alphafold-skill — скилл для Codex: что делает и как установить
Отправляет запросы к API базы структур AlphaFold для поиска предсказаний и сводок UniProt. Пригодится при анализе белковых структур.
npx skills add openai/plugins --skill alphafold-skill -a codexЧто делает alphafold-skill
Скилл выполняет структурированные запросы к API базы AlphaFold через скрипт scripts/rest_request.py. Инструмент запрашивает данные предсказаний prediction и аннотаций annotations. По умолчанию ответ формируется в виде краткой разметки Markdown, поэтому контекст диалога не засоряется сырыми данными.
Для работы нужен Python и скрипт scripts/rest_request.py. Параметры запроса передаются в формате JSON через стандартный ввод stdin. Если массив записей слишком велик, скрипт ограничивает выборку параметром max_items. При запросе полного ответа утилита сохраняет файл на диск через save_raw=true и возвращает путь к нему.
Скилл пригодится при анализе метаданных белков прямо в коде. Если обращаться к базе AlphaFold не требуется, лучше обойтись без него.
Какие задачи решает
- получить сводку по белку через UniProt
- загрузить предсказание структуры AlphaFold по идентификатору
- запросить аннотации мутаций с ограничением числа записей
- сохранить полный JSON ответа API в локальный файл
Примеры запросов агенту
- Найди предсказание структуры AlphaFold для Q5VSL9
- Покажи сводку UniProt для идентификатора Q5VSL9 через alphafold-skill
- Запроси аннотации MUTAGEN для Q5VSL9 с ограничением в 3 записи
Как установить alphafold-skill
1Через Skills CLI (Vercel)
npx skills add openai/plugins --skill alphafold-skill -a codex2Вручную: положить файлы
.agents/skills/alphafold-skill/SKILL.mdДля всех проектов — ~/.agents/skills/
1Через Skills CLI (Vercel)
npx skills add openai/plugins --skill alphafold-skill -a claude-code2Вручную: положить файлы
~/.claude/skills/alphafold-skill/SKILL.mdПапка скилла целиком; для одного проекта — .claude/skills/alphafold-skill/
Вручную: положить файлы
.cursor/skills/alphafold-skill/SKILL.mdCursor читает и .agents/skills/, и .claude/skills/
1GitHub CLI
gh skill install openai/plugins alphafold-skill2Вручную: положить файлы
.github/skills/alphafold-skill/SKILL.mdКомандой платформы
gemini skills install https://github.com/openai/plugins --path plugins/life-science-research/skills/alphafold-skillВручную: положить файлы
.devin/skills/alphafold-skill/SKILL.mdСтарый путь .windsurf/skills/ тоже читается
Claude.ai
Упакуйте папку в zip и загрузите в Settings → Capabilities → Skills
Из того же набора201
Весь набор →Похожие
Вопросы о alphafold-skill
Как установить alphafold-skill в Codex?
Установите скилл командой npx skills add openai/plugins --skill alphafold-skill -a codex. Конфигурация сохраняется в файле .agents/skills/alphafold-skill/SKILL.md.
Что делает alphafold-skill?
Скилл отправляет запросы к API базы данных AlphaFold через скрипт scripts/rest_request.py. Он извлекает метаданные предсказаний и аннотации белков в компактном виде.
Как получить полный JSON вместо краткой сводки?
Передайте параметр save_raw=true в JSON-запросе к скрипту. Утилита запишет исходные данные в файл и вернет путь к сохраненному результату.