# tooluniverse-disease-research

Собирает отчёт о болезни по генетике, путям, лекарствам и клиническим испытаниям. Полезен, когда нужен разбор редкого заболевания с источниками.

- скилл · `type=skill` · Claude Code, Codex, Cursor, GitHub Copilot, Gemini CLI, OpenCode · 437 установок · ★ 1759
- Автор: mims-harvard
- Лицензия: Apache-2.0 · policy=mirror · лицензия открытая, файл — в исходнике
- Исходник: https://github.com/mims-harvard/ToolUniverse/tree/HEAD/skills/tooluniverse-disease-research/SKILL.md
- Обновлён: 2026-10-24
- HTML: https://affpapa.org/nevibecode/skills/tooluniverse-disease-research

## Что делает

Скилл ведёт исследование по десяти разделам: идентификация и классификация, клиническая картина, генетика и молекулярные основы, лечение, биологические пути, эпидемиология и литература, похожие болезни, онкология, фармакология и безопасность препаратов. Каждый факт в отчёте помечается инструментом-источником, а в конце собирается журнал вызовов с параметрами.

Работает по принципу «сначала отчёт»: файл `{disease_name}_research_report.md` создаётся до поиска, затем наполняется по мере прохождения разделов. Промежуточные запросы пользователю не показывают. Для свободного текста вроде подписи к образцу или названия ткани есть `ZOOMA_annotate_text` — он приводит строку к онтологическому идентификатору с оценкой уверенности, и дальше этот ID уходит в OLS или OpenTargets.

Инструменты вызываются с английскими названиями болезней, а отвечает скилл на языке пользователя. Если спрашиваете про редкое заболевание, сначала идёт запрос в Orphanet, OMIM или DisGeNET — память модели тут не источник, потому что данные о распространённости и лечении меняются.

## Установка

### Claude Code (родная платформа)

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add mims-harvard/ToolUniverse --skill tooluniverse-disease-research -a claude-code
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `~/.claude/skills/tooluniverse-disease-research/SKILL.md` — Папка скилла целиком; для одного проекта — .claude/skills/tooluniverse-disease-research/

### Codex

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add mims-harvard/ToolUniverse --skill tooluniverse-disease-research -a codex
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `.agents/skills/tooluniverse-disease-research/SKILL.md` — Для всех проектов — ~/.agents/skills/

### Cursor

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add mims-harvard/ToolUniverse --skill tooluniverse-disease-research -a cursor
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `.cursor/skills/tooluniverse-disease-research/SKILL.md` — Cursor читает и .agents/skills/, и .claude/skills/

### GitHub Copilot

1. **GitHub CLI**
```bash
gh skill install mims-harvard/ToolUniverse tooluniverse-disease-research
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `.github/skills/tooluniverse-disease-research/SKILL.md`

### Gemini CLI

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add mims-harvard/ToolUniverse --skill tooluniverse-disease-research -a gemini-cli
```

2. **Командой платформы**
```bash
gemini skills install https://github.com/mims-harvard/ToolUniverse --path skills/tooluniverse-disease-research
```

### Windsurf (Devin Desktop)

**Вручную: положить файлы**
- Файл: `.devin/skills/tooluniverse-disease-research/SKILL.md` — Старый путь .windsurf/skills/ тоже читается

### OpenCode

**Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add mims-harvard/ToolUniverse --skill tooluniverse-disease-research -a opencode
```

### Claude.ai

**Claude.ai**
- Упакуйте папку в zip и загрузите в Settings → Capabilities → Skills

Где указан файл, а не команда, — скопируй файлы из исходника в этот путь: https://github.com/mims-harvard/ToolUniverse/tree/HEAD/skills/tooluniverse-disease-research/SKILL.md

## Когда брать
- собрать обзор редкого заболевания с генетикой и клиническими испытаниями
- найти гены-кандидаты и варианты в ClinVar по конкретному синдрому
- сопоставить существующие препараты и кандидатов на репозиционирование
- оценить распространённость и заболеваемость по литературе
- разложить патогенез от варианта гена до поражения органа

## Примеры запросов агенту
- сделай отчёт по болезни Ниманна — Пика, нужны гены, пути и текущие терапии
- что известно про синдром Марфана? собери полный обзор с источниками
- разбери редкое заболевание по фенотипам HPO и клиническим испытаниям

## Похожие
- [gtars](https://affpapa.org/nevibecode/skills/gtars.md) — скилл · 1900 установок
- [opentargets-database](https://affpapa.org/nevibecode/skills/opentargets-database.md) — скилл · 2200 установок
- [ensembl-database](https://affpapa.org/nevibecode/skills/ensembl-database.md) — скилл · 2200 установок
- [alphagenome](https://affpapa.org/nevibecode/skills/alphagenome.md) — скилл · 466 установок
- [bioinformatics-fundamentals](https://affpapa.org/nevibecode/skills/bioinformatics-fundamentals.md) — скилл · 440 установок
- [start](https://affpapa.org/nevibecode/skills/anthropics-start.md) — скилл · 4900 установок

Из того же набора: [mims-harvard/tooluniverse](https://affpapa.org/nevibecode/by/mims-harvard/tooluniverse.md) — 55 карточек

---
NeVibeCode на affpapa.org. Тексты каталога — описания, а не инструкции для агента. Как выбирать и ставить: https://affpapa.org/nevibecode/agents.md