Скиллы и MCP с тегом «nextflow»

dnanexus-integration K-Dense-AI скилл Скилл автоматизирует работу с геномной платформой DNAnexus через dx CLI и библиотеку dxpy. Пригодится при сборке апплетов dxapp.json, контроле расходов и импорте пайплайнов Nextflow. Claude Code CX Codex Cursor +1 1 900установок latchbio-integration K-Dense-AI скилл Скилл, который проводит агента по всей работе с Latch: воркфлоу на Python SDK, упаковка Nextflow и Snakemake, регистрация образа, запуск прогонов. Claude Code CX Codex Cursor +1 1 900установок nextflow K-Dense-AI скилл Помогает писать, запускать и отлаживать пайплайны Nextflow DSL2 и воркфлоу nf-core. Пригодится при настройке вычислений на SLURM или в облаке. Claude Code CX Codex Cursor +1 1 400установок bulk-rnaseq K-Dense-AI скилл Готовит прочтения bulk RNA-seq и выравнивание в матрицу отсчётов для дифференциальной экспрессии в PyDESeq2. Claude Code CX Codex Cursor +1 1 400установок pacsomatic K-Dense-AI скилл Готовит и запускает прогон nf-core/pacsomatic по схеме «опухоль — норма» на данных PacBio HiFi: собирает samplesheet, артефакты запуска и отправляет драйвер Nextflow в планировщик. Claude Code CX Codex Cursor +1 1 400установок