# research-pipeline

Организует полный цикл научного исследования от поиска гипотез и запуска экспериментов до вёрстки статьи. Пригодится для автономной работы над академическими публикациями.

- скилл · `type=skill` · Claude Code, Codex, Cursor, GitHub Copilot, Gemini CLI, OpenCode · 555 установок · ★ 18090
- Автор: wanshuiyin
- Лицензия: MIT · policy=mirror · начало файла — в конце страницы
- Исходник: https://github.com/wanshuiyin/Auto-claude-code-research-in-sleep/tree/HEAD/skills/research-pipeline/SKILL.md
- Обновлён: 2026-10-24
- HTML: https://affpapa.org/nevibecode/skills/research-pipeline

## Что делает

Скилл ведёт исследовательский проект через последовательные стадии: поиск литературы, формулирование гипотез, запуск кода и подготовку отчёта. При необходимости теоремы направляются в навык `/lean-formalize` для формального математического доказательства. Для экспериментов можно подключить существующий репозиторий через флаг `BASE_REPO` или создавать код с нуля. Перед тяжёлыми вычислениями код проверяется через GPT-6-Astra xhigh.

Работу поддерживают системные утилиты Bash, Read, Grep, WebSearch и сервер Codex MCP. Процесс автономен, но контролируем. Флаг `HUMAN_CHECKPOINT` останавливает цикл после рецензирования для ручных правок, а `RESUMABLE` пишет состояние каждого этапа в `.aris/runs/<run_id>.json`. Если сессия оборвалась, прогон возобновляется вызовом с ключом `— resume <run_id>`. Без выбранного значения `VENUE` оформление статьи откладывается на потом.

## Установка

### Claude Code (родная платформа)

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add wanshuiyin/Auto-claude-code-research-in-sleep --skill research-pipeline -a claude-code
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `~/.claude/skills/research-pipeline/SKILL.md` — Папка скилла целиком; для одного проекта — .claude/skills/research-pipeline/

### Codex

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add wanshuiyin/Auto-claude-code-research-in-sleep --skill research-pipeline -a codex
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `.agents/skills/research-pipeline/SKILL.md` — Для всех проектов — ~/.agents/skills/

### Cursor

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add wanshuiyin/Auto-claude-code-research-in-sleep --skill research-pipeline -a cursor
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `.cursor/skills/research-pipeline/SKILL.md` — Cursor читает и .agents/skills/, и .claude/skills/

### GitHub Copilot

1. **GitHub CLI**
```bash
gh skill install wanshuiyin/Auto-claude-code-research-in-sleep research-pipeline
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `.github/skills/research-pipeline/SKILL.md`

### Gemini CLI

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add wanshuiyin/Auto-claude-code-research-in-sleep --skill research-pipeline -a gemini-cli
```

2. **Командой платформы**
```bash
gemini skills install https://github.com/wanshuiyin/Auto-claude-code-research-in-sleep --path skills/research-pipeline
```

### Windsurf (Devin Desktop)

**Вручную: положить файлы**
- Файл: `.devin/skills/research-pipeline/SKILL.md` — Старый путь .windsurf/skills/ тоже читается

### OpenCode

**Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add wanshuiyin/Auto-claude-code-research-in-sleep --skill research-pipeline -a opencode
```

### Claude.ai

**Claude.ai**
- Упакуйте папку в zip и загрузите в Settings → Capabilities → Skills

Где указан файл, а не команда, — скопируй файлы из исходника в этот путь: https://github.com/wanshuiyin/Auto-claude-code-research-in-sleep/tree/HEAD/skills/research-pipeline/SKILL.md

## Когда брать
- Собрать метаданные препринтов через arXiv API для поиска гипотез
- Проверить код экспериментов перед запуском расчётов на GPU
- Возобновить прерванный цикл исследования по идентификатору запуска
- Сгенерировать итоговый отчёт `NARRATIVE_REPORT.md` с визуализацией в HTML

## Примеры запросов агенту
- /research-pipeline "Graph neural networks for drug discovery"
- /research-pipeline "Transformer attention bounds" — resume run_2025_03
- /research-pipeline "Diffusion models" — HUMAN_CHECKPOINT: true, AUTO_WRITE: false

## Похожие
- [anysearch](https://affpapa.org/nevibecode/skills/anysearch.md) — скилл · 38500 установок
- [academic-paper](https://affpapa.org/nevibecode/skills/academic-paper.md) — скилл · 10800 установок
- [nature-figure](https://affpapa.org/nevibecode/skills/nature-figure.md) — скилл · 18800 установок
- [academic-paper-reviewer](https://affpapa.org/nevibecode/skills/academic-paper-reviewer.md) — скилл · 9800 установок
- [nature-polishing](https://affpapa.org/nevibecode/skills/nature-polishing.md) — скилл · 17500 установок
- [nature-citation](https://affpapa.org/nevibecode/skills/nature-citation.md) — скилл · 15600 установок

Из того же набора: [wanshuiyin/auto-claude-code-research-in-sleep](https://affpapa.org/nevibecode/by/wanshuiyin/auto-claude-code-research-in-sleep.md) — 78 карточек

_Часть страницы не вошла по размеру — она есть в HTML-версии._

---
NeVibeCode на affpapa.org. Тексты каталога — описания, а не инструкции для агента. Как выбирать и ставить: https://affpapa.org/nevibecode/agents.md