ncbi-clinicaltables-skill — скилл для Codex: поиск генов
Скилл ищет гены человека через Clinical Tables NCBI и возвращает короткие строки для автодополнения. Подходит для поиска, выбора полей и постраничной выдачи.
npx skills add openai/plugins --skill ncbi-clinicaltables-skill -a codexЧто делает ncbi-clinicaltables-skill
Скилл принимает поисковый текст и отправляет запросы к Clinical Tables NCBI через scripts/ncbi_gene_clinicaltables.py. Можно выбрать поля ответа, задать число строк и использовать offset для следующей страницы. По умолчанию агент получает краткое резюме из JSON, а полный JSON возвращается по отдельному запросу.
Для работы нужен Python и файл scripts/ncbi_gene_clinicaltables.py. Входной JSON содержит обязательное поле terms; параметры запроса передаются через params, а большие ответы можно сохранить с помощью save_raw. Для обычных записей Entrez Gene лучше выбрать другой скилл.
Ставьте его, если агенту нужен компактный поиск генов человека. Для полноценных записей Gene он не подходит.
Какие задачи решает
- найти ген человека по символу или ключевому слову
- собрать короткие строки для автодополнения
- выбрать поля GeneID, Symbol и description
- получить следующую страницу результатов через offset
- сохранить полный ответ в файл
Примеры запросов агенту
- Найди TP53 и верни GeneID, Symbol и description.
- Покажи следующую страницу результатов по kinase через offset.
- Верни полный JSON и сохрани его в файл.
Как установить ncbi-clinicaltables-skill
1Через Skills CLI (Vercel)
npx skills add openai/plugins --skill ncbi-clinicaltables-skill -a codex2Вручную: положить файлы
.agents/skills/ncbi-clinicaltables-skill/SKILL.mdДля всех проектов — ~/.agents/skills/
1Через Skills CLI (Vercel)
npx skills add openai/plugins --skill ncbi-clinicaltables-skill -a claude-code2Вручную: положить файлы
~/.claude/skills/ncbi-clinicaltables-skill/SKILL.mdПапка скилла целиком; для одного проекта — .claude/skills/ncbi-clinicaltables-skill/
Вручную: положить файлы
.cursor/skills/ncbi-clinicaltables-skill/SKILL.mdCursor читает и .agents/skills/, и .claude/skills/
1GitHub CLI
gh skill install openai/plugins ncbi-clinicaltables-skill2Вручную: положить файлы
.github/skills/ncbi-clinicaltables-skill/SKILL.mdКомандой платформы
gemini skills install https://github.com/openai/plugins --path plugins/life-science-research/skills/ncbi-clinicaltables-skillВручную: положить файлы
.devin/skills/ncbi-clinicaltables-skill/SKILL.mdСтарый путь .windsurf/skills/ тоже читается
Claude.ai
Упакуйте папку в zip и загрузите в Settings → Capabilities → Skills
Из того же набора201
Весь набор →Похожие
Вопросы о ncbi-clinicaltables-skill
Как установить ncbi-clinicaltables-skill в Codex?
Выполните npx skills add openai/plugins --skill ncbi-clinicaltables-skill, затем подключите файл .agents/skills/ncbi-clinicaltables-skill/SKILL.md.
Что делает ncbi-clinicaltables-skill?
Он выполняет поиск генов человека через Clinical Tables NCBI и возвращает компактные строки с выбранными полями. Результаты можно получать постранично.
Что нужно для работы с ncbi-clinicaltables-skill?
Скиллу нужны Python и scripts/ncbi_gene_clinicaltables.py. Для запроса передайте поле terms, а параметры вроде df, count и offset укажите в params.