NeVibeCode · 676 карточек
Скиллы по теме «Наука и исследования»
Скиллы по теме «Наука и исследования»: у каждой карточки — что делает, команда установки и примеры запросов.
tooluniverse-sdk скилл Скилл учит агента работать с Python SDK ToolUniverse: три способа вызова инструментов, пакетные запросы и поиск по базе инструментов.
CX Codex +1
397установок
tooluniverse-chemical-safety скилл Скилл для оценки токсичности химических веществ и лекарств: собирает данные о hazard-классах, ADMET-предсказаниях и связях с генами и болезнями.
CX Codex +1
396установок
tooluniverse-binder-discovery скилл Скилл ведёт агента по фазам поиска малых молекул для белковой мишени: оценка druggability, добыча известных лигандов, расширение по сходству, фильтр ADMET.
CX Codex +1
390установок
tooluniverse-metabolomics-analysis скилл Скилл ведёт анализ метаболомных данных от загрузки пиков до биологических путей. Помогает обрабатывать масс-спектрометрию, убирать батч-эффекты и искать биомаркеры.
CX Codex +1
390установок
tooluniverse-gene-enrichment скилл Скилл запускает анализ обогащения генных наборов через gseapy и clusterProfiler. Пригодится при интерпретации списков дифференциально экспрессированных генов.
CX Codex +1
388установок
tooluniverse-antibody-engineering скилл Ведёт антитело от лабораторного кандидата до клинического: гуманизация последовательности, аффинность, структура, иммуногенность.
CX Codex +1
388установок
tooluniverse-gwas-drug-discovery скилл Скилл связывает локусы GWAS с генами-мишенями, оценивает их пригодность для лекарств и ищет готовые молекулы в ChEMBL и DGIdb.
CX Codex +1
386установок
target-prioritization скилл Скилл собирает досье по списку генов-кандидатов из DE-анализа: тянет данные из UniProt, OpenTargets, PubMed, HPA и ChEMBL и пересортировывает гены по составному баллу.
CX Codex +1
2 900установок
tooluniverse-infectious-disease скилл Скилл анализирует новые патогены и ищет препараты для перепрофилирования через базы NCBI и ChEMBL. Помогает оперативно исследовать терапевтические мишени при вспышках инфекций.
CX Codex +1
381установок
tooluniverse-drug-target-validation скилл Считает Target Validation Score от 0 до 100 по пяти измерениям и выдаёт рекомендацию GO или NO-GO по лекарственной мишени.
CX Codex +1
381установок
tooluniverse-cancer-variant-interpretation скилл Превращает пару «ген + вариант» в отчёт по клинической значимости: уровень доказательности, варианты терапии, механизмы резистентности и подходящие клинические испытания.
CX Codex +1
380установок
tooluniverse-precision-medicine-stratification скилл Разбивает пациентов на группы по ответу на лечение, риску и решению о терапии. Пригодится, когда есть геномные и клинические данные и нужно понять, кому что назначать.
CX Codex +1
375установок
tooluniverse-gwas-snp-interpretation скилл Собирает по одному rsID данные из GWAS Catalog и Open Targets: ассоциации, тонкое картирование, предсказанные гены. Пригодится, когда нужно понять, что делает конкретный SNP.
CX Codex +1
373установок
tooluniverse-crispr-screen-analysis скилл Скилл разбирает данные CRISPR-Cas9 скринов: контроль качества, нормализация, счёт по генам, поиск синтетической летальности и обогащение путей.
CX Codex +1
373установок
tooluniverse-structural-variant-analysis скилл Скилл помогает разбирать структурные варианты и оценивать их клиническую значимость по данным о генах, дозовой чувствительности и клинических свидетельствах.
CX Codex +1
372установок
tooluniverse-variant-analysis скилл Скилл для анализа VCF и вариантов: парсинг, аннотация, классификация, конвертация нотаций и запросы к внешним базам. Пригодится, когда нужно разобрать варианты в проекте.
CX Codex +1
371установок
tooluniverse-adverse-event-detection скилл Ищет сигналы нежелательных реакций на лекарства по отчётам FDA FAERS, инструкциям и статистике PRR, ROR, IC. Считает балл безопасности от 0 до 100.
CX Codex +1
369установок
tooluniverse-phylogenetics скилл Скилл запускает множественное выравнивание, строит филогенетические деревья и рассчитывает метрики качества вроде насыщения и treeness с помощью PhyKIT и Biopython.
CX Codex +1
363установок
tooluniverse-gwas-finemapping скилл Скилл находит причинные генетические варианты в локусах GWAS через доверительные множества и скоринг Open Targets L2G. Помогает связать SNP с генами-мишенями вместо выбора ближайшего гена.
CX Codex +1
362установок
tooluniverse-immunotherapy-response-prediction скилл Скилл считает ICI Response Score по TMB, MSI, PD-L1, HLA и экспрессии иммунных генов, а затем предлагает конкретные препараты и оценивает риск резистентности.
CX Codex +1
360установок
tooluniverse-spatial-omics-analysis скилл Скилл для анализа пространственной омики: связывает списки генов SVGs и контекст ткани с базами данных, путями и терапевтическими мишенями.
CX Codex +1
360установок
tooluniverse-install-skills скилл Проверяет, стоят ли исследовательские скиллы ToolUniverse, и доустанавливает их, если каталогов нет. Пригодится после переезда между клиентами.
CX Codex +1
359установок
tooluniverse-multiomic-disease-characterization скилл Скилл собирает отчёт о болезни по геномике, транскриптомике, протеомике и путям, ищет биомаркеры и мишени для терапии.
CX Codex +1
358установок
tooluniverse-immune-repertoire-analysis скилл Разбирает данные секвенирования TCR и BCR: клонотипы, разнообразие, клональность, поиск специфичности к эпитопам. Нужен при мониторинге иммунного ответа.
CX Codex +1
358установок
tooluniverse-gwas-study-explorer скилл Сравнивает исследования GWAS, вычисляет метаанализ ассоциаций и проверяет воспроизводимость локусов. Скилл запускает расчёты на Python и обращается к GWAS Catalog и Open Targets Genetics.
CX Codex +1
357установок
tooluniverse-metabolomics скилл Скилл для метаболомных исследований: находит метаболиты в HMDB, тянет данные исследований из MetaboLights и Metabolomics Workbench, собирает отчёт.
CX Codex +1
355установок
deep-research скилл Проводит многоисточниковое исследование для решений, где цена ошибки высока. Сохраняет план, источники, выводы и материалы для обновлений.
83установок
tooluniverse-variant-interpretation скилл Скилл ведёт вариант от сырого вызова до классификации по ACMG с рекомендациями. Нужен, когда надо разобрать значимость варианта или оценить некодирующую мутацию.
CX Codex +1
351установок
tooluniverse-polygenic-risk-score скилл Собирает и объясняет полигенные оценки риска по данным GWAS: отбор вариантов, веса, проверка на независимой выборке и разбор результата.
CX Codex +1
348установок
paper-review скилл Скилл проводит трёхэтапный стресс-тест вашего научного черновика перед подачей на конференцию или в журнал.
CX Codex +1
507установок
paper-writing скилл Ведёт академическую статью по 11 шагам: от наброска схемы метода до финальных правок. Пригодится, когда нужно черновик Introduction или Method, а не готовый текст с нуля.
CX Codex +1
504установок
math-teacher скилл Скилл превращает объяснение математики в интерактивные HTML-страницы с графиками, бегунками и игровыми очками. Пригодится для наглядного разбора тем от дробей до интегралов.
CX Codex +1
871установок
tooluniverse-single-cell скилл Скилл для анализа single-cell RNA-seq на scanpy и anndata: загрузка h5ad, QC-фильтрация, кластеризация, аннотация типов клеток.
CX Codex +1
338установок
tavily-search скилл Скилл подключает Tavily API для веб-поиска, обхода сайтов и сбора отчётов прямо в чате с агентом. Пригодится для фактчекинга и парсинга страниц без рекламы.
CX Codex +1
840установок
deep-research скилл Скилл запускает автономные исследования через Google Gemini Deep Research Agent. Подходит для обзора технологий, анализа рынка и конкурентов с готовыми ссылками.
CX Codex +1
672установок
humanize-academic-writing скилл Скилл переписывает черновики по социальным наукам под естественный академический стиль. Инструмент убирает маркеры моделей, когда автор шлифует собственное исследование.
CX Codex +1
2 000установок
research-ideation скилл Скилл выстраивает пайплайн генерации и отбора научных идей: от анализа статей до турнира гипотез и готовой заявки на исследование.
CX Codex +1
483установок
academic-slides скилл Помогает собрать структуру научного доклада, разложить статью на слайды и сгенерировать файл .pptx для защиты или конференции.
CX Codex +1
481установок
deep-research скилл Скилл ведёт исследование темы по нескольким источникам и собирает бриф со ссылками, противоречиями и пробелами. Пригодится перед звонком клиенту или выбором технологии.
CX Codex +1
344установок
paper-rebuttal скилл Скилл помогает структурировать авторский ответ на рецензии научных статей. Он оценивает замечания по их влиянию на итоговый балл и выстраивает стратегию аргументации.
CX Codex +1
441установок
521–560 из 676
