proteomexchange-skill — скилл для Codex: что делает и как установить
Скилл отправляет компактные PROXI-запросы к ProteomeXchange и возвращает сводки по наборам данных, спектрам и белкам.
npx skills add openai/plugins --skill proteomexchange-skill -a codexЧто делает proteomexchange-skill
Скилл выполняет структурированные запросы к API ProteomeXchange PROXI. Через него агент получает информацию о датасетах, белках, спектрах и примерах USI. Скрипт по умолчанию формирует сжатые сводки в Markdown, поэтому ответы не перегружают контекст модели.
Внутри используется скрипт scripts/rest_request.py, принимающий JSON через стандартный ввод. Для коллекций инструмент советует задавать max_items=10, а для точечного поиска по идентификатору ограничение не требуется. Если нужен весь исходный ответ сервиса, скилл включает флаг save_raw=true и записывает файл по пути raw_output_path. Дополнительных внешних пакетов не требуется. Нужен только Python.
Ставить инструмент стоит тем, кто регулярно исследует протеомные репозитории через Codex. Без работы с ProteomeXchange он не пригодится.
Какие задачи решает
- получить компактную сводку по датасету ProteomeXchange по его номеру
- найти примеры USI и сопоставления спектров с пептидами
- выгрузить полный ответ PROXI API в локальный файл через save_raw
- запросить список библиотек или пептидоформ с лимитом записей
Примеры запросов агенту
- Найди информацию о датасете PXD000001 через PROXI
- Покажи 10 примеров USI из ProteomeXchange
- Запроси данные по спектрам и сохрани полный ответ в файл
Как установить proteomexchange-skill
1Через Skills CLI (Vercel)
npx skills add openai/plugins --skill proteomexchange-skill -a codex2Вручную: положить файлы
.agents/skills/proteomexchange-skill/SKILL.mdДля всех проектов — ~/.agents/skills/
1Через Skills CLI (Vercel)
npx skills add openai/plugins --skill proteomexchange-skill -a claude-code2Вручную: положить файлы
~/.claude/skills/proteomexchange-skill/SKILL.mdПапка скилла целиком; для одного проекта — .claude/skills/proteomexchange-skill/
Вручную: положить файлы
.cursor/skills/proteomexchange-skill/SKILL.mdCursor читает и .agents/skills/, и .claude/skills/
1GitHub CLI
gh skill install openai/plugins proteomexchange-skill2Вручную: положить файлы
.github/skills/proteomexchange-skill/SKILL.mdКомандой платформы
gemini skills install https://github.com/openai/plugins --path plugins/life-science-research/skills/proteomexchange-skillВручную: положить файлы
.devin/skills/proteomexchange-skill/SKILL.mdСтарый путь .windsurf/skills/ тоже читается
Claude.ai
Упакуйте папку в zip и загрузите в Settings → Capabilities → Skills
Из того же набора201
Весь набор →Похожие
Вопросы о proteomexchange-skill
Как установить proteomexchange-skill в Codex?
Выполните команду npx skills add openai/plugins --skill proteomexchange-skill. После этого скилл появится в рабочей среде Codex.
Что делает proteomexchange-skill?
Он запрашивает данные ProteomeXchange PROXI и возвращает краткие сводки по датасетам, спектрам и белкам.
Что требуется для запуска rest_request.py?
Для работы нужен только стандартный Python. Дополнительные сторонние библиотеки ставить не требуется.