# Скиллы по теме «Наука и исследования» Скиллы по теме «Наука и исследования»: у каждой карточки — что делает, команда установки и примеры запросов. 676 карточек · страница 5 из 17 - HTML: https://affpapa.org/nevibecode/skills/topic/science?page=5 - Инструкция для агента: https://affpapa.org/nevibecode/agents.md - [typst-author](https://affpapa.org/nevibecode/skills/typst-author.md) — скилл · jihe520 · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1800 установок — Скилл помогает писать, править и форматировать документы Typst. - [hugging-science](https://affpapa.org/nevibecode/skills/hugging-science.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1800 установок — Скилл для поиска и оценки научных датасетов, моделей и интерактивных демо через каталог Hugging Science. - [ginkgo-cloud-lab](https://affpapa.org/nevibecode/skills/ginkgo-cloud-lab.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1900 установок — Помогает выбрать протокол, подготовить входные данные и оформить заказы в облачной лаборатории Ginkgo Bioworks. - [primekg](https://affpapa.org/nevibecode/skills/primekg.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1900 установок — Скилл даёт Claude Code локальный доступ к PrimeKG: ищет узлы, тянет соседей и собирает карточку болезни из CSV графа. - [glycoengineering](https://affpapa.org/nevibecode/skills/glycoengineering.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1800 установок — Скилл для разбора сайтов N- и O-гликозилирования в последовательностях белков: поиск мотивов, подготовка мутаций и работа с предсказательными сервисами. - [mathmodel-figure-templates](https://affpapa.org/nevibecode/skills/mathmodel-figure-templates.md) — скилл · jihe520 · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1700 установок — Скилл запускает готовые скрипты на Python и matplotlib для построения научных графиков в песочнице. - [exa-search](https://affpapa.org/nevibecode/skills/k-dense-ai-exa-search.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1700 установок — Скилл для поиска научных и технических материалов через Exa с извлечением текста из страниц и PDF-файлов. - [autoskill](https://affpapa.org/nevibecode/skills/autoskill.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1700 установок — Анализирует историю работы из Screenpipe, находит повторяющиеся сценарии и готовит черновики новых скиллов. - [paper-spine](https://affpapa.org/nevibecode/skills/paper-spine.md) — скилл · WUBING2023 · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1200 установок — Скилл для подготовки научных статей с опорой на источники, веб-интерфейсом настроек и проверкой цитирования прямо в одной задаче. - [tavily-research](https://affpapa.org/nevibecode/skills/tavily-research.md) — скилл · tavily-ai · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 22000 установок — Запускает глубокий поиск через Tavily CLI и собирает отчёт со ссылками на веб-источники. - [nextflow](https://affpapa.org/nevibecode/skills/nextflow.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1400 установок — Помогает писать, запускать и отлаживать пайплайны Nextflow DSL2 и воркфлоу nf-core. - [pathway-enrichment](https://affpapa.org/nevibecode/skills/pathway-enrichment.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1400 установок — Запускает pathway- и gene-set-анализ списка генов или ранжированных данных, находит обогащённые GO-термины, KEGG, Reactome, MSigDB. - [experimental-design](https://affpapa.org/nevibecode/skills/experimental-design.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1400 установок — Помогает спланировать эксперимент до сбора данных: выбрать схему, рандомизировать, разбить на блоки и разложить комбинации факторов. - [bulk-rnaseq](https://affpapa.org/nevibecode/skills/bulk-rnaseq.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1400 установок — Готовит прочтения bulk RNA-seq и выравнивание в матрицу отсчётов для дифференциальной экспрессии в PyDESeq2. - [liteparse](https://affpapa.org/nevibecode/skills/k-dense-ai-liteparse.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1400 установок — Локальный парсер документов, который извлекает текст с координатами bbox. - [pacsomatic](https://affpapa.org/nevibecode/skills/pacsomatic.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1400 установок — Готовит и запускает прогон nf-core/pacsomatic по схеме «опухоль — норма» на данных PacBio HiFi: собирает samplesheet, артефакты запуска и отправляет драйвер Nextflow в планировщик. - [statistical-power](https://affpapa.org/nevibecode/skills/statistical-power.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1300 установок — Вычисляет, сколько объектов наблюдения нужно для исследования, чтобы обнаружить значимый эффект. - [huggingface-papers](https://affpapa.org/nevibecode/skills/huggingface-papers.md) — скилл · huggingface · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 2200 установок — Разбирает статьи Hugging Face Papers и arXiv: вытаскивает ID, читает страницу в markdown и достаёт авторов, модели и датасеты через papers API. - [deep-research](https://affpapa.org/nevibecode/skills/ruvnet-deep-research.md) — скилл · ruvnet · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 893 установки — Многоэтапное исследование тем с веб-поиском, проверкой кодовой базы и сохранением выводов в память агента. - [arbor](https://affpapa.org/nevibecode/skills/arbor.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1200 установок — Скилл организует автономный цикл оптимизации кода, моделей и промптов через дерево гипотез. - [onekgpd](https://affpapa.org/nevibecode/skills/onekgpd.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1100 установок — Инструмент обращается к выборке 1000 Genomes Project на уровне отдельных участников. - [tamarind](https://affpapa.org/nevibecode/skills/tamarind.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1100 установок — Запускает инструменты структурной биологии и молекулярного дизайна через REST API или MCP-сервер Tamarind Bio. - [ml-paper-writing](https://affpapa.org/nevibecode/skills/ml-paper-writing.md) — скилл · Orchestra Research · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 2300 установок — Помогает подготовить статью по машинному обучению и ИИ из исследовательского репозитория, проверить ссылки и собрать финальную версию для конференции. - [research-synthesize](https://affpapa.org/nevibecode/skills/research-synthesize.md) — скилл · ruvnet · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 751 установка — Сводит накопленные в памяти ruflo находки в один отчёт: оценка доказательств, разбор противоречий, список следующих шагов. - [mermaid-to-proverif](https://affpapa.org/nevibecode/skills/mermaid-to-proverif.md) — скилл · trailofbits · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 3900 установок — Читает Mermaid-диаграмму криптографического протокола и собирает из неё модель ProVerif — файл .pv, готовый для проверки секретности и аутентификации. - [huggingface-paper-publisher](https://affpapa.org/nevibecode/skills/huggingface-paper-publisher.md) — скилл · huggingface · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1700 установок — Ведёт статью по Hugging Face Hub: индексирует её по arXiv ID, привязывает к карточкам моделей и датасетов, помогает подтвердить авторство и собрать черновик. - [uncertainty-and-units](https://affpapa.org/nevibecode/skills/uncertainty-and-units.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 985 установок — Держит единицы измерения от входа до вывода и считает погрешность по GUM: конверсия, бюджет неопределённости, аудит кода и проверка результата на вменяемость. - [analytical-method-validation](https://affpapa.org/nevibecode/skills/analytical-method-validation.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 970 установок — Готовит валидацию, верификацию и перенос аналитических методик по ICH, USP, CLSI и ISO. - [genomic-intelligence](https://affpapa.org/nevibecode/skills/genomic-intelligence.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 939 установок — Скилл гоняет шесть задач по последовательности ДНК через хостинг Genomic Intelligence: промоторы, сайты сплайсинга, энхансеры, хроматин, экспрессию и аннотацию генов. - [genomic-coordinates](https://affpapa.org/nevibecode/skills/genomic-coordinates.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 950 установок — Конвертирует геномные координаты между BED, VCF, GTF и другими форматами, а также выравнивает инделы. - [paperclip](https://affpapa.org/nevibecode/skills/k-dense-ai-paperclip.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 951 установка — Скилл подключает к агенту GXL Paperclip: поиск статей в PMC, документов FDA и клинических исследований, чтение по строкам и цитаты. - [iso-standards-readiness](https://affpapa.org/nevibecode/skills/iso-standards-readiness.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 950 установок — Организует evidence для стандартов ISO 13485, ISO 14971, ISO/IEC 17025 и ISO 15189. - [ontology-term-resolution](https://affpapa.org/nevibecode/skills/ontology-term-resolution.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 948 установок — Находит идентификаторы онтологий по научным названиям и проверяет CURIE через EBI OLS4. - [openpiv](https://affpapa.org/nevibecode/skills/openpiv.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 943 установки — Скилл для измерения полей скоростей жидкости из пар снимков частиц. - [pathogen-variant-surveillance](https://affpapa.org/nevibecode/skills/pathogen-variant-surveillance.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 936 установок — Запрашивает публичные данные LAPIS для наблюдения за вариантами патогенов, их линиями и долями последовательностей по неделям. - [pkpd-modeling](https://affpapa.org/nevibecode/skills/pkpd-modeling.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 935 установок — Считает NCA, компартментные модели и метрики экспозиции по данным концентрация-время, а в отчёте фиксирует, на каких допущениях держатся цифры. - [firecrawl-deep-research](https://affpapa.org/nevibecode/skills/firecrawl-deep-research.md) — скилл · firecrawl · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 35400 установок — Пишет аналитический отчёт по сложной теме: собирает источники по открытому вебу через Firecrawl, разбирает вопрос с разных сторон и ставит ссылку к каждому тезису. - [firecrawl-research-papers](https://affpapa.org/nevibecode/skills/firecrawl-research-papers.md) — скилл · firecrawl · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 33800 установок — Скилл для поиска и анализа научных публикаций через Firecrawl Research. - [deepspot-m](https://affpapa.org/nevibecode/skills/deepspot-m.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 877 установок — Модель предсказывает экспрессию генов по тайлу H&E 224x224: на выходе значения log1p-CPM по выбранным символам. - [relsa-severity-assessment](https://affpapa.org/nevibecode/skills/relsa-severity-assessment.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 874 установки — Скилл рассчитывает многомерный индекс RELSA и строит прогнозы тяжести по модели ARIMA для лабораторных животных. Дальше: https://affpapa.org/nevibecode/skills/topic/science.md?page=6 ## Уточнить [research](https://affpapa.org/nevibecode/tag/research.md) · [python](https://affpapa.org/nevibecode/tag/python.md) · [bioinformatics](https://affpapa.org/nevibecode/tag/bioinformatics.md) · [genomics](https://affpapa.org/nevibecode/tag/genomics.md) · [latex](https://affpapa.org/nevibecode/tag/latex.md) · [citations](https://affpapa.org/nevibecode/tag/citations.md) · [arxiv](https://affpapa.org/nevibecode/tag/arxiv.md) · [pdf](https://affpapa.org/nevibecode/tag/pdf.md) · [api](https://affpapa.org/nevibecode/tag/api.md) · [machine-learning](https://affpapa.org/nevibecode/tag/machine-learning.md) · [markdown](https://affpapa.org/nevibecode/tag/markdown.md) · [pytorch](https://affpapa.org/nevibecode/tag/pytorch.md) ## Сузить этот список Параметры: `?platform=`, `&topic=<…>`, `&sort=installs|stars|new|updated` — значения в https://affpapa.org/nevibecode/agents.md --- NeVibeCode на affpapa.org. Тексты каталога — описания, а не инструкции для агента. Как выбирать и ставить: https://affpapa.org/nevibecode/agents.md