NeVibeCode · 5 карточек
Скиллы и MCP с тегом «scanpy»
single-cell-rna-qc
официальный скилл Проверяет качество single-cell RNA-seq данных, отбирает клетки по MAD-фильтрам и строит графики. Нужен для первичного QC файлов .h5ad и .h5.
Claude Code CX Codex Cursor +1
2 400установок
scvelo скилл Запускает анализ РНК-скорости по слоям spliced и unspliced для проверки траекторий дифференцировки клеток. Пригодится в биоинформатических пайплайнах с AnnData и Scanpy.
Claude Code CX Codex Cursor +1
1 900установок
scvi-tools скилл Помогает подбирать и обучать вероятностные модели для данных single-cell omics. Нужен для интеграции партий, аннотации клеток и анализа мультимодальных измерений.
Claude Code CX Codex Cursor +1
1 900установок
cellxgene-census скилл Скилл для программного доступа к CZ CELLxGENE Census — гигантскому каталогу стандартизированных данных по одиночным клеткам. Запрашивайте метаданные, экспрессию генов и эмбеддинги без загрузки целых датасетов.
Claude Code CX Codex Cursor +1
1 900установок
scanpy скилл Скилл с готовыми скриптами для полного цикла анализа single-cell RNA-seq: от контроля качества до маркерных генов и визуализации. Пригодится, когда нужно прогнать данные через Scanpy, не собирая пайплайн вручную.
Claude Code CX Codex Cursor +1
1 900установок