MDEngine — MCP-сервер для Claude Code: молекулярная динамика
Считает траектории и запускает LAMMPS прямо из агента: 13 инструментов анализа, рендер видео и облачные GPU-запуски.
claude mcp add --transport http mdengine https://api.forcefieldsilicon.com/mcpЧто делает MDEngine
MDEngine — рабочая среда для молекулярной динамики, которую агент вызывает через MCP. Локальный сервер mdengine-mcp работает по stdio и не тянет зависимостей: он читает дампы траекторий, строит профили осаждения, экспортирует кадры в XYZ и запускает LAMMPS отдельным фоновым процессом. Задача переживёт выход сервера и засыпание дисплея, код возврата запишется без вашего участия.
Рендер идёт через Metal: render_video собирает MP4 или GIF с ракурсами камеры, масштабной линейкой и подписями кадров, render_image отдаёт один кадр в PNG — так агент видит состояние системы, а не только числа. Читатели траекторий спокойно берут файл, который симуляция ещё пишет: парсятся только полные кадры, строки с NaN и inf отбрасываются.
Локальные продукты — приложение-вьюер, рендерер и запуск задач на CPU — собраны под macOS. На Windows и Linux рабочий путь один: облачный тариф, те же инструменты через HTTP. Ключ выдаётся вместе с пакетом кредитов, при первом обращении клиент просит войти через OAuth 2.1, и ключ вставляется на странице согласия, а не в чат. Для сборки из исходников нужны macOS 14+ и Xcode command-line tools; LAMMPS (brew install lammps) требуется только для run и submit_lammps.
Какие задачи решает
- посмотреть, что происходит в симуляции, не открывая отдельную программу
- запустить LAMMPS-расчёт и вернуться к нему позже
- собрать MP4 или GIF из траектории для отчёта
- вытащить один кадр в XYZ вместе с зарядами
- проредить траекторию, оставив каждый N-й кадр
Примеры запросов агенту
- Покажи, сколько кадров и атомов в
lj_melt.xyz - Отрендери видео из траектории с облётом камеры
- Запусти
fe_oxidation.inв фоне и покажи хвост лога
Как установить MDEngine
Командой платформы: удалённый сервер
claude mcp add --transport http mdengine https://api.forcefieldsilicon.com/mcpКомандой платформы: удалённый сервер
codex mcp add mdengine --url https://api.forcefieldsilicon.com/mcpФайл настроек
{
"mcpServers": {
"mdengine": {
"url": "https://api.forcefieldsilicon.com/mcp"
}
}
}Файл настроек
{
"servers": {
"mdengine": {
"type": "http",
"url": "https://api.forcefieldsilicon.com/mcp"
}
}
}Командой платформы: удалённый сервер
gemini mcp add -t http mdengine https://api.forcefieldsilicon.com/mcpПо шагам, с командами для каждой платформы: Как подключить MCP-сервер: Claude Code, Codex, Cursor, VS Code, Gemini CLI и другие
Вопросы о MDEngine
Как установить MDEngine в Claude Code?
Добавьте облачный сервер командой claude mcp add --transport http mdengine https://api.forcefieldsilicon.com/mcp, затем введите /mcp, выберите mdengine-cloud и пройдите аутентификацию.
Что делает MDEngine?
Разбирает траектории молекулярной динамики, рендерит кадры и видео и запускает LAMMPS-задачи — синхронно для коротких тестов или фоном для длинных расчётов.
Нужен ли установленный LAMMPS?
Только для run и submit_lammps. Анализ траекторий и рендер работают без него, а в облачном тарифе расчёт идёт на GPU провайдера.
