К основному содержанию
MCP-сервер CX Codex

Micro-Manager Microscope — MCP-сервер для Claude Code: установка

MCP-сервер связывает ИИ-агента с микроскопом под управлением Micro-Manager. Через него можно получать изображения, менять положение столика и фокус, настраивать каналы и запускать серии снимков.

Установить в Claude Code · Командой платформы Все способы и платформы ↓
claude mcp add --env LABMCP_ADDRESS=<LABMCP_ADDRESS> --env LABMCP_SIMULATE=<LABMCP_SIMULATE> --env LABMCP_READ_ONLY=<LABMCP_READ_ONLY> --env LABMCP_LIMITS=<LABMCP_LIMITS> --transport stdio micro-manager -- uvx labmcp-micro-manager
Открыть на GitHub

Что делает Micro-Manager Microscope

Сервер использует Micro-Manager MMCore через pymmcore-plus. Агент может читать сведения о микроскопе и его положении, менять экспозицию и конфигурационные группы, управлять затвором, перемещать столик и фокус, запускать автофокус, получать z-stack или интервальную съёмку. Снимки сохраняются в многостраничный TIFF.

Для подключения нужен файл конфигурации Micro-Manager .cfg и совместимые с версией pymmcore библиотеки адаптеров устройств; драйверы и SDK производителя камеры устанавливаются отдельно. Приложение Micro-Manager нужно закрыть перед подключением: устройство нельзя открыть одновременно в двух программах. Проверяйте конфигурацию и ограничения перемещения до команд, которые двигают оборудование.

Сервер проверен на симуляторе и тестовых устройствах pymmcore-plus, но работа на реальном микроскопе ещё не подтверждена. Для пробного запуска можно использовать uvx labmcp-micro-manager --simulate --check; режим --read-only разрешает чтение параметров, но блокирует съёмку и перемещение.

Какие задачи решает

  • снять изображение с камеры микроскопа
  • получить z-stack вокруг текущего фокуса
  • собрать интервальную съёмку и сохранить её в TIFF
  • прочитать положение столика и фокуса
  • переключить канал или объектив через конфигурационную группу

Примеры запросов агенту

  • Проверь подключённый микроскоп и покажи его устройства, положение и ограничения.
  • Сними z-stack вокруг текущего фокуса и сохрани результат в TIFF.
  • Сделай интервальную съёмку в текущем положении и сообщи, как менялась интенсивность.

Как установить Micro-Manager Microscope

Командой платформы

claude mcp add --env LABMCP_ADDRESS=<LABMCP_ADDRESS> --env LABMCP_SIMULATE=<LABMCP_SIMULATE> --env LABMCP_READ_ONLY=<LABMCP_READ_ONLY> --env LABMCP_LIMITS=<LABMCP_LIMITS> --transport stdio micro-manager -- uvx labmcp-micro-manager

Вместо <…> подставьте свои значения. uvx запускает команду с именем пакета; если в README она другая — uvx --from labmcp-micro-manager <команда>

По шагам, с командами для каждой платформы: Как подключить MCP-сервер: Claude Code, Codex, Cursor, VS Code, Gemini CLI и другие

Вопросы о Micro-Manager Microscope

Как установить Micro-Manager Microscope в Claude Code?

Выполните claude mcp add labmcp-micro-manager -- uvx labmcp-micro-manager. Эта команда добавляет MCP-сервер с запуском через uvx.

Что делает Micro-Manager Microscope?

Он даёт агенту доступ к управлению микроскопом через Micro-Manager: чтению состояния, перемещению, настройке экспозиции и получению изображений, включая z-stack и интервальную съёмку.

Проверена ли работа Micro-Manager Microscope на настоящем микроскопе?

Сервер проверяли на симуляторе и тестовых устройствах pymmcore-plus; работа на реальном оборудовании пока не подтверждена.

Похожие MCP-серверы

Всё по теме «Наука и исследования» →
Zotero MCP 54yyyu Подключает библиотеку Zotero к ИИ-агенту: можно искать статьи, читать PDF, добавлять записи и работать с аннотациями. Пригодится для запросов к собственной коллекции исследований. CX Codex +1 ★ 5 585звёзд репо arxiv-mcp-server blazickjp Даёт агенту доступ к статьям arXiv: скачивает исходный LaTeX, читает разделы по отдельности и собирает цитаты прямо на локальном диске. CX Codex +1 ★ 3 235звёзд репо PaperBanana llmsresearch Генерирует научные диаграммы и статистические графики по текстовым описаниям с помощью мультиагентного пайплайна. CX Codex +1 ★ 2 418звёзд репо MATLAB MCP Server matlab Официальный MCP-сервер от MathWorks: агент запускает MATLAB, пишет и выполняет код, проверяет его на стиль и корректность. CX Codex +1 ★ 1 723звёзд репо Hex Research levnikolaevich Ведёт граф исследований: гипотезы, цели, прогоны, качество источников и аудиты. Пригодится, когда нужно не потерять, откуда взялся вывод. CX Codex +1 ★ 584звёзд репо DocsAgent — Zotero, Obsidian & Apple Notes MCP Server docsagent Подключает базы Zotero, хранилища Obsidian и заметки Apple Notes к ИИ-агентам для локального поиска по документам и заметкам. CX Codex +1 ★ 578звёзд репо

Из того же набора15

Ocean Insight Spectrometer MCP-сервер управляет спектрометрами Ocean Insight: снимает спектры и рассчитывает поглощение или пропускание. Подключайте его, когда хотите работать с измерениями через ИИ-агента. CX Codex +1 ★ 23звёзд репо NI-DAQmx DAQ Devices MCP-сервер даёт агенту доступ к платам National Instruments через драйвер NI-DAQmx: замер напряжения и температуры, чтение цифровых линий, запись выходов. CX Codex +1 ★ 23звёзд репо LC-MS Worklist Builder Собирает и проверяет списки образцов для LC-MS, затем сохраняет файлы импорта для ПО приборов. Пригодится, когда нужно подготовить очередь без запуска анализа. CX Codex +1 ★ 23звёзд репо Mass Spectrometry Data (mzML, Bruker TDF, vendor conversion) Даёт агенту доступ к файлам LC-MS: список прогонов, хроматограммы, спектры, поиск MS2 по прекурсору и быстрый QC. CX Codex +1 ★ 23звёзд репо Keithley SourceMeter SMU Даёт агенту управление SourceMeter SMU: задать напряжение или ток с ограничением, снять ВАХ, измерить V и I. Пригодится, когда прибор стоит на столе, а не в руках. CX Codex +1 ★ 23звёзд репо IKA Hotplate & Overhead Stirrer MCP-сервер управляет нагревом и перемешиванием на приборах IKA через команды NAMUR. Он также считывает температуру, скорость и крутящий момент. CX Codex +1 ★ 23звёзд репо EPICS Channel Access Даёт агенту доступ к процессным переменным EPICS: чтение, мониторинг и запись, если её разрешить. Пригодится на ускорителях и лабораторных установках. CX Codex +1 ★ 23звёзд репо BrainFlow Biosensing Boards Сервер подключает ИИ-агента к платам BrainFlow для потоковой передачи и анализа биосигналов. Запустите его с симуляцией или настройте для своей платы. CX Codex +1 ★ 23звёзд репо

Спонсоры проекта

Компании, которые помогают держать аналитику открытой