# tooluniverse-gwas-drug-discovery

Скилл связывает локусы GWAS с генами-мишенями, оценивает их пригодность для лекарств и ищет готовые молекулы в ChEMBL и DGIdb.

- скилл · `type=skill` · Claude Code, Codex, Cursor, GitHub Copilot, Gemini CLI, OpenCode · 386 установок · ★ 1759
- Автор: mims-harvard
- Лицензия: Apache-2.0 · policy=mirror · начало файла — в конце страницы
- Исходник: https://github.com/mims-harvard/ToolUniverse/tree/HEAD/skills/tooluniverse-gwas-drug-discovery/SKILL.md
- Обновлён: 2026-10-24
- HTML: https://affpapa.org/nevibecode/skills/tooluniverse-gwas-drug-discovery

## Что делает

Скилл выстраивает пайплайн переноса генетических сигналов GWAS в разработку лекарств. Он запрашивает ассоциации через GWAS Catalog и Open Targets, фильтрует локусы и сопоставляет варианты с генами. Затем агент проверяет драггабельность белков и профили безопасности.

Внутри заложен шестиэтапный процесс. Приоритет мишеней считается по формуле с учётом GWAS, драггабельности и клинических данных. Для поиска существующих препаратов используются инструменты ChEMBL и DGIdb, а побочные эффекты проверяются по базам FDA. При этом поиск лекарств в Open Targets может вернуть ошибку HTTP 400, поэтому надёжнее запрашивать DGIdb.

При вызове инструментов важно соблюдать имена аргументов. Функция `gwas_get_associations_for_trait` принимает `disease_trait`, а параметра порога по p-value в ней нет — фильтрацию придётся делать на клиенте. В параметре `ensemblId` буква `d` обязательно строчная.

## Установка

### Claude Code (родная платформа)

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add mims-harvard/ToolUniverse --skill tooluniverse-gwas-drug-discovery -a claude-code
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `~/.claude/skills/tooluniverse-gwas-drug-discovery/SKILL.md` — Папка скилла целиком; для одного проекта — .claude/skills/tooluniverse-gwas-drug-discovery/

### Codex

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add mims-harvard/ToolUniverse --skill tooluniverse-gwas-drug-discovery -a codex
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `.agents/skills/tooluniverse-gwas-drug-discovery/SKILL.md` — Для всех проектов — ~/.agents/skills/

### Cursor

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add mims-harvard/ToolUniverse --skill tooluniverse-gwas-drug-discovery -a cursor
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `.cursor/skills/tooluniverse-gwas-drug-discovery/SKILL.md` — Cursor читает и .agents/skills/, и .claude/skills/

### GitHub Copilot

1. **GitHub CLI**
```bash
gh skill install mims-harvard/ToolUniverse tooluniverse-gwas-drug-discovery
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `.github/skills/tooluniverse-gwas-drug-discovery/SKILL.md`

### Gemini CLI

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add mims-harvard/ToolUniverse --skill tooluniverse-gwas-drug-discovery -a gemini-cli
```

2. **Командой платформы**
```bash
gemini skills install https://github.com/mims-harvard/ToolUniverse --path skills/tooluniverse-gwas-drug-discovery
```

### Windsurf (Devin Desktop)

**Вручную: положить файлы**
- Файл: `.devin/skills/tooluniverse-gwas-drug-discovery/SKILL.md` — Старый путь .windsurf/skills/ тоже читается

### OpenCode

**Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add mims-harvard/ToolUniverse --skill tooluniverse-gwas-drug-discovery -a opencode
```

### Claude.ai

**Claude.ai**
- Упакуйте папку в zip и загрузите в Settings → Capabilities → Skills

Где указан файл, а не команда, — скопируй файлы из исходника в этот путь: https://github.com/mims-harvard/ToolUniverse/tree/HEAD/skills/tooluniverse-gwas-drug-discovery/SKILL.md

## Когда брать
- связать значимые локусы GWAS с причинными генами
- рассчитать композитный балл приоритета мишени
- проверить драггабельность найденного гена в Open Targets
- найти одобренные препараты для мишени через DGIdb и ChEMBL
- сопоставить молекулярный механизм для репозиционирования лекарств

## Примеры запросов агенту
- Найди генетические ассоциации для type 2 diabetes в GWAS и оцени драггабельность мишеней
- Рассчитай приоритет мишеней для Alzheimer disease по данным Open Targets и ChEMBL
- Проверь взаимодействия с лекарствами для гена TCF7L2 через DGIdb

## Похожие
- [opentargets-database](https://affpapa.org/nevibecode/skills/opentargets-database.md) — скилл · 2200 установок
- [chembl-database](https://affpapa.org/nevibecode/skills/chembl-database.md) — скилл · 2200 установок
- [gwas-catalog-skill](https://affpapa.org/nevibecode/skills/gwas-catalog-skill.md) — скилл · 14 установок
- [database-lookup](https://affpapa.org/nevibecode/skills/database-lookup.md) — скилл · 2100 установок
- [bioservices](https://affpapa.org/nevibecode/skills/bioservices.md) — скилл · 1900 установок

Из того же набора: [mims-harvard/tooluniverse](https://affpapa.org/nevibecode/by/mims-harvard/tooluniverse.md) — 56 карточек

_Часть страницы не вошла по размеру — она есть в HTML-версии._

---
NeVibeCode на affpapa.org. Тексты каталога — описания, а не инструкции для агента. Как выбирать и ставить: https://affpapa.org/nevibecode/agents.md