gwas-catalog-skill — скилл для Codex: что делает и как установить
Скилл отправляет компактные запросы к GWAS Catalog REST API v2 и возвращает сводки по геномным исследованиям. Подойдёт для точечных запросов по биомедицинским данным.
npx skills add openai/plugins --skill gwas-catalog-skill -a codexЧто делает gwas-catalog-skill
gwas-catalog-skill работает с разделами GWAS Catalog REST API v2: исследованиями, ассоциациями, SNP, EFO-признаками, генами, публикациями, локусами и метаданными. Агент может искать записи по признаку или гену и получать краткий результат вместо полного ответа API.
Внутри есть скрипт scripts/rest_request.py, через который проходят все API-запросы. Он принимает JSON со значениями base_url и path, а также параметры фильтрации, путь к списку записей и лимит элементов. Для работы нужен Python и доступ к GWAS Catalog API v2.
Ставить стоит тем, кому нужны краткие сводки GWAS Catalog в Codex или ChatGPT. Если нужен полный HATEOAS-ответ и ссылки пагинации, придётся использовать save_raw=true.
Какие задачи решает
- найти исследования по EFO-признаку
- отобрать ассоциации для гена
- получить сведения о SNP и локусах
- собрать данные о публикациях GWAS
- запросить метаданные каталога
Примеры запросов агенту
- Найди в GWAS Catalog исследования по признаку asthma и дай краткую сводку.
- Покажи ассоциации для гена BRCA1, используя компактный ответ.
- Получи метаданные GWAS Catalog через `scripts/rest_request.py`.
Как установить gwas-catalog-skill
1Через Skills CLI (Vercel)
npx skills add openai/plugins --skill gwas-catalog-skill -a codex2Вручную: положить файлы
.agents/skills/gwas-catalog-skill/SKILL.mdДля всех проектов — ~/.agents/skills/
1Через Skills CLI (Vercel)
npx skills add openai/plugins --skill gwas-catalog-skill -a claude-code2Вручную: положить файлы
~/.claude/skills/gwas-catalog-skill/SKILL.mdПапка скилла целиком; для одного проекта — .claude/skills/gwas-catalog-skill/
Вручную: положить файлы
.cursor/skills/gwas-catalog-skill/SKILL.mdCursor читает и .agents/skills/, и .claude/skills/
1GitHub CLI
gh skill install openai/plugins gwas-catalog-skill2Вручную: положить файлы
.github/skills/gwas-catalog-skill/SKILL.mdКомандой платформы
gemini skills install https://github.com/openai/plugins --path plugins/life-science-research/skills/gwas-catalog-skillВручную: положить файлы
.devin/skills/gwas-catalog-skill/SKILL.mdСтарый путь .windsurf/skills/ тоже читается
Claude.ai
Упакуйте папку в zip и загрузите в Settings → Capabilities → Skills
Из того же набора201
Весь набор →Похожие
Вопросы о gwas-catalog-skill
Как установить gwas-catalog-skill в Codex?
Выполните npx skills add openai/plugins --skill gwas-catalog-skill или npx skills add openai/plugins --skill gwas-catalog-skill -a codex. Файл скилла появится по пути .agents/skills/gwas-catalog-skill/SKILL.md.
Что делает gwas-catalog-skill?
Он отправляет запросы к GWAS Catalog REST API v2 и формирует краткие сводки по исследованиям, ассоциациям, SNP, признакам EFO, генам, публикациям, локусам и метаданным.
Что нужно для работы gwas-catalog-skill?
Нужен Python для запуска scripts/rest_request.py и доступ к GWAS Catalog REST API v2. Для полного HATEOAS-ответа используется параметр save_raw=true.