# nv-generate-mr-brain-finetune

Дообучает диффузионную модель NV-Generate-CTMR MR-Brain v1 на ваших NIfTI-снимках T1, T2, FLAIR, SWI или MRA. Сначала прогоняет проверку без GPU.

- скилл · `type=skill` · Claude Code, Codex, Cursor, GitHub Copilot, Gemini CLI, OpenCode · 1800 установок · ★ 3735
- Автор: NVIDIA MedTech Team
- Лицензия: Apache-2.0 · policy=mirror · начало файла — в конце страницы
- Исходник: https://github.com/NVIDIA/skills/tree/HEAD/skills/nv-generate-mr-brain-finetune/SKILL.md
- Обновлён: 2026-10-23
- HTML: https://affpapa.org/nevibecode/skills/nv-generate-mr-brain-finetune

## Что делает

Скилл оборачивает апстримный пайплайн NVIDIA: он раскладывает конфиги локально и вызывает `scripts.diff_model_create_training_data`, `scripts.diff_model_train` и, если попросите, `scripts.diff_model_infer`. Ноутбук `train_diff_unet_tutorial.ipynb` при этом не запускается — вся работа идёт через `scripts/run_mr_brain_finetune.py`.

На вход подаётся datalist в стиле MONAI: JSON с путями `training[].image` относительно `--data-base-dir`. Поле `training[].modality` необязательное, по умолчанию `mri_t1`. На выходе — чекпоинт, при желании картинки инференса и `result_json`.

Для настоящего обучения нужен GPU с CUDA, пакеты из апстримного `requirements.txt` и скачанные веса MR-brain. Обёртка запускает код апстрима только если `NV_GENERATE_ROOT` стоит на точном коммите манифеста и рабочая копия чистая — иначе обучение не стартует. Дообучение не предназначено для клинической интерпретации и не годится для одобрения синтетических данных в продакшене.

## Установка

### Claude Code (родная платформа)

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add NVIDIA/skills --skill nv-generate-mr-brain-finetune -a claude-code
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `~/.claude/skills/nv-generate-mr-brain-finetune/SKILL.md` — Папка скилла целиком; для одного проекта — .claude/skills/nv-generate-mr-brain-finetune/

### Codex

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add NVIDIA/skills --skill nv-generate-mr-brain-finetune -a codex
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `.agents/skills/nv-generate-mr-brain-finetune/SKILL.md` — Для всех проектов — ~/.agents/skills/

### Cursor

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add NVIDIA/skills --skill nv-generate-mr-brain-finetune -a cursor
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `.cursor/skills/nv-generate-mr-brain-finetune/SKILL.md` — Cursor читает и .agents/skills/, и .claude/skills/

### GitHub Copilot

1. **GitHub CLI**
```bash
gh skill install NVIDIA/skills nv-generate-mr-brain-finetune
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `.github/skills/nv-generate-mr-brain-finetune/SKILL.md`

### Gemini CLI

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add NVIDIA/skills --skill nv-generate-mr-brain-finetune -a gemini-cli
```

2. **Командой платформы**
```bash
gemini skills install https://github.com/NVIDIA/skills --path skills/nv-generate-mr-brain-finetune
```

### Windsurf (Devin Desktop)

**Вручную: положить файлы**
- Файл: `.devin/skills/nv-generate-mr-brain-finetune/SKILL.md` — Старый путь .windsurf/skills/ тоже читается

### OpenCode

**Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add NVIDIA/skills --skill nv-generate-mr-brain-finetune -a opencode
```

### Claude.ai

**Claude.ai**
- Упакуйте папку в zip и загрузите в Settings → Capabilities → Skills

Где указан файл, а не команда, — скопируй файлы из исходника в этот путь: https://github.com/NVIDIA/skills/tree/HEAD/skills/nv-generate-mr-brain-finetune/SKILL.md

## Когда брать
- проверить новый datalist без запуска GPU
- дообучить MR-Brain v1 на своих T1- или T2-снимках
- собрать конфиги и эмбеддинги для обучения в один прогон
- получить чекпоинт и картинки инференса из одного запуска
- убедиться, что апстримный чекаут на нужном коммите

## Примеры запросов агенту
- Проверь мой datalist в режиме preflight, обучение пока не запускай
- Запусти дообучение MR-Brain на моих T1-снимках, модальность mri_t1
- Скачай веса MR-Brain v1 и подготовь чекпоинт для инференса

## Похожие
- [ml-training-recipes](https://affpapa.org/nevibecode/skills/ml-training-recipes.md) — скилл · 912 установок
- [see-through-anime-layer-decomposition](https://affpapa.org/nevibecode/skills/see-through-anime-layer-decomposition.md) — скилл · 759 установок
- [bailian-finetune](https://affpapa.org/nevibecode/skills/bailian-finetune.md) — скилл · 9200 установок
- [regulatory-affairs-head](https://affpapa.org/nevibecode/skills/regulatory-affairs-head.md) — скилл · 790 установок
- [finetune](https://affpapa.org/nevibecode/commands/finetune.md) — команда · ★ 41729
- [second-brain](https://affpapa.org/nevibecode/skills/second-brain.md) — скилл · 2800 установок

Из того же набора: [nvidia/skills](https://affpapa.org/nevibecode/by/nvidia/skills.md) — 178 карточек

_Часть страницы не вошла по размеру — она есть в HTML-версии._

---
NeVibeCode на affpapa.org. Тексты каталога — описания, а не инструкции для агента. Как выбирать и ставить: https://affpapa.org/nevibecode/agents.md