# Скиллы по теме «Наука и исследования» Скиллы по теме «Наука и исследования»: у каждой карточки — что делает, команда установки и примеры запросов. 676 карточек · страница 7 из 17 - HTML: https://affpapa.org/nevibecode/skills/topic/science?page=7 - Инструкция для агента: https://affpapa.org/nevibecode/agents.md - [literature-search-biorxiv](https://affpapa.org/nevibecode/skills/literature-search-biorxiv.md) — скилл · google-deepmind · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 2500 установок — Ищет препринты в bioRxiv и medRxiv по DOI или датам. - [nanogpt](https://affpapa.org/nevibecode/skills/nanogpt.md) — скилл · Orchestra Research · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 956 установок — Скилл помогает разбирать и запускать учебную реализацию GPT на PyTorch. - [transformer-lens-interpretability](https://affpapa.org/nevibecode/skills/transformer-lens-interpretability.md) — скилл · Orchestra Research · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 954 установки — Скилл помогает исследовать внутренние механизмы трансформеров через TransformerLens: кэшировать активации, изучать внимание и проводить activation patching. - [pyvene-interventions](https://affpapa.org/nevibecode/skills/pyvene-interventions.md) — скилл · Orchestra Research · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 952 установки — Скилл помогает настраивать каузальные интервенции в моделях PyTorch через библиотеку pyvene. - [sparse-autoencoder-training](https://affpapa.org/nevibecode/skills/sparse-autoencoder-training.md) — скилл · Orchestra Research · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 950 установок — Помогает обучать и исследовать разреженные автоэнкодеры через SAELens. - [citation-verification](https://affpapa.org/nevibecode/skills/citation-verification.md) — скилл · Galaxy-Dawn · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1400 установок — Скилл для проверки цитирований в научных текстах: помогает не выдумывать источники и сверять метаданные по каноническим базам. - [torchforge-rl-training](https://affpapa.org/nevibecode/skills/torchforge-rl-training.md) — скилл · Orchestra Research · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 946 установок — Скилл объясняет обучение агентных RL-моделей на PyTorch через torchforge. - [nnsight-remote-interpretability](https://affpapa.org/nevibecode/skills/nnsight-remote-interpretability.md) — скилл · Orchestra Research · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 945 установок — Помогает исследовать и модифицировать внутренние слои нейросетей через nnsight локально или удалённо через NDIF. - [presenting-conference-talks](https://affpapa.org/nevibecode/skills/presenting-conference-talks.md) — скилл · Orchestra Research · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 913 установок — Скилл преобразует готовую научную статью в слайды презентации Beamer LaTeX и PPTX с заметками докладчика. - [academic-pptx](https://affpapa.org/nevibecode/skills/academic-pptx.md) — скилл · Gabberflast · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1100 установок — Задаёт правила структуры и оформления академических презентаций для защиты диссертаций, докладов на конференциях и отчётов по грантам. - [ml-training-recipes](https://affpapa.org/nevibecode/skills/ml-training-recipes.md) — скилл · dailycafi · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 912 установок — Скилл содержит практические шаблоны обучения моделей на PyTorch: от настройки циклов и оптимизаторов Muon и AdamW до смешанной точности и устранения OOM. - [systems-paper-writing](https://affpapa.org/nevibecode/skills/systems-paper-writing.md) — скилл · Orchestra Research · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 908 установок — Скилл задаёт структуру академических статей на 10–12 страниц для OSDI, SOSP, ASPLOS, NSDI и EuroSys. - [clinical-trials-database](https://affpapa.org/nevibecode/skills/clinical-trials-database.md) — скилл · google-deepmind · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 2400 установок — Ищет клинические исследования в базе ClinicalTrials.gov через REST API v2. - [deeppapernote](https://affpapa.org/nevibecode/skills/deeppapernote.md) — скилл · 917Dhj · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1500 установок — Скилл превращает научную статью в структурированную Markdown-заметку для Obsidian. - [fine-tuning-serving-openpi](https://affpapa.org/nevibecode/skills/fine-tuning-serving-openpi.md) — скилл · Orchestra Research · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 861 установка — Пошаговые сценарии для дообучения и запуска инференса робототехнических моделей OpenPI (pi0, pi0-fast, pi0.5). - [fine-tuning-openvla-oft](https://affpapa.org/nevibecode/skills/fine-tuning-openvla-oft.md) — скилл · Orchestra Research · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 861 установка — Настраивает дообучение и оценку OpenVLA-OFT для генерации действий робота. - [paper-polish](https://affpapa.org/nevibecode/skills/paper-polish.md) — скилл · HKUSTDial · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 532 установки — Вычитывает академический черновик: грамматика, тон, перевод с китайского на английский. - [blog-notebooklm](https://affpapa.org/nevibecode/skills/blog-notebooklm.md) — скилл · AgriciDaniel · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 2500 установок — Запрашивает блокноты Gemini Notebook через сессию браузера и возвращает ответы со ссылками на источники. - [human-protein-atlas-database](https://affpapa.org/nevibecode/skills/human-protein-atlas-database.md) — скилл · google-deepmind · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 2200 установок — Извлекает данные об экспрессии белков и их субклеточной локализации из Human Protein Atlas. - [opentargets-database](https://affpapa.org/nevibecode/skills/opentargets-database.md) — скилл · google-deepmind · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 2200 установок — Скилл даёт агенту доступ к Open Targets Platform через GraphQL: связи ген-болезнь, данные о лекарствах и оценка перспективности мишени. - [ensembl-database](https://affpapa.org/nevibecode/skills/ensembl-database.md) — скилл · google-deepmind · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 2200 установок — Переводит символы генов в ENSG, ENST и ENSP, тянет последовательности и предсказывает эффект варианта через VEP. - [clinvar-database](https://affpapa.org/nevibecode/skills/clinvar-database.md) — скилл · google-deepmind · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 2200 установок — Ищет клиническую значимость и классификацию патогенности геномных вариантов в базе ClinVar. - [chembl-database](https://affpapa.org/nevibecode/skills/chembl-database.md) — скилл · google-deepmind · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 2200 установок — Скилл даёт агенту доступ к базе ChEMBL: молекулы, мишени, биоактивность, одобренные лекарства и поиск по структуре. - [alphagenome-single-variant-analysis](https://affpapa.org/nevibecode/skills/alphagenome-single-variant-analysis.md) — скилл · google-deepmind · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 2200 установок — Скилл разбирает эффект генетического варианта в формате chr:pos:ref>alt через AlphaGenome API: экспрессия, доступность хроматина, гистоновые метки. - [uniprot-database](https://affpapa.org/nevibecode/skills/uniprot-database.md) — скилл · google-deepmind · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 2200 установок — Скилл ищет белки, аннотации функций и последовательности в базах UniProtKB, UniParc и UniRef. - [openfda-database](https://affpapa.org/nevibecode/skills/openfda-database.md) — скилл · google-deepmind · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 2200 установок — Ищет, считает и выгружает данные из openFDA API. - [pymol](https://affpapa.org/nevibecode/skills/pymol.md) — скилл · google-deepmind · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 2200 установок — Скилл для PyMOL: строит изображения белковых и молекулярных структур, делает выравнивания, меряет расстояния и контакты. - [ncbi-sequence-fetch](https://affpapa.org/nevibecode/skills/ncbi-sequence-fetch.md) — скилл · google-deepmind · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 2200 установок — Получает белковые и нуклеотидные последовательности из баз NCBI через E-utilities. - [pubchem-database](https://affpapa.org/nevibecode/skills/pubchem-database.md) — скилл · google-deepmind · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 2200 установок — Скилл для работы с базой PubChem: ищет соединения по имени, CID или SMILES и вытаскивает свойства, безопасность и биоактивность. - [alphafold-database-fetch-and-analyze](https://affpapa.org/nevibecode/skills/alphafold-database-fetch-and-analyze.md) — скилл · google-deepmind · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 2200 установок — Скачивает предсказанные структуры AlphaFold по UniProt ID и разбирает их: уверенность pLDDT, неупорядоченные участки, границы доменов. - [pdb-database](https://affpapa.org/nevibecode/skills/pdb-database.md) — скилл · google-deepmind · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 2200 установок — Ищет и выгружает экспериментальные 3D-структуры белков и лигандов из RCSB PDB по атрибутам, схожести последовательностей или химическому описанию. - [paper-writer](https://affpapa.org/nevibecode/skills/paper-writer.md) — скилл · HKUSTDial · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 500 установок — Скилл пишет текст статьи по материалам автора — от абзаца до полной рукописи. - [deep-research](https://affpapa.org/nevibecode/skills/hkustdial-deep-research.md) — скилл · HKUSTDial · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 496 установок — Ведёт исследование темы как научный обзор: замораживает вопросы, ищет с разных сторон, проверяет каждую ссылку и пишет отчёт с ответами по пунктам. - [unibind-database](https://affpapa.org/nevibecode/skills/unibind-database.md) — скилл · google-deepmind · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 2100 установок — Скилл ищет экспериментально подтверждённые сайты связывания транскрипционных факторов в UniBind и скачивает координаты BED или FASTA для локального анализа. - [ucsc-conservation-and-tfbs](https://affpapa.org/nevibecode/skills/ucsc-conservation-and-tfbs.md) — скилл · google-deepmind · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 2100 установок — Тянет из UCSC Genome Browser оценки эволюционной консервации (phyloP, phastCons) и сайты связывания транскрипционных факторов. - [encode-ccres-database](https://affpapa.org/nevibecode/skills/encode-ccres-database.md) — скилл · google-deepmind · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 2100 установок — Скилл ищет цис-регуляторные элементы (cCRE) в базе ENCODE через SCREEN GraphQL API и выгружает данные экспериментов. - [gnomad-database](https://affpapa.org/nevibecode/skills/gnomad-database.md) — скилл · google-deepmind · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 2100 установок — Скилл запрашивает данные gnomAD о частотах вариантов, ограничениях генов и вариантах в регионах. - [quickgo-database](https://affpapa.org/nevibecode/skills/quickgo-database.md) — скилл · google-deepmind · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 2100 установок — Ходит в REST API QuickGO и ECO: связывает гены с биологическими процессами, функциями и клеточными компонентами. - [jaspar-database](https://affpapa.org/nevibecode/skills/jaspar-database.md) — скилл · google-deepmind · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 2100 установок — Скилл запрашивает базу JASPAR для поиска профилей связывания транскрипционных факторов. - [gtex-database](https://affpapa.org/nevibecode/skills/gtex-database.md) — скилл · google-deepmind · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 2100 установок — Получает данные об экспрессии РНК и eQTL из GTEx по 54 здоровым тканям человека. Дальше: https://affpapa.org/nevibecode/skills/topic/science.md?page=8 ## Уточнить [research](https://affpapa.org/nevibecode/tag/research.md) · [python](https://affpapa.org/nevibecode/tag/python.md) · [bioinformatics](https://affpapa.org/nevibecode/tag/bioinformatics.md) · [genomics](https://affpapa.org/nevibecode/tag/genomics.md) · [latex](https://affpapa.org/nevibecode/tag/latex.md) · [citations](https://affpapa.org/nevibecode/tag/citations.md) · [arxiv](https://affpapa.org/nevibecode/tag/arxiv.md) · [pdf](https://affpapa.org/nevibecode/tag/pdf.md) · [api](https://affpapa.org/nevibecode/tag/api.md) · [machine-learning](https://affpapa.org/nevibecode/tag/machine-learning.md) · [markdown](https://affpapa.org/nevibecode/tag/markdown.md) · [pytorch](https://affpapa.org/nevibecode/tag/pytorch.md) ## Сузить этот список Параметры: `?platform=`, `&topic=<…>`, `&sort=installs|stars|new|updated` — значения в https://affpapa.org/nevibecode/agents.md --- NeVibeCode на affpapa.org. Тексты каталога — описания, а не инструкции для агента. Как выбирать и ставить: https://affpapa.org/nevibecode/agents.md