gnomad-graphql-skill — скилл для Codex: запросы и установка
Скилл отправляет к gnomAD GraphQL точечные запросы о частотах вариантов, ограничениях генов и контексте транскриптов. Нужен для коротких сводок.
npx skills add openai/plugins --skill gnomad-graphql-skill -a codexЧто делает gnomad-graphql-skill
Скилл использует scripts/gnomad_graphql.py для запросов к gnomAD GraphQL. На вход он получает один JSON-объект с query или query_path; при необходимости можно передать variables, max_items, max_depth, timeout_sec и параметры сохранения исходного ответа.
По умолчанию агент получает краткую сводку из JSON скрипта. Для частот вариантов, ограничений генов и контекста транскриптов лучше задавать узкие запросы и ограничивать вложенные результаты. Длинные документы можно вынести в файл через query_path.
Полный ответ сохраняется при save_raw=true, а путь к нему возвращается в raw_output_path. Скрипт также сообщает ошибки вроде invalid_json, network_error и graphql_error, поэтому это повод проверить формат запроса и доступ к gnomAD, если обращение не прошло.
Какие задачи решает
- получить частоту варианта из gnomAD
- проверить ограничения конкретного гена
- собрать контекст последствий транскрипта
- сформировать короткую сводку GraphQL-ответа
- сохранить полный ответ в файл
Примеры запросов агенту
- Запроси частоту варианта `1-55516888-G-GA` в наборе `gnomad_r4` и дай короткую сводку.
- Проверь ограничения гена через gnomAD GraphQL, используя узкий запрос в `query_path`.
- Повтори запрос к gnomAD и сохрани полный JSON через `save_raw=true`.
Как установить gnomad-graphql-skill
1Через Skills CLI (Vercel)
npx skills add openai/plugins --skill gnomad-graphql-skill -a codex2Вручную: положить файлы
.agents/skills/gnomad-graphql-skill/SKILL.mdДля всех проектов — ~/.agents/skills/
1Через Skills CLI (Vercel)
npx skills add openai/plugins --skill gnomad-graphql-skill -a claude-code2Вручную: положить файлы
~/.claude/skills/gnomad-graphql-skill/SKILL.mdПапка скилла целиком; для одного проекта — .claude/skills/gnomad-graphql-skill/
Вручную: положить файлы
.cursor/skills/gnomad-graphql-skill/SKILL.mdCursor читает и .agents/skills/, и .claude/skills/
1GitHub CLI
gh skill install openai/plugins gnomad-graphql-skill2Вручную: положить файлы
.github/skills/gnomad-graphql-skill/SKILL.mdКомандой платформы
gemini skills install https://github.com/openai/plugins --path plugins/life-science-research/skills/gnomad-graphql-skillВручную: положить файлы
.devin/skills/gnomad-graphql-skill/SKILL.mdСтарый путь .windsurf/skills/ тоже читается
Claude.ai
Упакуйте папку в zip и загрузите в Settings → Capabilities → Skills
Из того же набора201
Весь набор →Похожие
Вопросы о gnomad-graphql-skill
Как установить gnomad-graphql-skill в Codex?
Выполните npx skills add openai/plugins --skill gnomad-graphql-skill, затем npx skills add openai/plugins --skill gnomad-graphql-skill -a codex. После установки файл доступен по пути .agents/skills/gnomad-graphql-skill/SKILL.md.
Что делает gnomad-graphql-skill?
Он отправляет компактные GraphQL-запросы к gnomAD для анализа частот вариантов, ограничений генов и контекста транскриптов, затем возвращает краткую сводку или полный JSON по запросу.
Что нужно передать скрипту для работы?
На вход нужен JSON с полем query или query_path. Для параметризованных запросов можно добавить variables, а save_raw=true сохраняет полный ответ и возвращает путь к файлу.
