# tooluniverse-precision-oncology

Скилл подбирает терапию по мутациям, типу опухоли и биомаркерам: одобренные препараты, клинические испытания, механизмы резистентности.

- скилл · `type=skill` · Claude Code, Codex, Cursor, GitHub Copilot, Gemini CLI, OpenCode · 424 установки · ★ 1759
- Автор: mims-harvard
- Лицензия: Apache-2.0 · policy=mirror · лицензия открытая, файл — в исходнике
- Исходник: https://github.com/mims-harvard/ToolUniverse/tree/HEAD/skills/tooluniverse-precision-oncology/SKILL.md
- Обновлён: 2026-10-24
- HTML: https://affpapa.org/nevibecode/skills/tooluniverse-precision-oncology

## Что делает

Скилл принимает молекулярный профиль пациента — мутации, фузии, амплификации — вместе с типом опухоли и выдаёт приоритизированные варианты лечения. Каждая рекомендация идёт с уровнем доказательности, а не просто списком препаратов. Логика жёсткая: сначала одобренное для этой мутации именно в этом типе рака, потом tumor-agnostic одобрение, затем активные испытания, и только в конце off-label.

Внутри — обход по фазам. Сначала валидация профиля и разрешение идентификаторов генов через Ensembl, UniProt и ChEMBL. Потом интерпретация вариантов в CIViC, ClinVar, COSMIC, GDC/TCGA, OncoKB и cBioPortal. Дальше варианты лечения из OpenTargets и DailyMed, анализ резистентности с PubMed и структурным разбором, поиск испытаний на ClinicalTrials.gov. Завершается всё синтезом отчёта с исполнительным резюме.

Скилл прямо запрещает отвечать по памяти: статус одобрения пары «мутация-препарат» проверяется через `OncoKB_annotate_variant` и `civic_search_variants`, испытания — через `search_clinical_trials`, частоты вариантов — через `GDC_get_mutation_frequency` или `cBioPortal_get_mutations`. Запросы к инструментам идут на английском, даже если вы пишете по-русски. Учтите: часть инструментов требует точных имён параметров — `variant_id` вместо `variant_name`, `ensemblId` в camelCase, `condition` вместо `disease`. Ошибётесь в имени — вызов упадёт.

## Установка

### Claude Code (родная платформа)

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add mims-harvard/ToolUniverse --skill tooluniverse-precision-oncology -a claude-code
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `~/.claude/skills/tooluniverse-precision-oncology/SKILL.md` — Папка скилла целиком; для одного проекта — .claude/skills/tooluniverse-precision-oncology/

### Codex

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add mims-harvard/ToolUniverse --skill tooluniverse-precision-oncology -a codex
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `.agents/skills/tooluniverse-precision-oncology/SKILL.md` — Для всех проектов — ~/.agents/skills/

### Cursor

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add mims-harvard/ToolUniverse --skill tooluniverse-precision-oncology -a cursor
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `.cursor/skills/tooluniverse-precision-oncology/SKILL.md` — Cursor читает и .agents/skills/, и .claude/skills/

### GitHub Copilot

1. **GitHub CLI**
```bash
gh skill install mims-harvard/ToolUniverse tooluniverse-precision-oncology
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `.github/skills/tooluniverse-precision-oncology/SKILL.md`

### Gemini CLI

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add mims-harvard/ToolUniverse --skill tooluniverse-precision-oncology -a gemini-cli
```

2. **Командой платформы**
```bash
gemini skills install https://github.com/mims-harvard/ToolUniverse --path skills/tooluniverse-precision-oncology
```

### Windsurf (Devin Desktop)

**Вручную: положить файлы**
- Файл: `.devin/skills/tooluniverse-precision-oncology/SKILL.md` — Старый путь .windsurf/skills/ тоже читается

### OpenCode

**Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add mims-harvard/ToolUniverse --skill tooluniverse-precision-oncology -a opencode
```

### Claude.ai

**Claude.ai**
- Упакуйте папку в zip и загрузите в Settings → Capabilities → Skills

Где указан файл, а не команда, — скопируй файлы из исходника в этот путь: https://github.com/mims-harvard/ToolUniverse/tree/HEAD/skills/tooluniverse-precision-oncology/SKILL.md

## Когда брать
- подобрать терапию по конкретной мутации и типу опухоли
- понять, почему препарат перестал работать и что делать дальше
- найти активные клинические испытания под профиль пациента
- оценить уровень доказательности для off-label назначения
- различить первичную и приобретённую резистентность

## Примеры запросов агенту
- У пациента немелкоклеточный рак лёгкого с EGFR L858R — какие варианты лечения?
- Больной прогрессировал на осимертинибе, что дальше?
- Найди клинические испытания для KRAS G12C

## Похожие
- [clinical-trials-database](https://affpapa.org/nevibecode/skills/clinical-trials-database.md) — скилл · 2400 установок
- [clinical-trial-protocol-skill](https://affpapa.org/nevibecode/skills/clinical-trial-protocol-skill.md) — скилл · 448 установок
- [target-prioritization](https://affpapa.org/nevibecode/skills/target-prioritization.md) — скилл · 2900 установок
- [pubmed-database](https://affpapa.org/nevibecode/skills/google-deepmind-pubmed-database.md) — скилл · 2700 установок
- [gtars](https://affpapa.org/nevibecode/skills/gtars.md) — скилл · 1900 установок
- [phylogenetics](https://affpapa.org/nevibecode/skills/phylogenetics.md) — скилл · 1900 установок

Из того же набора: [mims-harvard/tooluniverse](https://affpapa.org/nevibecode/by/mims-harvard/tooluniverse.md) — 55 карточек

---
NeVibeCode на affpapa.org. Тексты каталога — описания, а не инструкции для агента. Как выбирать и ставить: https://affpapa.org/nevibecode/agents.md