encode-skill — скилл для Codex: что делает и как установить
Отправляет запросы к REST API проекта ENCODE для поиска биообразцов, экспериментов и получения метаданных. Пригодится при исследовании геномных данных.
npx skills add openai/plugins --skill encode-skill -a codexЧто делает encode-skill
Скилл взаимодействует с API портала ENCODE через локальный скрипт scripts/rest_request.py. Он принимает JSON на стандартный ввод и запрашивает карточки объектов или результаты поиска по каталогу. Ответ по умолчанию преобразуется в компактную сводку Markdown, чтобы не перегружать контекст модели.
Для работы требуется Python для запуска вспомогательного скрипта. При запросах к поисковым эндпоинтам задаются лимиты выборки, а если нужны полные сырые данные, включается флаг save_raw=true с сохранением в отдельный файл.
Этот инструмент пригодится исследователям, которым нужны точные метаданные экспериментов вроде RNA-seq без ручной сборки HTTP-запросов. Если прямой доступ к геномным базам не требуется, ставить его нет смысла.
Какие задачи решает
- найти эксперименты RNA-seq по каталогу ENCODE
- получить метаданные конкретного биообразца по его номеру
- сохранить полный сырой ответ API в локальный файл
Примеры запросов агенту
- Найди последние 10 экспериментов RNA-seq в ENCODE
- Запроси метаданные биообразца ENCBS000AAA через API ENCODE
Как установить encode-skill
1Через Skills CLI (Vercel)
npx skills add openai/plugins --skill encode-skill -a codex2Вручную: положить файлы
.agents/skills/encode-skill/SKILL.mdДля всех проектов — ~/.agents/skills/
1Через Skills CLI (Vercel)
npx skills add openai/plugins --skill encode-skill -a claude-code2Вручную: положить файлы
~/.claude/skills/encode-skill/SKILL.mdПапка скилла целиком; для одного проекта — .claude/skills/encode-skill/
Вручную: положить файлы
.cursor/skills/encode-skill/SKILL.mdCursor читает и .agents/skills/, и .claude/skills/
1GitHub CLI
gh skill install openai/plugins encode-skill2Вручную: положить файлы
.github/skills/encode-skill/SKILL.mdКомандой платформы
gemini skills install https://github.com/openai/plugins --path plugins/life-science-research/skills/encode-skillВручную: положить файлы
.devin/skills/encode-skill/SKILL.mdСтарый путь .windsurf/skills/ тоже читается
Claude.ai
Упакуйте папку в zip и загрузите в Settings → Capabilities → Skills
Из того же набора201
Весь набор →Похожие
Вопросы о encode-skill
Как установить encode-skill в Codex?
Выполните команду npx skills add openai/plugins --skill encode-skill в терминале проекта.
Что делает encode-skill?
Он передаёт параметры в скрипт scripts/rest_request.py и запрашивает данные об экспериментах или биообразцах из базы ENCODE.
Что нужно подготовить перед запуском запросов?
Потребуется интерпретатор Python для исполнения скрипта scripts/rest_request.py. Дополнительные внешние библиотеки скилл не запрашивает.