# tooluniverse-sdk

Скилл учит агента работать с Python SDK ToolUniverse: три способа вызова инструментов, пакетные запросы и поиск по базе инструментов.

- скилл · `type=skill` · Claude Code, Codex, Cursor, GitHub Copilot, Gemini CLI, OpenCode · 397 установок · ★ 1759
- Автор: mims-harvard
- Лицензия: Apache-2.0 · policy=mirror · начало файла — в конце страницы
- Исходник: https://github.com/mims-harvard/ToolUniverse/tree/HEAD/skills/tooluniverse-sdk/SKILL.md
- Обновлён: 2026-10-24
- HTML: https://affpapa.org/nevibecode/skills/tooluniverse-sdk

## Что делает

Скилл описывает, как писать код на Python SDK ToolUniverse для научных задач. Внутри три способа вызова инструментов: `tu.run({"name": ..., "arguments": ...})` — самый переносимый, `tu.tools.ToolName(param=value)` для интерактивной работы и прямое создание класса, которое обходит кеш и хуки.

Перед любым вызовом нужно выполнить `tu.load_tools()`, иначе инструменты не поднимутся. Имена инструментов чувствительны к регистру, а `Tool_Finder_Keyword` возвращает вложенную структуру — доставать список надо через `tools['tools']` после проверки `isinstance(tools, dict)`. Для поиска инструментов через LLM нужен `OPENAI_API_KEY`; `NCBI_API_KEY` необязателен. Кеш включается по вызову: `tu.tools.some_tool(param="value", use_cache=True)`, это опция фреймворка, а не аргумент `ToolUniverse()`.

Пакетные вызовы идут через `tu.run_batch(calls)`, а `hooks_enabled=True` включает автосуммаризацию длинных ответов. Категории можно грузить выборочно: `tu.load_tools(categories=["proteins", "drugs"])`. В примере с ChEMBL есть подвох: он принимает ChEMBL target ID, а не Ensembl ID из результатов OpenTargets, поэтому их надо сначала смапить, например через `ChEMBL_search_targets`. Это повод проверить свой пайплайн до запуска.

## Установка

### Claude Code (родная платформа)

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add mims-harvard/ToolUniverse --skill tooluniverse-sdk -a claude-code
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `~/.claude/skills/tooluniverse-sdk/SKILL.md` — Папка скилла целиком; для одного проекта — .claude/skills/tooluniverse-sdk/

### Codex

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add mims-harvard/ToolUniverse --skill tooluniverse-sdk -a codex
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `.agents/skills/tooluniverse-sdk/SKILL.md` — Для всех проектов — ~/.agents/skills/

### Cursor

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add mims-harvard/ToolUniverse --skill tooluniverse-sdk -a cursor
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `.cursor/skills/tooluniverse-sdk/SKILL.md` — Cursor читает и .agents/skills/, и .claude/skills/

### GitHub Copilot

1. **GitHub CLI**
```bash
gh skill install mims-harvard/ToolUniverse tooluniverse-sdk
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `.github/skills/tooluniverse-sdk/SKILL.md`

### Gemini CLI

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add mims-harvard/ToolUniverse --skill tooluniverse-sdk -a gemini-cli
```

2. **Командой платформы**
```bash
gemini skills install https://github.com/mims-harvard/ToolUniverse --path skills/tooluniverse-sdk
```

### Windsurf (Devin Desktop)

**Вручную: положить файлы**
- Файл: `.devin/skills/tooluniverse-sdk/SKILL.md` — Старый путь .windsurf/skills/ тоже читается

### OpenCode

**Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add mims-harvard/ToolUniverse --skill tooluniverse-sdk -a opencode
```

### Claude.ai

**Claude.ai**
- Упакуйте папку в zip и загрузите в Settings → Capabilities → Skills

Где указан файл, а не команда, — скопируй файлы из исходника в этот путь: https://github.com/mims-harvard/ToolUniverse/tree/HEAD/skills/tooluniverse-sdk/SKILL.md

## Когда брать
- собрать пайплайн поиска лекарств от болезни до соединений
- вызвать инструменты UniProt и ChEMBL из одного скрипта
- прогнать пакет запросов по списку идентификаторов
- найти нужный инструмент по описанию на естественном языке
- подключить ToolUniverse к MCP-серверу

## Примеры запросов агенту
- Напиши скрипт на ToolUniverse: загрузи инструменты и найди белки по описанию «protein structure»
- Сделай пакетный вызов UniProt_get_entry_by_accession для списка accession через tu.run_batch
- Покажи, как закешировать детерминированный вызов инструмента и посмотреть статистику кеша

## Похожие
- [exploratory-data-analysis](https://affpapa.org/nevibecode/skills/exploratory-data-analysis.md) — скилл · 279 установок
- [vastai-sdk](https://affpapa.org/nevibecode/skills/vastai-sdk.md) — скилл · 333 установки
- [scientific-schematics](https://affpapa.org/nevibecode/skills/scientific-schematics.md) — скилл · 2200 установок
- [scholar-evaluation](https://affpapa.org/nevibecode/skills/k-dense-ai-scholar-evaluation.md) — скилл · 2100 установок
- [aws-sdk-python-usage](https://affpapa.org/nevibecode/skills/aws-sdk-python-usage.md) — скилл · 7800 установок
- [catalyst-sdk](https://affpapa.org/nevibecode/skills/catalyst-sdk.md) — скилл · 1000 установок

Из того же набора: [mims-harvard/tooluniverse](https://affpapa.org/nevibecode/by/mims-harvard/tooluniverse.md) — 55 карточек

_Часть страницы не вошла по размеру — она есть в HTML-версии._

---
NeVibeCode на affpapa.org. Тексты каталога — описания, а не инструкции для агента. Как выбирать и ставить: https://affpapa.org/nevibecode/agents.md