# biomedical-search

Скилл ищет по PubMed, bioRxiv, medRxiv, ClinicalTrials.gov и инструкциям FDA одной фразой на естественном языке. Пригодится, когда нужно собрать литературу, испытания и данные по препарату в одном запросе.

- скилл · `type=skill` · Claude Code, Codex, Cursor, GitHub Copilot, Gemini CLI, OpenCode · 731 установка · ★ 64
- Автор: yorkeccak
- Лицензия: MIT · policy=mirror · начало файла — в конце страницы
- Исходник: https://github.com/yorkeccak/scientific-skills/tree/HEAD/skills/biomedical-search/SKILL.md
- Обновлён: 2026-10-04
- HTML: https://affpapa.org/nevibecode/skills/biomedical-search

## Что делает

Скилл отправляет запрос в семантический поиск Valyu и возвращает результаты сразу из пяти источников: PubMed, bioRxiv, medRxiv, ClinicalTrials.gov и FDA drug labels. Параметры собирать не нужно — пишете вопрос как есть. В ответе приходят заголовок, ссылка, полный текст, оценка релевантности и ссылки на картинки, если они есть.

Внутри два файла: bash-обёртка `scripts/search` и Node.js CLI `search.mjs`. Внешних зависимостей нет, всё на встроенном `fetch()`. Нужен Node.js 18+ и ключ Valyu API — его выдают на platform.valyu.ai, там же дают $10 стартовых кредитов. Без ключа поиск вернёт `"setup_required": true`, и скилл попросит вас его ввести, а потом сохранит через `scripts/search setup <api-key>`.

Путь к скрипту лучше находить через `find ~/.claude/plugins/cache -name "search" -path "*/biomedical-search/*/scripts/*" -type f` — команды в документации относительные, и без полного пути они не сработают. Результаты удобно резать через `jq`, например фильтровать по `clinical-trials`. Ошибки приходят в JSON с полем `success: false`, код выхода 1 — повод заглянуть в тело ответа.

## Установка

### Claude Code (родная платформа)

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add yorkeccak/scientific-skills --skill biomedical-search -a claude-code
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `~/.claude/skills/biomedical-search/SKILL.md` — Папка скилла целиком; для одного проекта — .claude/skills/biomedical-search/

### Codex

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add yorkeccak/scientific-skills --skill biomedical-search -a codex
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `.agents/skills/biomedical-search/SKILL.md` — Для всех проектов — ~/.agents/skills/

### Cursor

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add yorkeccak/scientific-skills --skill biomedical-search -a cursor
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `.cursor/skills/biomedical-search/SKILL.md` — Cursor читает и .agents/skills/, и .claude/skills/

### GitHub Copilot

1. **GitHub CLI**
```bash
gh skill install yorkeccak/scientific-skills biomedical-search
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `.github/skills/biomedical-search/SKILL.md`

### Gemini CLI

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add yorkeccak/scientific-skills --skill biomedical-search -a gemini-cli
```

2. **Командой платформы**
```bash
gemini skills install https://github.com/yorkeccak/scientific-skills --path skills/biomedical-search
```

### Windsurf (Devin Desktop)

**Вручную: положить файлы**
- Файл: `.devin/skills/biomedical-search/SKILL.md` — Старый путь .windsurf/skills/ тоже читается

### OpenCode

**Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add yorkeccak/scientific-skills --skill biomedical-search -a opencode
```

### Claude.ai

**Claude.ai**
- Упакуйте папку в zip и загрузите в Settings → Capabilities → Skills

Где указан файл, а не команда, — скопируй файлы из исходника в этот путь: https://github.com/yorkeccak/scientific-skills/tree/HEAD/skills/biomedical-search/SKILL.md

## Когда брать
- собрать литературу, испытания и данные по препарату одним запросом
- найти фазу 2 исследований по конкретному классу препаратов
- проверить безопасность лекарства по инструкции FDA и публикациям
- подобрать доказательства для дизайна клинического исследования
- вытащить полный текст статей и ссылки на графики для медицинского текста

## Примеры запросов агенту
- Найди исследования по CAR-T cell therapy, 20 результатов
- Собери данные по безопасности SGLT2 inhibitors в литературе, инструкциях и испытаниях
- Покажи только результаты из clinical-trials по запросу про checkpoint inhibitors при меланоме

## Похожие
- [similarity-search-patterns](https://affpapa.org/nevibecode/skills/similarity-search-patterns.md) — скилл · 10700 установок
- [AgentDB Vector Search](https://affpapa.org/nevibecode/skills/agentdb-vector-search.md) — скилл · 1100 установок
- [qdrant-vector-search](https://affpapa.org/nevibecode/skills/qdrant-vector-search.md) — скилл · 969 установок
- [pgvector-semantic-search](https://affpapa.org/nevibecode/skills/pgvector-semantic-search.md) — скилл · 938 установок
- [grepai-search-tips](https://affpapa.org/nevibecode/skills/grepai-search-tips.md) — скилл · 778 установок
- [mgrep-code-search](https://affpapa.org/nevibecode/skills/mgrep-code-search.md) — скилл · 620 установок

Из того же набора: [yorkeccak/scientific-skills](https://affpapa.org/nevibecode/by/yorkeccak/scientific-skills.md) — 4 карточки

_Часть страницы не вошла по размеру — она есть в HTML-версии._

---
NeVibeCode на affpapa.org. Тексты каталога — описания, а не инструкции для агента. Как выбирать и ставить: https://affpapa.org/nevibecode/agents.md