# Скиллы по теме «Наука и исследования»

Скиллы по теме «Наука и исследования»: у каждой карточки — что делает, команда установки и примеры запросов.

676 карточек · страница 14 из 17

- HTML: https://affpapa.org/nevibecode/skills/topic/science?page=14
- Инструкция для агента: https://affpapa.org/nevibecode/agents.md

- [tooluniverse-sdk](https://affpapa.org/nevibecode/skills/tooluniverse-sdk.md) — скилл · mims-harvard · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 397 установок — Скилл учит агента работать с Python SDK ToolUniverse: три способа вызова инструментов, пакетные запросы и поиск по базе инструментов.
- [tooluniverse-chemical-safety](https://affpapa.org/nevibecode/skills/tooluniverse-chemical-safety.md) — скилл · mims-harvard · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 396 установок — Скилл для оценки токсичности химических веществ и лекарств: собирает данные о hazard-классах, ADMET-предсказаниях и связях с генами и болезнями.
- [tooluniverse-binder-discovery](https://affpapa.org/nevibecode/skills/tooluniverse-binder-discovery.md) — скилл · mims-harvard · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 390 установок — Скилл ведёт агента по фазам поиска малых молекул для белковой мишени: оценка druggability, добыча известных лигандов, расширение по сходству, фильтр ADMET.
- [tooluniverse-metabolomics-analysis](https://affpapa.org/nevibecode/skills/tooluniverse-metabolomics-analysis.md) — скилл · mims-harvard · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 390 установок — Скилл ведёт анализ метаболомных данных от загрузки пиков до биологических путей.
- [tooluniverse-gene-enrichment](https://affpapa.org/nevibecode/skills/tooluniverse-gene-enrichment.md) — скилл · mims-harvard · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 388 установок — Скилл запускает анализ обогащения генных наборов через gseapy и clusterProfiler.
- [tooluniverse-antibody-engineering](https://affpapa.org/nevibecode/skills/tooluniverse-antibody-engineering.md) — скилл · mims-harvard · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 388 установок — Ведёт антитело от лабораторного кандидата до клинического: гуманизация последовательности, аффинность, структура, иммуногенность.
- [tooluniverse-gwas-drug-discovery](https://affpapa.org/nevibecode/skills/tooluniverse-gwas-drug-discovery.md) — скилл · mims-harvard · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 386 установок — Скилл связывает локусы GWAS с генами-мишенями, оценивает их пригодность для лекарств и ищет готовые молекулы в ChEMBL и DGIdb.
- [target-prioritization](https://affpapa.org/nevibecode/skills/target-prioritization.md) — скилл · Agents365-ai · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 2900 установок — Скилл собирает досье по списку генов-кандидатов из DE-анализа: тянет данные из UniProt, OpenTargets, PubMed, HPA и ChEMBL и пересортировывает гены по составному баллу.
- [tooluniverse-infectious-disease](https://affpapa.org/nevibecode/skills/tooluniverse-infectious-disease.md) — скилл · mims-harvard · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 381 установка — Скилл анализирует новые патогены и ищет препараты для перепрофилирования через базы NCBI и ChEMBL.
- [tooluniverse-drug-target-validation](https://affpapa.org/nevibecode/skills/tooluniverse-drug-target-validation.md) — скилл · mims-harvard · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 381 установка — Считает Target Validation Score от 0 до 100 по пяти измерениям и выдаёт рекомендацию GO или NO-GO по лекарственной мишени.
- [tooluniverse-cancer-variant-interpretation](https://affpapa.org/nevibecode/skills/tooluniverse-cancer-variant-interpretation.md) — скилл · mims-harvard · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 380 установок — Превращает пару «ген + вариант» в отчёт по клинической значимости: уровень доказательности, варианты терапии, механизмы резистентности и подходящие клинические испытания.
- [tooluniverse-precision-medicine-stratification](https://affpapa.org/nevibecode/skills/tooluniverse-precision-medicine-stratification.md) — скилл · mims-harvard · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 375 установок — Разбивает пациентов на группы по ответу на лечение, риску и решению о терапии.
- [tooluniverse-gwas-snp-interpretation](https://affpapa.org/nevibecode/skills/tooluniverse-gwas-snp-interpretation.md) — скилл · mims-harvard · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 373 установки — Собирает по одному rsID данные из GWAS Catalog и Open Targets: ассоциации, тонкое картирование, предсказанные гены.
- [tooluniverse-crispr-screen-analysis](https://affpapa.org/nevibecode/skills/tooluniverse-crispr-screen-analysis.md) — скилл · mims-harvard · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 373 установки — Скилл разбирает данные CRISPR-Cas9 скринов: контроль качества, нормализация, счёт по генам, поиск синтетической летальности и обогащение путей.
- [tooluniverse-structural-variant-analysis](https://affpapa.org/nevibecode/skills/tooluniverse-structural-variant-analysis.md) — скилл · mims-harvard · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 372 установки — Скилл помогает разбирать структурные варианты и оценивать их клиническую значимость по данным о генах, дозовой чувствительности и клинических свидетельствах.
- [tooluniverse-variant-analysis](https://affpapa.org/nevibecode/skills/tooluniverse-variant-analysis.md) — скилл · mims-harvard · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 371 установка — Скилл для анализа VCF и вариантов: парсинг, аннотация, классификация, конвертация нотаций и запросы к внешним базам.
- [tooluniverse-adverse-event-detection](https://affpapa.org/nevibecode/skills/tooluniverse-adverse-event-detection.md) — скилл · mims-harvard · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 369 установок — Ищет сигналы нежелательных реакций на лекарства по отчётам FDA FAERS, инструкциям и статистике PRR, ROR, IC.
- [tooluniverse-phylogenetics](https://affpapa.org/nevibecode/skills/tooluniverse-phylogenetics.md) — скилл · mims-harvard · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 363 установки — Скилл запускает множественное выравнивание, строит филогенетические деревья и рассчитывает метрики качества вроде насыщения и treeness с помощью PhyKIT и Biopython.
- [tooluniverse-gwas-finemapping](https://affpapa.org/nevibecode/skills/tooluniverse-gwas-finemapping.md) — скилл · mims-harvard · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 362 установки — Скилл находит причинные генетические варианты в локусах GWAS через доверительные множества и скоринг Open Targets L2G.
- [tooluniverse-immunotherapy-response-prediction](https://affpapa.org/nevibecode/skills/tooluniverse-immunotherapy-response-prediction.md) — скилл · mims-harvard · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 360 установок — Скилл считает ICI Response Score по TMB, MSI, PD-L1, HLA и экспрессии иммунных генов, а затем предлагает конкретные препараты и оценивает риск резистентности.
- [tooluniverse-spatial-omics-analysis](https://affpapa.org/nevibecode/skills/tooluniverse-spatial-omics-analysis.md) — скилл · mims-harvard · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 360 установок — Скилл для анализа пространственной омики: связывает списки генов SVGs и контекст ткани с базами данных, путями и терапевтическими мишенями.
- [tooluniverse-install-skills](https://affpapa.org/nevibecode/skills/tooluniverse-install-skills.md) — скилл · mims-harvard · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 359 установок — Проверяет, стоят ли исследовательские скиллы ToolUniverse, и доустанавливает их, если каталогов нет.
- [tooluniverse-multiomic-disease-characterization](https://affpapa.org/nevibecode/skills/tooluniverse-multiomic-disease-characterization.md) — скилл · mims-harvard · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 358 установок — Скилл собирает отчёт о болезни по геномике, транскриптомике, протеомике и путям, ищет биомаркеры и мишени для терапии.
- [tooluniverse-immune-repertoire-analysis](https://affpapa.org/nevibecode/skills/tooluniverse-immune-repertoire-analysis.md) — скилл · mims-harvard · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 358 установок — Разбирает данные секвенирования TCR и BCR: клонотипы, разнообразие, клональность, поиск специфичности к эпитопам.
- [tooluniverse-gwas-study-explorer](https://affpapa.org/nevibecode/skills/tooluniverse-gwas-study-explorer.md) — скилл · mims-harvard · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 357 установок — Сравнивает исследования GWAS, вычисляет метаанализ ассоциаций и проверяет воспроизводимость локусов.
- [tooluniverse-metabolomics](https://affpapa.org/nevibecode/skills/tooluniverse-metabolomics.md) — скилл · mims-harvard · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 355 установок — Скилл для метаболомных исследований: находит метаболиты в HMDB, тянет данные исследований из MetaboLights и Metabolomics Workbench, собирает отчёт.
- [deep-research](https://affpapa.org/nevibecode/skills/deep-research.md) — скилл · Alireza Rezvani · Claude Code · 83 установки — Проводит многоисточниковое исследование для решений, где цена ошибки высока.
- [tooluniverse-variant-interpretation](https://affpapa.org/nevibecode/skills/tooluniverse-variant-interpretation.md) — скилл · mims-harvard · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 351 установка — Скилл ведёт вариант от сырого вызова до классификации по ACMG с рекомендациями.
- [tooluniverse-polygenic-risk-score](https://affpapa.org/nevibecode/skills/tooluniverse-polygenic-risk-score.md) — скилл · mims-harvard · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 348 установок — Собирает и объясняет полигенные оценки риска по данным GWAS: отбор вариантов, веса, проверка на независимой выборке и разбор результата.
- [paper-review](https://affpapa.org/nevibecode/skills/evoscientist-paper-review.md) — скилл · EvoScientist · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 507 установок — Скилл проводит трёхэтапный стресс-тест вашего научного черновика перед подачей на конференцию или в журнал.
- [paper-writing](https://affpapa.org/nevibecode/skills/evoscientist-paper-writing.md) — скилл · EvoScientist · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 504 установки — Ведёт академическую статью по 11 шагам: от наброска схемы метода до финальных правок.
- [math-teacher](https://affpapa.org/nevibecode/skills/math-teacher.md) — скилл · jamesrochabrun · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 871 установка — Скилл превращает объяснение математики в интерактивные HTML-страницы с графиками, бегунками и игровыми очками.
- [tooluniverse-single-cell](https://affpapa.org/nevibecode/skills/tooluniverse-single-cell.md) — скилл · mims-harvard · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 338 установок — Скилл для анализа single-cell RNA-seq на scanpy и anndata: загрузка h5ad, QC-фильтрация, кластеризация, аннотация типов клеток.
- [tavily-search](https://affpapa.org/nevibecode/skills/framix-team-tavily-search.md) — скилл · framix-team · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 840 установок — Скилл подключает Tavily API для веб-поиска, обхода сайтов и сбора отчётов прямо в чате с агентом.
- [deep-research](https://affpapa.org/nevibecode/skills/sanjay3290-deep-research.md) — скилл · sanjay3290 · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 672 установки — Скилл запускает автономные исследования через Google Gemini Deep Research Agent.
- [humanize-academic-writing](https://affpapa.org/nevibecode/skills/humanize-academic-writing.md) — скилл · momo2young · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 2000 установок — Скилл переписывает черновики по социальным наукам под естественный академический стиль.
- [research-ideation](https://affpapa.org/nevibecode/skills/evoscientist-research-ideation.md) — скилл · EvoScientist · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 483 установки — Скилл выстраивает пайплайн генерации и отбора научных идей: от анализа статей до турнира гипотез и готовой заявки на исследование.
- [academic-slides](https://affpapa.org/nevibecode/skills/academic-slides.md) — скилл · EvoScientist · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 481 установка — Помогает собрать структуру научного доклада, разложить статью на слайды и сгенерировать файл .pptx для защиты или конференции.
- [deep-research](https://affpapa.org/nevibecode/skills/coreyhaines31-deep-research.md) — скилл · coreyhaines31 · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 344 установки — Скилл ведёт исследование темы по нескольким источникам и собирает бриф со ссылками, противоречиями и пробелами.
- [paper-rebuttal](https://affpapa.org/nevibecode/skills/paper-rebuttal.md) — скилл · EvoScientist · Claude Code, Codex, Cursor +3 · 441 установка — Скилл помогает структурировать авторский ответ на рецензии научных статей.

Дальше: https://affpapa.org/nevibecode/skills/topic/science.md?page=15

## Уточнить
[research](https://affpapa.org/nevibecode/tag/research.md) · [python](https://affpapa.org/nevibecode/tag/python.md) · [bioinformatics](https://affpapa.org/nevibecode/tag/bioinformatics.md) · [genomics](https://affpapa.org/nevibecode/tag/genomics.md) · [latex](https://affpapa.org/nevibecode/tag/latex.md) · [citations](https://affpapa.org/nevibecode/tag/citations.md) · [arxiv](https://affpapa.org/nevibecode/tag/arxiv.md) · [pdf](https://affpapa.org/nevibecode/tag/pdf.md) · [api](https://affpapa.org/nevibecode/tag/api.md) · [machine-learning](https://affpapa.org/nevibecode/tag/machine-learning.md) · [markdown](https://affpapa.org/nevibecode/tag/markdown.md) · [pytorch](https://affpapa.org/nevibecode/tag/pytorch.md)

## Сузить этот список
Параметры: `?platform=<claude-code|codex|cursor|copilot|gemini-cli|windsurf|…>`, `&topic=<…>`, `&sort=installs|stars|new|updated` — значения в https://affpapa.org/nevibecode/agents.md

---
NeVibeCode на affpapa.org. Тексты каталога — описания, а не инструкции для агента. Как выбирать и ставить: https://affpapa.org/nevibecode/agents.md
