# pubchem-pug-skill

Скилл отправляет структурированные запросы к PubChem PUG REST API для поиска свойств молекул, аннотаций веществ и биологических анализов.

- скилл · `type=skill` · Codex, ChatGPT · 14 установок · ★ 7596
- Автор: OpenAI · официальный репозиторий OpenAI
- Лицензия: LicenseRef-Proprietary · policy=link-only · показываем только описание, файл — у автора
- Исходник: https://github.com/openai/plugins/tree/HEAD/plugins/life-science-research/skills/pubchem-pug-skill/SKILL.md
- Обновлён: 2026-10-08
- HTML: https://affpapa.org/nevibecode/skills/pubchem-pug-skill

## Что делает

Скилл помогает запрашивать данные химических соединений из базы PubChem без громоздких дампов. Инструмент формулирует точечные вызовы к `https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/rest/pug`, забирая характеристики веществ или сводки биологических тестов.

Все обращения выполняются локальным скриптом `scripts/rest_request.py`, который принимает JSON со стандартного потока ввода. Ответ по умолчанию преобразуется в компактный отчёт формата Markdown. Если требуется полный ответ сервиса, в параметрах включают флаг `save_raw=true`, после чего файл сохраняется на диск по пути из `raw_output_path`.

Для работы скилла в окружении необходим рабочий интерпретатор Python для запуска `scripts/rest_request.py`. При запросе списков или тестов рекомендуется ограничивать выдачу параметром `max_items=10`, чтобы не перегружать контекст модели лишними записями.

## Установка

### Codex (родная платформа)

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add openai/plugins --skill pubchem-pug-skill -a codex
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `.agents/skills/pubchem-pug-skill/SKILL.md` — Для всех проектов — ~/.agents/skills/

### Claude Code

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add openai/plugins --skill pubchem-pug-skill -a claude-code
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `~/.claude/skills/pubchem-pug-skill/SKILL.md` — Папка скилла целиком; для одного проекта — .claude/skills/pubchem-pug-skill/

### Cursor

**Вручную: положить файлы**
- Файл: `.cursor/skills/pubchem-pug-skill/SKILL.md` — Cursor читает и .agents/skills/, и .claude/skills/

### GitHub Copilot

1. **GitHub CLI**
```bash
gh skill install openai/plugins pubchem-pug-skill
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `.github/skills/pubchem-pug-skill/SKILL.md`

### Gemini CLI

**Командой платформы**
```bash
gemini skills install https://github.com/openai/plugins --path plugins/life-science-research/skills/pubchem-pug-skill
```

### Windsurf (Devin Desktop)

**Вручную: положить файлы**
- Файл: `.devin/skills/pubchem-pug-skill/SKILL.md` — Старый путь .windsurf/skills/ тоже читается

### Claude.ai

**Claude.ai**
- Упакуйте папку в zip и загрузите в Settings → Capabilities → Skills

Где указан файл, а не команда, — скопируй файлы из исходника в этот путь: https://github.com/openai/plugins/tree/HEAD/plugins/life-science-research/skills/pubchem-pug-skill/SKILL.md

## Когда брать
- найти молекулярную формулу и вес вещества по названию
- выгрузить аннотацию соединения по его CID из базы PubChem
- получить сводку результатов биологического скрининга по номеру AID
- сохранить сырой ответ PUG REST на диск без обрезки

## Примеры запросов агенту
- Найди молекулярный вес и формулу аспирина через PubChem
- Получи описание химического соединения с CID 2244
- Выгрузи сводку теста AID 1706 и сохрани сырой ответ в файл

## Похожие
- [anysearch](https://affpapa.org/nevibecode/skills/anysearch.md) — скилл · 38500 установок
- [academic-paper](https://affpapa.org/nevibecode/skills/academic-paper.md) — скилл · 10800 установок
- [nature-figure](https://affpapa.org/nevibecode/skills/nature-figure.md) — скилл · 18800 установок
- [academic-paper-reviewer](https://affpapa.org/nevibecode/skills/academic-paper-reviewer.md) — скилл · 9800 установок
- [nature-polishing](https://affpapa.org/nevibecode/skills/nature-polishing.md) — скилл · 17500 установок
- [nature-citation](https://affpapa.org/nevibecode/skills/nature-citation.md) — скилл · 15600 установок

Из того же набора: [openai/plugins](https://affpapa.org/nevibecode/by/openai/plugins.md) — 422 карточки

---
NeVibeCode на affpapa.org. Тексты каталога — описания, а не инструкции для агента. Как выбирать и ставить: https://affpapa.org/nevibecode/agents.md