К основному содержанию
affpapa.org
RU EN
скилл CX Codex GP ChatGPT официальный · OpenAI

clinvar-variation-skill — скилл для Codex: что делает и как установить

Запрашивает данные ClinVar Clinical Tables и NCBI Variation для поиска генетических вариантов и идентификаторов.

Установить в Codex · Через Skills CLI (Vercel) Все способы и платформы ↓ 
npx skills add openai/plugins --skill clinvar-variation-skill -a codex
Открыть на GitHub

Что делает clinvar-variation-skill

Скилл отправляет запросы к Clinical Tables и объектам NCBI Variation через скрипт scripts/clinvar_variation.py. Он находит сводки по вариантам и сопоставляет идентификаторы. Ответ форматируется в Markdown.

Внутри работает Python-скрипт, принимающий JSON через стандартный ввод. Для клинических таблиц используется действие search. Записи вариаций запрашиваются через vcv, rcv, scv и refsnp. Если в чат нужен полный JSON, флаг save_raw=true сохраняет его в файл и сообщает путь на диске.

Этот инструмент нужен исследователям, которые регулярно запрашивают данные ClinVar в диалоге с агентом. Не работаете с генетическими базами NCBI? Тогда ставить его не стоит.

Какие задачи решает

  • найти сводку по варианту через идентификатор VCV или RCV
  • сопоставить идентификаторы записей ClinVar и RefSNP
  • выгрузить сырой ответ NCBI в файл вместо вывода в чат
  • получить компактную таблицу данных Clinical Tables

Примеры запросов агенту

  • Найди информацию по варианту VCV000013080
  • Сделай поиск по терминам в ClinVar и сохрани сырой ответ в файл
  • Покажи сводку по записи SCV через NCBI Variation

Как установить clinvar-variation-skill

1Через Skills CLI (Vercel)

npx skills add openai/plugins --skill clinvar-variation-skill -a codex

2Вручную: положить файлы

.agents/skills/clinvar-variation-skill/SKILL.md

Для всех проектов — ~/.agents/skills/

Из того же набора201

Весь набор →
supabase официальный supabase Скилл помогает настраивать базу данных, аутентификацию и RLS в Supabase без скрытых дыр в безопасности. CX Codex GP ChatGPT 8установок remotion-render официальный Remotion Экспортирует видео и отдельные кадры из проектов Remotion через консольные команды. CX Codex GP ChatGPT 3установок figma-create-new-file официальный Figma Создаёт пустые файлы Figma, FigJam или Slides в черновиках нужной команды. Скилл готовит параметры и planKey перед запуском MCP-инструментов. CX Codex GP ChatGPT 6установок swiftui-performance-audit официальный OpenAI Находит причины просадок кадров, долгого рендеринга и утечек памяти в SwiftUI. Помогает разобрать код вьюшек или подготовить замеры для профилирования. CX Codex GP ChatGPT 109установок swiftui-liquid-glass официальный OpenAI Скилл помогает создавать и проверять интерфейсы SwiftUI с Liquid Glass для iOS 26+. Он нужен при внедрении эффекта, ревью и проверке fallback-сценариев. CX Codex GP ChatGPT 121установок swiftui-ui-patterns официальный OpenAI Скилл помогает собирать и рефакторить SwiftUI-интерфейсы: навигацию, состояние, компоновку и контролы. Подойдёт для новых экранов и правок существующего проекта. CX Codex GP ChatGPT 114установок swiftui-view-refactor официальный OpenAI Скилл наводит порядок в коде SwiftUI: делит разросшиеся экраны на отдельные структуры View и выносит побочные эффекты из body. CX Codex GP ChatGPT 113установок ios-memgraph-leaks официальный OpenAI Скилл захватывает и разбирает утечки памяти iOS из симулятора или .memgraph. Нужен для поиска удерживающих связей и проверки исправлений. CX Codex GP ChatGPT 1 054установок

Похожие

kql microsoft Скилл помогает писать, отлаживать и проверять KQL-запросы. Пригодится для ADX, Log Analytics, Sentinel и других сервисов Microsoft. Claude Code GitHub Copilot 58установок xlsx официальный anthropics Работает с табличными файлами: создаёт, читает, правит и преобразует книги. Подходит, когда итогом должен стать файл Excel или другой табличный формат. Claude Code Claude.ai 187 223установок google-agents-cli-observability официальный Google Помогает настроить трассировку и сбор данных о работе ИИ-агентов, включая агентов на ADK. Пригодится, когда нужно разбирать выполнение запросов или наблюдать за агентом после развёртывания. Claude Code CX Codex Cursor +1 509 900установок caveman-evidence-review JuliusBrussee Скилл читает данные Caveman Cloud о расходах LLM, трассах и маршрутизации. Подходит для проверки того, куда уходит бюджет проекта. Claude Code CX Codex Cursor +1 103 500установок migration JuliusBrussee Скилл задаёт правила безопасных миграций схем, данных и API с обязательным откатом. Пригодится при изменениях, где нельзя терять данные или ломать совместимость. Claude Code CX Codex Cursor +1 102 900установок performance-optimization addyosmani Скилл для агентов ИИ-кодинга: сначала замеряет, потом чинит узкое место — от Core Web Vitals до N+1 запросов и индексов в базе. Claude Code CX Codex Cursor +1 64 500установок

Вопросы о clinvar-variation-skill

Как установить clinvar-variation-skill в Codex?

Выполните команду npx skills add openai/plugins --skill clinvar-variation-skill в терминале проекта.

Что делает clinvar-variation-skill?

Он обращается к базам ClinVar и NCBI Variation, возвращая сжатые сводки по мутациям и сопоставленным идентификаторам.

Что требуется для запуска скрипта?

Нужен установленный Python, так как запросы обрабатываются локальным файлом scripts/clinvar_variation.py.

Смотрите также

Спонсоры проекта

Компании, которые помогают держать аналитику открытой
Золотой спонсор AI-аналитика спроса на iGaming — индекс, тренды, конкуренты
Nutra.Club Закрытое сообщество Nutra-вертикали от команды M1

Показы, клики и копирования кода — открытая статистика. Мы держим цифры публичными по той же логике, что и сам NeBlask. Стать спонсором