предсказания свойств молекул в DeepChem 2.8.0. Помогает подготовить SMILES и обучить модели ADMET. Claude Code CX Codex Cursor +1 1 900установок pufferlib K-Dense-AI скилл Скилл для работы с PufferLib: помогает выбрать версию, настроить окружение, валидировать контракт и запустить обучение. Нужна Python 3.10+ и native C/CUDA для полного функционала. Claude Code CX Codex Cursor +1 1 900установок scanpy K-Dense-AI скилл Скилл с готовыми скриптами для полного цикла анализа single-cell RNA-seq: от контроля качества до маркерных генов и визуализации. Пригодится, когда нужно прогнать данные через Scanpy, не собирая пайплайн вручную. Claude Code CX Codex Cursor +1 1 900установок modal K-Dense-AI скилл Помогает писать и запускать Python-нагрузки в Modal: от веб-эндпоинтов до обучения моделей на GPU. Нужен при развёртывании облачных задач через Modal SDK. Claude Code CX Codex Cursor +1 1 900установок anndata K-Dense-AI скилл Скилл для создания, чтения и преобразования аннотированных матриц данных в формате h5ad и Zarr. Интегрируется с экосистемой scverse для анализа транскриптомики и других типов данных с метаданными. Claude Code CX Codex Cursor +1 1 900установок hypogenic K-Dense-AI скилл Скилл для аудита и планирования использования HypoGeniC — инструмента генерации гипотез из размеченных текстовых датасетов с помощью LLM. Нужен, если вы работаете с пакетом hypogenic, его конфигами или бенчмарками HypoBench. Claude Code CX Codex Cursor +1 1 900установок geomaster K-Dense-AI скилл Помогает вести геопространственные исследования: работать со спутниковыми снимками, векторными и растровыми данными, CRS и пространственной статистикой. Claude Code CX Codex Cursor +1 1 900установок stable-baselines3 K-Dense-AI скилл Скилл для обучения агентов с подкреплением на Stable Baselines3. Поддерживает PPO, SAC, DQN и другие алгоритмы, работает с пользовательскими средами Gymnasium и векторизованными окружениями. Claude Code CX Codex Cursor +1 1 900установок research-lookup K-Dense-AI скилл Собирает актуальные научные статьи и ссылки для рукописи или обзора, когда нужно 60+ проверенных источников. Использует параллельный поиск, извлечение данных из PDF и веб-источников, поддерживает глубокий поиск и опциональный Perplexity. Claude Code CX Codex Cursor +1 1 900установок torch-geometric K-Dense-AI скилл Помогает работать с графовыми нейросетями в PyTorch Geometric: готовить графы, выбирать слои и решать задачи классификации. Нужен при работе с torch_geometric. Claude Code CX Codex Cursor +1 1 900установок open-notebook K-Dense-AI скилл Организует исследовательские блокноты с конспектами, поиском и вопросами к документам через локальные или облачные модели. Пригодится при работе с селф-хостед альтернативой NotebookLM. Claude Code CX Codex Cursor +1 1 900установок scikit-survival K-Dense-AI скилл Скилл для scikit-survival 0.28.0: агент собирает и проверяет модели выживаемости на цензурированных данных, от Cox PH до лесов, и считает метрики с поправкой на цензурирование. Claude Code CX Codex Cursor +1 1 900установок business-analyst Seth Hobson субагент Анализирует бизнес-данные, помогает разрабатывать KPI и финансовые модели, а затем формулирует рекомендации. Подойдёт для задач бизнес-аналитики и стратегического анализа. Claude Code CX Codex Cursor 3 855установок ads-microsoft AgriciDaniel скилл Проверяет кампании Microsoft Ads, Bing Ads, UET и аудиторий сети: измерения, конверсии, импорты из Google, ключевые слова, креативы, ставки и бюджеты. Только чтение; изменения делает ads-optimize. Claude Code CX Codex Cursor +1 3 800установок azure-speech-to-text calesthio скилл Транскрибирует аудио в текст через REST API Azure AI Speech с таймкодами слов и разделением по спикерам. Помогает собирать субтитры в пайплайнах OpenMontage без долгой локальной обработки. Claude Code CX Codex Cursor +1 763установок langgraph-persistence langchain-ai скилл Скилл по персистентности LangGraph: как подключить checkpointer, развести диалоги по thread_id и откатиться к прошлому состоянию графа. Claude Code CX Codex Cursor +1 18 000установок langgraph-fundamentals langchain-ai скилл Скилл для написания кода LangGraph на любой платформе. Охватывает StateGraph, схемы состояния, ноды, рёбра, Command, Send, invoke, потоковую передачу и обработку ошибок. Claude Code CX Codex Cursor +1 18 000установок langchain-rag langchain-ai скилл Даёт ИИ-агенту готовые шаблоны и код для сборки RAG-пайплайнов на LangChain в Python и TypeScript: от загрузки документов до векторного поиска. Claude Code CX Codex Cursor +1 17 500установок hugging-science K-Dense-AI скилл Скилл для поиска и оценки научных датасетов, моделей и интерактивных демо через каталог Hugging Science. Пригодится, если нужен ML-ресурс для биологии, химии, геномики, материаловедения, климата или физики. Claude Code CX Codex Cursor +1 1 800установок langchain-fundamentals langchain-ai скилл Помогает писать агентов LangChain через create_agent(), описывать инструменты и добавлять middleware. Пригодится для состояния диалога, подтверждений действий и обработки ошибок. Claude Code CX Codex Cursor +1 17 400установок langgraph-human-in-the-loop langchain-ai скилл Скилл для создания графов с перерывами, ждущих человека. Пригодится, когда нужно показать результат агента, попросить одобрение или валидировать ввод перед продолжением. Claude Code CX Codex Cursor +1 17 200установок data-scientist VoltAgent Community субагент Субагент для разведочного анализа данных, проверки гипотез и обучения моделей машинного обучения прямо в Claude Code. Claude Code 3 342установок mathmodel-figure-templates jihe520 скилл Скилл запускает готовые скрипты на Python и matplotlib для построения научных графиков в песочнице. Помогает собрать диаграммы Тейлора, матрицы корреляций и кривые ROC. Claude Code CX Codex Cursor +1 1 700установок prompt-engineer sickn33 скилл Перерабатывает сырые запросы в структурированные промпты с помощью методологий RTF, RISEN или Chain of Thought. Пригодится, когда задаче не хватает чёткости или контекста. Claude Code CX Codex Cursor +1 1 600установок workflow Vercel Inc. скилл Создаёт надёжные перезапускаемые цепочки задач через Vercel Workflow SDK, когда операциям нужно переживать перезапуски сервиса и ждать внешние события. Claude Code CX Codex Cursor +1 5 300установок mcp-developer https://github.com/Jeffallan скилл Скилл для сборки и отладки MCP-серверов и клиентов на TypeScript или Python: схемы инструментов, транспорт, проверка протокола в инспекторе. Claude Code CX Codex Cursor +1 4 200установок langchain-middleware langchain-ai скилл Скилл добавляет промежуточные хуки для LangChain-агентов: останавливает выполнение перед опасными вызовами инструментов, даёт человеку одобрить, отредактировать или отклонить действие, перехватывает вызовы для логирования и retry-логики. Claude Code CX Codex Cursor +1 16 200установок langfuse langfuse скилл Помогает настроить трейсинг, оценку и промпты в Langfuse прямо из чата с агентом. Пригодится при отладке вызовов моделей и сборе датасетов. Claude Code CX Codex Cursor +1 19 700установок deep-agents-orchestration langchain-ai скилл Скилл помогает настроить оркестрацию в Deep Agents: делегирование субагентам, планирование через список задач и подтверждение действий человеком. Claude Code CX Codex Cursor +1 16 100установок