К основному содержанию
affpapa.org
RU EN
скилл CX Codex GP ChatGPT официальный · OpenAI

ncbi-entrez-skill — скилл для Codex: установка и возможности

Скилл отправляет запросы к NCBI Entrez для поиска и получения данных PubMed, Gene, Protein, Nucleotide, PMC и GEO. Подойдёт для точечных биомедицинских запросов.

Установить в Codex · Через Skills CLI (Vercel) Все способы и платформы ↓ 
npx skills add openai/plugins --skill ncbi-entrez-skill -a codex
Открыть на GitHub

Что делает ncbi-entrez-skill

ncbi-entrez-skill работает с NCBI Entrez E-Utilities через скрипт scripts/ncbi_entrez.py. Он поддерживает эндпоинты esearch, esummary, efetch, elink и einfo, а также базы PubMed, Gene, Protein, Nucleotide и PMC. Для GEO используются gds и geoprofiles.

По умолчанию скилл возвращает краткое markdown-резюме, записи или сокращённый фрагмент ответа. Для полного JSON или XML нужно явно запросить save_raw=true; тогда скрипт сохраняет результат по пути из raw_output_path. В выдаче PMID и DOI оформляются ссылками.

Ставьте его, если агенту нужны адресные Entrez-поиски, сводки, загрузка записей или связи между базами. Для BLAST, PMC Open Access и NCBI Datasets v2 нужны отдельные скиллы.

Какие задачи решает

  • искать статьи в PubMed по запросу
  • получать сводки по генам и белкам
  • загружать записи Nucleotide или Protein
  • находить метаданные GEO
  • связывать записи между базами NCBI

Примеры запросов агенту

  • Найди в PubMed статьи по запросу KRAS AND colorectal cancer и дай краткую сводку.
  • Получи сводку Gene для TP53 с помощью `esummary`.
  • Найди связи записи GEO с PubMed через `elink`.

Как установить ncbi-entrez-skill

1Через Skills CLI (Vercel)

npx skills add openai/plugins --skill ncbi-entrez-skill -a codex

2Вручную: положить файлы

.agents/skills/ncbi-entrez-skill/SKILL.md

Для всех проектов — ~/.agents/skills/

Из того же набора201

Весь набор →
supabase официальный supabase Скилл помогает настраивать базу данных, аутентификацию и RLS в Supabase без скрытых дыр в безопасности. CX Codex GP ChatGPT 8установок remotion-render официальный Remotion Экспортирует видео и отдельные кадры из проектов Remotion через консольные команды. CX Codex GP ChatGPT 3установок figma-create-new-file официальный Figma Создаёт пустые файлы Figma, FigJam или Slides в черновиках нужной команды. Скилл готовит параметры и planKey перед запуском MCP-инструментов. CX Codex GP ChatGPT 6установок swiftui-performance-audit официальный OpenAI Находит причины просадок кадров, долгого рендеринга и утечек памяти в SwiftUI. Помогает разобрать код вьюшек или подготовить замеры для профилирования. CX Codex GP ChatGPT 109установок swiftui-liquid-glass официальный OpenAI Скилл помогает создавать и проверять интерфейсы SwiftUI с Liquid Glass для iOS 26+. Он нужен при внедрении эффекта, ревью и проверке fallback-сценариев. CX Codex GP ChatGPT 121установок swiftui-ui-patterns официальный OpenAI Скилл помогает собирать и рефакторить SwiftUI-интерфейсы: навигацию, состояние, компоновку и контролы. Подойдёт для новых экранов и правок существующего проекта. CX Codex GP ChatGPT 114установок swiftui-view-refactor официальный OpenAI Скилл наводит порядок в коде SwiftUI: делит разросшиеся экраны на отдельные структуры View и выносит побочные эффекты из body. CX Codex GP ChatGPT 113установок ios-memgraph-leaks официальный OpenAI Скилл захватывает и разбирает утечки памяти iOS из симулятора или .memgraph. Нужен для поиска удерживающих связей и проверки исправлений. CX Codex GP ChatGPT 1 054установок

Похожие

linkedin-analytics Alireza Rezvani Скилл для честного анализа личного экспорта постов в LinkedIn без ложных выводов на малых выборках. Считает медианы и отсекает случайный шум. Claude Code 17установок xlsx официальный anthropics Работает с табличными файлами: создаёт, читает, правит и преобразует книги. Подходит, когда итогом должен стать файл Excel или другой табличный формат. Claude Code Claude.ai 187 223установок google-agents-cli-observability официальный Google Помогает настроить трассировку и сбор данных о работе ИИ-агентов, включая агентов на ADK. Пригодится, когда нужно разбирать выполнение запросов или наблюдать за агентом после развёртывания. Claude Code CX Codex Cursor +1 509 900установок caveman-evidence-review JuliusBrussee Скилл читает данные Caveman Cloud о расходах LLM, трассах и маршрутизации. Подходит для проверки того, куда уходит бюджет проекта. Claude Code CX Codex Cursor +1 103 500установок migration JuliusBrussee Скилл задаёт правила безопасных миграций схем, данных и API с обязательным откатом. Пригодится при изменениях, где нельзя терять данные или ломать совместимость. Claude Code CX Codex Cursor +1 102 900установок performance-optimization addyosmani Скилл для агентов ИИ-кодинга: сначала замеряет, потом чинит узкое место — от Core Web Vitals до N+1 запросов и индексов в базе. Claude Code CX Codex Cursor +1 64 500установок

Вопросы о ncbi-entrez-skill

Как установить ncbi-entrez-skill в Codex?

Выполните npx skills add openai/plugins --skill ncbi-entrez-skill, затем файл скилла будет доступен по пути .agents/skills/ncbi-entrez-skill/SKILL.md.

Что делает ncbi-entrez-skill?

Он отправляет компактные запросы к NCBI Entrez E-Utilities для поиска, получения сводок, загрузки записей и связей между базами.

Можно ли получить полный JSON или XML?

Да. Нужно запросить save_raw=true и указать raw_output_path, если нужен конкретный путь сохранения.

Смотрите также

Спонсоры проекта

Компании, которые помогают держать аналитику открытой
Золотой спонсор AI-аналитика спроса на iGaming — индекс, тренды, конкуренты
Nutra.Club Закрытое сообщество Nutra-вертикали от команды M1

Показы, клики и копирования кода — открытая статистика. Мы держим цифры публичными по той же логике, что и сам NeBlask. Стать спонсором