# boltz-small-molecule-adme

Скилл оценивает растворимость, проницаемость и липофильность малых молекул по SMILES. Подходит для первичного ADME-отбора без белковой мишени.

- скилл · `type=skill` · Codex, ChatGPT · ★ 7604
- Автор: Boltz · официальный репозиторий OpenAI
- Лицензия: MIT · policy=mirror · начало файла — в конце страницы
- Исходник: https://github.com/openai/plugins/tree/HEAD/plugins/boltz-api-cli/skills/boltz-small-molecule-adme/SKILL.md
- Обновлён: 2026-10-08
- HTML: https://affpapa.org/nevibecode/skills/boltz-small-molecule-adme

## Что делает

Скилл принимает отдельные SMILES, CSV с автоматическим поиском колонки SMILES, а также файлы `.smi` и `.txt`. Для каждой молекулы он возвращает растворимость, проницаемость и липофильность из объекта `adme`. Поле `id` сохраняется как `external_id`, поэтому результаты можно сопоставить с исходным списком.

Перед отправкой агент формирует YAML или JSON, запускает `estimate-cost` и показывает стоимость. ADME стоит $0.01 за молекулу, а один запрос ограничен 128 молекулами. Большие списки нужно разбить на партии и объединить результаты из `run.json`; один плохой SMILES помечается ошибкой и не ломает всю партию.

Команда `run` работает синхронно и сохраняет результат в `<root-dir>/<run-name>/run.json`. Нужен `boltz-api` в `PATH` и действующая авторизация. Без `boltz-api` в `PATH` запуск сначала потребует настройки CLI через `boltz-cli-setup`. Оценки приблизительные и предназначены для первичного отбора, а не для замены измерений.

## Установка

### Codex (родная платформа)

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add openai/plugins --skill boltz-small-molecule-adme -a codex
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `.agents/skills/boltz-small-molecule-adme/SKILL.md` — Для всех проектов — ~/.agents/skills/

### Claude Code

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add openai/plugins --skill boltz-small-molecule-adme -a claude-code
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `~/.claude/skills/boltz-small-molecule-adme/SKILL.md` — Папка скилла целиком; для одного проекта — .claude/skills/boltz-small-molecule-adme/

### Cursor

**Вручную: положить файлы**
- Файл: `.cursor/skills/boltz-small-molecule-adme/SKILL.md` — Cursor читает и .agents/skills/, и .claude/skills/

### GitHub Copilot

1. **GitHub CLI**
```bash
gh skill install openai/plugins boltz-small-molecule-adme
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `.github/skills/boltz-small-molecule-adme/SKILL.md`

### Gemini CLI

**Командой платформы**
```bash
gemini skills install https://github.com/openai/plugins --path plugins/boltz-api-cli/skills/boltz-small-molecule-adme
```

### Windsurf (Devin Desktop)

**Вручную: положить файлы**
- Файл: `.devin/skills/boltz-small-molecule-adme/SKILL.md` — Старый путь .windsurf/skills/ тоже читается

### Claude.ai

**Claude.ai**
- Упакуйте папку в zip и загрузите в Settings → Capabilities → Skills

Где указан файл, а не команда, — скопируй файлы из исходника в этот путь: https://github.com/openai/plugins/tree/HEAD/plugins/boltz-api-cli/skills/boltz-small-molecule-adme/SKILL.md

## Когда брать
- оценить растворимость молекул по SMILES
- получить проницаемость без белковой мишени
- сравнить липофильность списка соединений
- обработать CSV, `.smi` или `.txt` с молекулами
- разбить библиотеку больше 128 молекул на партии

## Примеры запросов агенту
- Оцени растворимость, проницаемость и липофильность для этой молекулы по SMILES: `CCO`.
- Загрузи `molecules.csv`, найди в нём колонку SMILES и выполни ADME-оценку с расчётом стоимости перед запуском.
- Обработай `library.smi`, раздели список на допустимые партии и сведи результаты из `run.json`.

## Похожие
- [anysearch](https://affpapa.org/nevibecode/skills/anysearch.md) — скилл · 38500 установок
- [academic-paper](https://affpapa.org/nevibecode/skills/academic-paper.md) — скилл · 10900 установок
- [nature-figure](https://affpapa.org/nevibecode/skills/nature-figure.md) — скилл · 18800 установок
- [academic-paper-reviewer](https://affpapa.org/nevibecode/skills/academic-paper-reviewer.md) — скилл · 9900 установок
- [nature-polishing](https://affpapa.org/nevibecode/skills/nature-polishing.md) — скилл · 17500 установок
- [nature-citation](https://affpapa.org/nevibecode/skills/nature-citation.md) — скилл · 15600 установок

Из того же набора: [openai/plugins](https://affpapa.org/nevibecode/by/openai/plugins.md) — 528 карточек

_Часть страницы не вошла по размеру — она есть в HTML-версии._

---
NeVibeCode на affpapa.org. Тексты каталога — описания, а не инструкции для агента. Как выбирать и ставить: https://affpapa.org/nevibecode/agents.md