hmdb-skill — скилл для Codex: поиск в HMDB
Скилл для поиска метаболитов, белков, болезней и путей в базе HMDB. Отправляет компактные запросы и возвращает краткие сводки результатов.
npx skills add openai/plugins --skill hmdb-skill -a codexЧто делает hmdb-skill
hmdb-skill использует scripts/rest_request.py для всех запросов к HMDB. Для поиска работает endpoint unearth/q с параметрами query, category и format=json. Скилл ограничивает результаты 10 записями через per_page=10 и max_items=10, чтобы ответы были компактными.
Во время работы скилл возвращает markdown-сводки по умолчанию; если нужен полный payload, устанавливаешь флаг save_raw=true. Для долгих разговоров скилл переотправляет запросы вместо кэша старых результатов — это гарантирует свежесть данных из HMDB.
Для установки на Codex используй команду npx skills add openai/plugins --skill hmdb-skill, после этого скилл будет доступен в .agents/skills/hmdb-skill/.
Какие задачи решает
- найти молекулу или метаболит в HMDB по названию
- получить сведения о белке или протеине
- поискать болезнь или заболевание в базе
- исследовать биохимический путь
- вернуть компактную сводку результатов поиска
Примеры запросов агенту
- Найди в HMDB структуру молекулы серотонина
- Покажи связанные с гликолизом пути в HMDB
- Поищи информацию о диабете в HMDB и вернись с кратким отчётом
Как установить hmdb-skill
1Через Skills CLI (Vercel)
npx skills add openai/plugins --skill hmdb-skill -a codex2Вручную: положить файлы
.agents/skills/hmdb-skill/SKILL.mdДля всех проектов — ~/.agents/skills/
1Через Skills CLI (Vercel)
npx skills add openai/plugins --skill hmdb-skill -a claude-code2Вручную: положить файлы
~/.claude/skills/hmdb-skill/SKILL.mdПапка скилла целиком; для одного проекта — .claude/skills/hmdb-skill/
Вручную: положить файлы
.cursor/skills/hmdb-skill/SKILL.mdCursor читает и .agents/skills/, и .claude/skills/
1GitHub CLI
gh skill install openai/plugins hmdb-skill2Вручную: положить файлы
.github/skills/hmdb-skill/SKILL.mdКомандой платформы
gemini skills install https://github.com/openai/plugins --path plugins/life-science-research/skills/hmdb-skillВручную: положить файлы
.devin/skills/hmdb-skill/SKILL.mdСтарый путь .windsurf/skills/ тоже читается
Claude.ai
Упакуйте папку в zip и загрузите в Settings → Capabilities → Skills
Из того же набора201
Весь набор →Похожие
Вопросы о hmdb-skill
Как установить hmdb-skill в Codex?
Выполни npx skills add openai/plugins --skill hmdb-skill. Скилл установится в .agents/skills/hmdb-skill/SKILL.md.
Что делает hmdb-skill?
Отправляет поисковые запросы к базе HMDB для метаболитов, белков, болезней и путей, возвращая компактные markdown-сводки. Каждый поиск ограничен 10 результатами.
Как получить полный ответ вместо сводки?
Установи флаг save_raw=true в параметрах запроса; скилл сохранит полный payload и сообщит путь к файлу.