OpenReadout — MCP-сервер для Claude Code: читает файлы приборов
Читает сырые файлы микроскопов, масс-спектрометров, проточных цитометров, ЯМР и ещё 120+ форматов без софта производителя.
claude mcp add openreadout -- npx -y openreadoutЧто делает OpenReadout
Сервер извлекает метаданные, строит превью, проверяет целостность и экспортирует в открытые форматы. Работает офлайн — не нужны проприетарные драйверы или подписки.
Внутри агента можно спросить про содержимое файла (cells.czi, sample.fcs), попросить извлечь параметры эксперимента или построить график. Сервер распознаёт форматы Leica, Zeiss, BD, Bruker, Agilent, Waters, Thermo и десятков других вендоров.
Без npx в PATH команда не запустится. Поддерживаются Claude Code, Codex, Cursor, GitHub Copilot, Gemini CLI, Cline, Zed и Windsurf.
Какие задачи решает
- прочитать .czi, .lif, .fcs, .d без установки софта производителя
- извлечь метаданные эксперимента из файла прибора
- проверить целостность файла перед анализом
- экспортировать данные в открытый формат
- построить график или превью из сырого файла
Примеры запросов агенту
- Что внутри
experiment.czi? - Извлеки параметры из
sample.fcsи покажи в таблице - Построй график из
nmr_data.dxи сохрани как PNG
Как установить OpenReadout
Командой платформы
claude mcp add openreadout -- npx -y openreadoutКомандой платформы
codex mcp add openreadout -- npx -y openreadoutФайл настроек
{
"mcpServers": {
"openreadout": {
"command": "npx",
"args": [
"-y",
"openreadout"
]
}
}
}Файл настроек
{
"servers": {
"openreadout": {
"type": "stdio",
"command": "npx",
"args": [
"-y",
"openreadout"
]
}
}
}Командой платформы
gemini mcp add openreadout npx -y openreadoutПо шагам, с командами для каждой платформы: Как подключить MCP-сервер: Claude Code, Codex, Cursor, VS Code, Gemini CLI и другие
Вопросы о OpenReadout
Как установить OpenReadout в Claude Code?
Выполни claude mcp add openreadout -- npx -y openreadout в терминале. После этого можно спрашивать агента про файлы приборов.
Что делает OpenReadout?
Читает сырые файлы лабораторных приборов — микроскопов, масс-спектрометров, проточных цитометров, ЯМР — и извлекает метаданные, строит превью, проверяет целостность, экспортирует в открытые форматы. Работает офлайн, поддерживает 120+ форматов.
Какие форматы поддерживает OpenReadout?
Более 120 форматов: Leica LIF, Zeiss CZI, BD FCS, Bruker TopSpin, Agilent .d, Waters RAW, Thermo RAW, Gatan DM3/DM4, Imaris, OIR, MRC, mzML, ABI .ab1/.fsa, SoftMax .pda и многие другие. Полный список — в документации проекта.
