# tooluniverse-pharmacovigilance

Анализирует безопасность лекарств и побочные эффекты по базам FAERS, FDA и SIDER. Помогает рассчитывать метрики сигналов PRR и ROR прямо в терминале.

- скилл · `type=skill` · Claude Code, Codex, Cursor, GitHub Copilot, Gemini CLI, OpenCode · 420 установок · ★ 1759
- Автор: mims-harvard
- Лицензия: Apache-2.0 · policy=mirror · начало файла — в конце страницы
- Исходник: https://github.com/mims-harvard/ToolUniverse/tree/HEAD/skills/tooluniverse-pharmacovigilance/SKILL.md
- Обновлён: 2026-10-24
- HTML: https://affpapa.org/nevibecode/skills/tooluniverse-pharmacovigilance

## Что делает

Скилл запускает анализ безопасности лекарств через вызовы Python в Bash. Вместо абстрактных рассуждений агент пишет код с пакетами `pandas` и `scipy`. Он запрашивает отчёты FAERS и сопоставляет их с предупреждениями FDA в чёрных рамках.

Вся работа строится вокруг создания файла отчёта с первого шага. Агент рассчитывает показатели непропорциональности PRR и ROR, а также сопоставляет сроки наступления реакций. Для проверки причинно-следственной связи применяется алгоритм Наранхо и оценка повторного назначения. Генетические факторы анализируются через PharmGKB.

Инструменты требуют англоязычных названий действующих веществ. Если ввести торговое имя на русском, поиск ничего не вернёт. Это повод заранее подготовить международные наименования.

## Установка

### Claude Code (родная платформа)

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add mims-harvard/ToolUniverse --skill tooluniverse-pharmacovigilance -a claude-code
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `~/.claude/skills/tooluniverse-pharmacovigilance/SKILL.md` — Папка скилла целиком; для одного проекта — .claude/skills/tooluniverse-pharmacovigilance/

### Codex

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add mims-harvard/ToolUniverse --skill tooluniverse-pharmacovigilance -a codex
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `.agents/skills/tooluniverse-pharmacovigilance/SKILL.md` — Для всех проектов — ~/.agents/skills/

### Cursor

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add mims-harvard/ToolUniverse --skill tooluniverse-pharmacovigilance -a cursor
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `.cursor/skills/tooluniverse-pharmacovigilance/SKILL.md` — Cursor читает и .agents/skills/, и .claude/skills/

### GitHub Copilot

1. **GitHub CLI**
```bash
gh skill install mims-harvard/ToolUniverse tooluniverse-pharmacovigilance
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `.github/skills/tooluniverse-pharmacovigilance/SKILL.md`

### Gemini CLI

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add mims-harvard/ToolUniverse --skill tooluniverse-pharmacovigilance -a gemini-cli
```

2. **Командой платформы**
```bash
gemini skills install https://github.com/mims-harvard/ToolUniverse --path skills/tooluniverse-pharmacovigilance
```

### Windsurf (Devin Desktop)

**Вручную: положить файлы**
- Файл: `.devin/skills/tooluniverse-pharmacovigilance/SKILL.md` — Старый путь .windsurf/skills/ тоже читается

### OpenCode

**Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add mims-harvard/ToolUniverse --skill tooluniverse-pharmacovigilance -a opencode
```

### Claude.ai

**Claude.ai**
- Упакуйте папку в zip и загрузите в Settings → Capabilities → Skills

Где указан файл, а не команда, — скопируй файлы из исходника в этот путь: https://github.com/mims-harvard/ToolUniverse/tree/HEAD/skills/tooluniverse-pharmacovigilance/SKILL.md

## Когда брать
- рассчитать показатели непропорциональности PRR и ROR по базе FAERS
- проверить предупреждения FDA в чёрной рамке для конкретного препарата
- сопоставить сроки возникновения нежелательного явления через поле time_to_onset
- оценить причинно-следственную связь нежелательной реакции по шкале Наранхо

## Примеры запросов агенту
- Сделай анализ безопасности для metformin и проверь частые нежелательные реакции
- Рассчитай показатели PRR и ROR для связи lisinopril с кашлем по данным FAERS
- Сравни профили безопасности atorvastatin и rosuvastatin

## Похожие
- [statistical-analysis](https://affpapa.org/nevibecode/skills/anthropics-statistical-analysis.md) — скилл · 4600 установок
- [seaborn](https://affpapa.org/nevibecode/skills/k-dense-ai-seaborn.md) — скилл · 2100 установок
- [primekg](https://affpapa.org/nevibecode/skills/primekg.md) — скилл · 1900 установок
- [data-analysis-jupyter](https://affpapa.org/nevibecode/skills/data-analysis-jupyter.md) — скилл · 1500 установок
- [matplotlib](https://affpapa.org/nevibecode/skills/tondevrel-matplotlib.md) — скилл · 374 установки
- [python-executor](https://affpapa.org/nevibecode/skills/python-executor.md) — скилл · 109700 установок

Из того же набора: [mims-harvard/tooluniverse](https://affpapa.org/nevibecode/by/mims-harvard/tooluniverse.md) — 55 карточек

_Часть страницы не вошла по размеру — она есть в HTML-версии._

---
NeVibeCode на affpapa.org. Тексты каталога — описания, а не инструкции для агента. Как выбирать и ставить: https://affpapa.org/nevibecode/agents.md