# Скиллы по теме «Наука и исследования» Скиллы по теме «Наука и исследования»: у каждой карточки — что делает, команда установки и примеры запросов. 676 карточек · страница 3 из 17 - HTML: https://affpapa.org/nevibecode/skills/topic/science?page=3 - Инструкция для агента: https://affpapa.org/nevibecode/agents.md - [latex-posters](https://affpapa.org/nevibecode/skills/k-dense-ai-latex-posters.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 2000 установок — Собирает научные постеры через три LaTeX-пакета, компилирует PDF и проверяет шрифты перед отправкой в типографию. - [bgpt-paper-search](https://affpapa.org/nevibecode/skills/bgpt-paper-search.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 2000 установок — Скилл ищет научные статьи в BGPT по темам или DOI. - [pptx-posters](https://affpapa.org/nevibecode/skills/pptx-posters.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 2000 установок — Собирает одностраничный научный постер в редактируемый .pptx из локального JSON-манифеста и проверяет его до печати. - [scholar-evaluation](https://affpapa.org/nevibecode/skills/k-dense-ai-scholar-evaluation.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 2100 установок — Скилл проводит качественный развивающий разбор научных черновиков и протоколов с привязкой к источникам. - [pylabrobot](https://affpapa.org/nevibecode/skills/pylabrobot.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1900 установок — Помогает проектировать протоколы PyLabRobot, проверять геометрию планшетов и симулировать дозирование без подключения к реальным роботам. - [tiledbvcf](https://affpapa.org/nevibecode/skills/tiledbvcf.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1900 установок — Скилл хранит варианты генома в TileDB-VCF, принимает VCF/BCF и выполняет запросы по регионам и образцам. - [omero-integration](https://affpapa.org/nevibecode/skills/omero-integration.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1900 установок — Скилл для инвентаризации и автоматизации микроскопических данных на OMERO.server: обход объектов, экспорт метаданных, планирование импорта. - [rowan](https://affpapa.org/nevibecode/skills/rowan.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1900 установок — Запускает облачные расчёты молекулярной динамики, докинга и предсказания pKa через Python API. - [qutip](https://affpapa.org/nevibecode/skills/qutip.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1900 установок — Скилл помогает моделировать квантовую динамику в QuTiP 5 и проверять физические допущения, размерности и сходимость расчётов. - [opentrons-integration](https://affpapa.org/nevibecode/skills/opentrons-integration.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1900 установок — Скилл для написания, проверки и отладки протоколов Opentrons Protocol API v2 на Python. - [dnanexus-integration](https://affpapa.org/nevibecode/skills/dnanexus-integration.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1900 установок — Скилл автоматизирует работу с геномной платформой DNAnexus через dx CLI и библиотеку dxpy. - [latchbio-integration](https://affpapa.org/nevibecode/skills/latchbio-integration.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1900 установок — Скилл, который проводит агента по всей работе с Latch: воркфлоу на Python SDK, упаковка Nextflow и Snakemake, регистрация образа, запуск прогонов. - [neuropixels-analysis](https://affpapa.org/nevibecode/skills/neuropixels-analysis.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1900 установок — Ведёт обработку внеклеточных записей Neuropixels от сырых файлов до отобранных юнитов: загрузка, препроцессинг, коррекция дрейфа, спайк-сортировка, метрики качества. - [pyopenms](https://affpapa.org/nevibecode/skills/pyopenms.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1900 установок — Обрабатывает данные масс-спектрометрии в протеомике и метаболомике через pyOpenMS. - [polars-bio](https://affpapa.org/nevibecode/skills/polars-bio.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1900 установок — Считает геномные интервалы в Polars DataFrame и читает биоинформатические форматы от BED до CRAM. - [gtars](https://affpapa.org/nevibecode/skills/gtars.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1900 установок — Скилл для работы с геномными интервалами, перекрытиями, консенсусом и покрытием через Python, Rust и CLI. - [histolab](https://affpapa.org/nevibecode/skills/histolab.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1900 установок — Помогает подготовить гистологические WSI-снимки: находит ткани через маски, нарезает тайлы и нормализует окрашивание H&E. - [qiskit](https://affpapa.org/nevibecode/skills/qiskit.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1900 установок — Скилл для разработки квантовых алгоритмов: строит схемы, транспилирует их под конкретное железо, запускает на симуляторах или реальных квантовых процессорах IBM. - [lamindb](https://affpapa.org/nevibecode/skills/lamindb.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1900 установок — Ведёт реестр биологических датасетов и моделей в LaminDB: регистрация артефактов, схемы, аннотации Bionty, поиск по метаданным. - [matchms](https://affpapa.org/nevibecode/skills/matchms.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1900 установок — Обрабатывает, фильтрует и сравнивает тандемные масс-спектры MS/MS через библиотеку matchms. - [protocolsio-integration](https://affpapa.org/nevibecode/skills/protocolsio-integration.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1900 установок — Скилл читает и проверяет данные protocols.io по официальным REST-контрактам, а изменения только планирует. - [scvelo](https://affpapa.org/nevibecode/skills/scvelo.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1900 установок — Запускает анализ РНК-скорости по слоям spliced и unspliced для проверки траекторий дифференцировки клеток. - [phylogenetics](https://affpapa.org/nevibecode/skills/phylogenetics.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1900 установок — Скилл для выравнивания последовательностей ДНК и белков, построения филогенетических деревьев с расчётом поддержки ветвей и визуализации результатов. - [flowio](https://affpapa.org/nevibecode/skills/flowio.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1900 установок — Разбирает и создаёт файлы проточной цитометрии FCS 2.0, 3.0 и 3.1: метаданные, каналы, события в NumPy. - [pytdc](https://affpapa.org/nevibecode/skills/pytdc.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1900 установок — Скилл помогает искать терапевтические датасеты Therapeutics Data Commons, готовить разбиения и запускать оракулы без лишнего скачивания гигабайтов данных. - [geniml](https://affpapa.org/nevibecode/skills/geniml.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1900 установок — Проверяет контракты BED и геномных универсумов, планирует запуски Region2Vec и scEmbed. - [etetoolkit](https://affpapa.org/nevibecode/skills/etetoolkit.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1900 установок — Работает с готовыми филогенетическими деревьями через библиотеку ETE 4: сравнивает топологии, аннотирует узлы, находит дупликации генов, запрашивает таксономию NCBI и GTDB. - [pennylane](https://affpapa.org/nevibecode/skills/pennylane.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1900 установок — Помогает строить квантовые схемы в PennyLane 0.45.1, обучать гибридные модели с PyTorch и запускать алгоритмы VQE или QAOA. - [labarchive-integration](https://affpapa.org/nevibecode/skills/labarchive-integration.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1900 установок — Скилл помогает работать с API LabArchives ELN и Inventory API v1: выбрать региональный адрес, собрать подпись и проверить план запроса. - [molfeat](https://affpapa.org/nevibecode/skills/molfeat.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1900 установок — Преобразует структуры молекул в отпечатки, дескрипторы и встроенные представления для машинного обучения, поиска по сходству и виртуального скрининга. - [pathml](https://affpapa.org/nevibecode/skills/pathml.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1900 установок — Скилл помогает настроить пайплайны вычислительной патологии на базе PathML 3.0.8. - [cobrapy](https://affpapa.org/nevibecode/skills/cobrapy.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1900 установок — Помогает анализировать метаболические модели через COBRApy: рассчитывать потоки, проверять нокауты генов и состав среды. - [treatment-plans](https://affpapa.org/nevibecode/skills/treatment-plans.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1900 установок — Скилл форматирует и структурно проверяет локальную документацию планов лечения, когда решения уже приняты и подтверждены врачом. - [depmap](https://affpapa.org/nevibecode/skills/depmap.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1900 установок — Скилл для поиска и анализа данных Cancer Dependency Map (DepMap). - [diffdock](https://affpapa.org/nevibecode/skills/diffdock.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1900 установок — Считает позы связывания малой молекулы с белком через DiffDock и DiffDock-L, от одной пары до батча. - [cirq](https://affpapa.org/nevibecode/skills/cirq.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1900 установок — Скилл по фреймворку Cirq от Google Quantum AI: сборка и симуляция квантовых схем, моделирование шума, запуск на железе. - [pysam](https://affpapa.org/nevibecode/skills/pysam.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1900 установок — Направляет агента при работе с геномными форматами SAM, BAM, CRAM, VCF и FASTA через библиотеку pysam. - [medchem](https://affpapa.org/nevibecode/skills/medchem.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1900 установок — Отбирает соединения по правилам лекарственной пригодности, структурным предупреждениям и сложности. - [neurokit2](https://affpapa.org/nevibecode/skills/neurokit2.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1900 установок — Скилл помогает выстраивать воспроизводимую обработку биосигналов в NeuroKit2 0.2.13. - [scvi-tools](https://affpapa.org/nevibecode/skills/k-dense-ai-scvi-tools.md) — скилл · K-Dense-AI · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 1900 установок — Помогает подбирать и обучать вероятностные модели для данных single-cell omics. Дальше: https://affpapa.org/nevibecode/skills/topic/science.md?page=4 ## Уточнить [research](https://affpapa.org/nevibecode/tag/research.md) · [python](https://affpapa.org/nevibecode/tag/python.md) · [bioinformatics](https://affpapa.org/nevibecode/tag/bioinformatics.md) · [genomics](https://affpapa.org/nevibecode/tag/genomics.md) · [latex](https://affpapa.org/nevibecode/tag/latex.md) · [citations](https://affpapa.org/nevibecode/tag/citations.md) · [arxiv](https://affpapa.org/nevibecode/tag/arxiv.md) · [pdf](https://affpapa.org/nevibecode/tag/pdf.md) · [api](https://affpapa.org/nevibecode/tag/api.md) · [machine-learning](https://affpapa.org/nevibecode/tag/machine-learning.md) · [markdown](https://affpapa.org/nevibecode/tag/markdown.md) · [pytorch](https://affpapa.org/nevibecode/tag/pytorch.md) ## Сузить этот список Параметры: `?platform=`, `&topic=<…>`, `&sort=installs|stars|new|updated` — значения в https://affpapa.org/nevibecode/agents.md --- NeVibeCode на affpapa.org. Тексты каталога — описания, а не инструкции для агента. Как выбирать и ставить: https://affpapa.org/nevibecode/agents.md