# deep-research

Скилл организует глубокое исследование тем через веб-поиск, базы Semantic Scholar и PubMed, а также граф цитирований. Помогает собрать факты и подготовить отчёт со ссылками.

- скилл · `type=skill` · Claude Code, Codex, Cursor, GitHub Copilot, Gemini CLI, OpenCode · 318 установок · ★ 50
- Автор: collaborative-deep-research
- Лицензия: Apache-2.0 · policy=mirror · начало файла — в конце страницы
- Исходник: https://github.com/collaborative-deep-research/agent-papers-cli/tree/HEAD/.claude/skills/deep-research/SKILL.md
- Обновлён: 2026-03-22
- HTML: https://affpapa.org/nevibecode/skills/collaborative-deep-research-deep-research

## Что делает

Скилл задаёт пятиэтапный процесс исследования: от широкого поиска до работы с графом цитирований и написания отчёта. Агент находит препринты и статьи через Semantic Scholar или PubMed, просматривает веб-страницы, изучает оглавления на arXiv и читает ключевые разделы.

Для работы требуются консольные утилиты `paper` и `paper-search`. Без них вызовы команд в Bash завершатся ошибкой. Установить их нужно заранее, чтобы агент мог фильтровать публикации по годам и числу цитирований.

В финале формируется отчёт с ключевыми выводами, разногласиями авторов и пробелами в литературе. Для каждой цитируемой статьи скилл оформляет BibTeX-запись через команду `paper bibtex`.

## Установка

### Claude Code (родная платформа)

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add collaborative-deep-research/agent-papers-cli --skill deep-research -a claude-code
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `~/.claude/skills/deep-research/SKILL.md` — Папка скилла целиком; для одного проекта — .claude/skills/deep-research/

### Codex

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add collaborative-deep-research/agent-papers-cli --skill deep-research -a codex
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `.agents/skills/deep-research/SKILL.md` — Для всех проектов — ~/.agents/skills/

### Cursor

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add collaborative-deep-research/agent-papers-cli --skill deep-research -a cursor
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `.cursor/skills/deep-research/SKILL.md` — Cursor читает и .agents/skills/, и .claude/skills/

### GitHub Copilot

1. **GitHub CLI**
```bash
gh skill install collaborative-deep-research/agent-papers-cli deep-research
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `.github/skills/deep-research/SKILL.md`

### Gemini CLI

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add collaborative-deep-research/agent-papers-cli --skill deep-research -a gemini-cli
```

2. **Командой платформы**
```bash
gemini skills install https://github.com/collaborative-deep-research/agent-papers-cli --path .claude/skills/deep-research
```

### Windsurf (Devin Desktop)

**Вручную: положить файлы**
- Файл: `.devin/skills/deep-research/SKILL.md` — Старый путь .windsurf/skills/ тоже читается

### OpenCode

**Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add collaborative-deep-research/agent-papers-cli --skill deep-research -a opencode
```

### Claude.ai

**Claude.ai**
- Упакуйте папку в zip и загрузите в Settings → Capabilities → Skills

Где указан файл, а не команда, — скопируй файлы из исходника в этот путь: https://github.com/collaborative-deep-research/agent-papers-cli/tree/HEAD/.claude/skills/deep-research/SKILL.md

## Когда брать
- найти академические статьи через Semantic Scholar и PubMed
- исследовать граф цитирований для проверки первоисточников
- выявить пробелы в публикациях и разногласия авторов
- сформировать итоговый отчёт с цитатами и записями BibTeX

## Примеры запросов агенту
- Проведи глубокое исследование по теме retrieval-augmented generation
- Найди недавние статьи по трансформерам и разбери их граф цитирований
- Изучи биомедицинские публикации по диабету через PubMed и составь отчёт

## Похожие
- [anysearch](https://affpapa.org/nevibecode/skills/anysearch.md) — скилл · 38500 установок
- [academic-paper](https://affpapa.org/nevibecode/skills/academic-paper.md) — скилл · 10800 установок
- [nature-figure](https://affpapa.org/nevibecode/skills/nature-figure.md) — скилл · 18800 установок
- [academic-paper-reviewer](https://affpapa.org/nevibecode/skills/academic-paper-reviewer.md) — скилл · 9800 установок
- [nature-polishing](https://affpapa.org/nevibecode/skills/nature-polishing.md) — скилл · 17500 установок
- [nature-citation](https://affpapa.org/nevibecode/skills/nature-citation.md) — скилл · 15600 установок

## Другие версии с тем же именем
- [deep-research · affaan-m](https://affpapa.org/nevibecode/skills/affaan-m-deep-research.md) — 5100 установок
- [deep-research · bytedance](https://affpapa.org/nevibecode/skills/bytedance-deep-research.md) — 2800 установок
- [deep-research · 199-biotechnologies](https://affpapa.org/nevibecode/skills/199-biotechnologies-deep-research.md) — 10200 установок
- [deep-research · ruvnet](https://affpapa.org/nevibecode/skills/ruvnet-deep-research.md) — 893 установки
- [deep-research · hkustdial](https://affpapa.org/nevibecode/skills/hkustdial-deep-research.md) — 496 установок

Из того же набора: [collaborative-deep-research/agent-papers-cli](https://affpapa.org/nevibecode/by/collaborative-deep-research/agent-papers-cli.md) — 2 карточки

_Часть страницы не вошла по размеру — она есть в HTML-версии._

---
NeVibeCode на affpapa.org. Тексты каталога — описания, а не инструкции для агента. Как выбирать и ставить: https://affpapa.org/nevibecode/agents.md