biostudies-arrayexpress-skill — скилл для Codex: поиск исследований
Скилл отправляет запросы к BioStudies и ArrayExpress по тексту или accession и возвращает краткую сводку. Пригодится, когда нужно найти исследование или получить его данные.
npx skills add openai/plugins --skill biostudies-arrayexpress-skill -a codexЧто делает biostudies-arrayexpress-skill
Скилл обращается к API BioStudies и ArrayExpress через scripts/rest_request.py. Можно искать по свободному тексту через search или ArrayExpress/search, а для получения записи использовать accession в пути studies/<accession>; доступен и путь studies/<accession>/info. По умолчанию агент формирует краткую сводку из ответа скрипта.
Запрос передаётся скрипту как JSON из stdin. В нём задаются base_url и path, а при поиске можно передать параметры страницы и ограничить число результатов. Для полного ответа API скрипт сохраняет данные в файл при save_raw=true и сообщает путь к нему. Это повод проверить, куда будет записан файл, прежде чем запрашивать полный payload.
Какие задачи решает
- найти исследования BioStudies по свободному тексту
- искать записи ArrayExpress по запросу
- получить исследование по accession
- сохранить полный ответ API в файл
Примеры запросов агенту
- Найди в BioStudies исследования по запросу «rna» и кратко опиши результаты.
- Найди в ArrayExpress записи по запросу «single cell».
- Получи исследование E-MTAB-6701 и сохрани полный ответ API в файл.
Как установить biostudies-arrayexpress-skill
1Через Skills CLI (Vercel)
npx skills add openai/plugins --skill biostudies-arrayexpress-skill -a codex2Вручную: положить файлы
.agents/skills/biostudies-arrayexpress-skill/SKILL.mdДля всех проектов — ~/.agents/skills/
1Через Skills CLI (Vercel)
npx skills add openai/plugins --skill biostudies-arrayexpress-skill -a claude-code2Вручную: положить файлы
~/.claude/skills/biostudies-arrayexpress-skill/SKILL.mdПапка скилла целиком; для одного проекта — .claude/skills/biostudies-arrayexpress-skill/
Вручную: положить файлы
.cursor/skills/biostudies-arrayexpress-skill/SKILL.mdCursor читает и .agents/skills/, и .claude/skills/
1GitHub CLI
gh skill install openai/plugins biostudies-arrayexpress-skill2Вручную: положить файлы
.github/skills/biostudies-arrayexpress-skill/SKILL.mdКомандой платформы
gemini skills install https://github.com/openai/plugins --path plugins/life-science-research/skills/biostudies-arrayexpress-skillВручную: положить файлы
.devin/skills/biostudies-arrayexpress-skill/SKILL.mdСтарый путь .windsurf/skills/ тоже читается
Claude.ai
Упакуйте папку в zip и загрузите в Settings → Capabilities → Skills
Из того же набора201
Весь набор →Похожие
Вопросы о biostudies-arrayexpress-skill
Как установить biostudies-arrayexpress-skill в Codex?
Выполните npx skills add openai/plugins --skill biostudies-arrayexpress-skill.
Что делает biostudies-arrayexpress-skill?
Он отправляет запросы к BioStudies и ArrayExpress для поиска по тексту и получения записей по accession, затем выдаёт краткую сводку.
Как получить полный ответ BioStudies?
Попросите сохранить полный ответ API в файл. Для этого скрипт использует save_raw=true и возвращает путь сохранённого файла.