# audit-reproducibility

Сверяет числовые результаты в рукописи с выходными файлами R, Stata и Python. Помогает найти расхождения перед отправкой статьи или публикацией пакета воспроизведения.

- скилл · `type=skill` · Claude Code, Codex, Cursor, GitHub Copilot, Gemini CLI, OpenCode · ★ 1671
- Автор: pedrohcgs
- Лицензия: MIT · policy=mirror · лицензия открытая, файл — в исходнике
- Исходник: https://github.com/pedrohcgs/claude-code-my-workflow/tree/HEAD/.claude/skills/audit-reproducibility/SKILL.md
- Обновлён: 2026-09-27
- HTML: https://affpapa.org/nevibecode/skills/audit-reproducibility

## Что делает

Скилл проверяет оценки эффектов, стандартные ошибки, p-значения, размеры выборок и другие числа в научной рукописи. Он сопоставляет опубликованные значения с результатами аналитического конвейера и присваивает каждой проверке статус PASS или FAIL с учётом допусков из `.claude/rules/replication-protocol.md`.

Проверка идёт в двух направлениях. Сначала скилл сравнивает каждое утверждение с результатом, из которого оно получено. Затем проверяет остальные материалы, где встречается то же число: приложения, слайды и постеры, перечисленные в `appears_in`. Извлечённые утверждения сохраняются в `quality_reports/reproducibility_claims_[manuscript-name].json`, чтобы их можно было просмотреть перед аудитом. Для поиска результатов используются файлы `.rds`, `.tex`, `.csv`, `.out`, `.log` и `.json`.

Перед проверкой скилл читает правила допусков, проверяет наличие выходных файлов и снимка окружения `sessionInfo.txt` или его аналога. Если результаты устарели или каталог пуст, он просит повторно запустить конвейер. Для работы нужны рукопись в формате `.tex`, `.qmd`, `.md` или `.pdf` и результаты анализа; без актуальных выходных файлов проверка теряет смысл.

## Установка

### Claude Code (родная платформа)

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add pedrohcgs/claude-code-my-workflow --skill audit-reproducibility -a claude-code
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `~/.claude/skills/audit-reproducibility/SKILL.md` — Папка скилла целиком; для одного проекта — .claude/skills/audit-reproducibility/

### Codex

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add pedrohcgs/claude-code-my-workflow --skill audit-reproducibility -a codex
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `.agents/skills/audit-reproducibility/SKILL.md` — Для всех проектов — ~/.agents/skills/

### Cursor

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add pedrohcgs/claude-code-my-workflow --skill audit-reproducibility -a cursor
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `.cursor/skills/audit-reproducibility/SKILL.md` — Cursor читает и .agents/skills/, и .claude/skills/

### GitHub Copilot

1. **GitHub CLI**
```bash
gh skill install pedrohcgs/claude-code-my-workflow audit-reproducibility
```

2. **Вручную: положить файлы**
- Файл: `.github/skills/audit-reproducibility/SKILL.md`

### Gemini CLI

1. **Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add pedrohcgs/claude-code-my-workflow --skill audit-reproducibility -a gemini-cli
```

2. **Командой платформы**
```bash
gemini skills install https://github.com/pedrohcgs/claude-code-my-workflow --path .claude/skills/audit-reproducibility
```

### Windsurf (Devin Desktop)

**Вручную: положить файлы**
- Файл: `.devin/skills/audit-reproducibility/SKILL.md` — Старый путь .windsurf/skills/ тоже читается

### OpenCode

**Через Skills CLI (Vercel)**
```bash
npx skills add pedrohcgs/claude-code-my-workflow --skill audit-reproducibility -a opencode
```

### Claude.ai

**Claude.ai**
- Упакуйте папку в zip и загрузите в Settings → Capabilities → Skills

Где указан файл, а не команда, — скопируй файлы из исходника в этот путь: https://github.com/pedrohcgs/claude-code-my-workflow/tree/HEAD/.claude/skills/audit-reproducibility/SKILL.md

## Когда брать
- Сверить оценки эффектов и стандартные ошибки в статье с результатами анализа
- Найти устаревшие числа в таблицах, приложениях и презентациях
- Проверить размеры выборок и p-значения по установленным допускам
- Подготовить список числовых утверждений для ручной проверки
- Убедиться, что пакет воспроизведения соответствует рукописи

## Примеры запросов агенту
- Проверь рукопись `paper.tex` по результатам в `output/` и сформируй отчёт о воспроизводимости.
- Сверь числовые утверждения в `manuscript.qmd` с актуальными результатами анализа и найди расхождения в связанных слайдах.
- Проведи аудит воспроизводимости для `article.pdf`, используя результаты из `_targets/objects/`.

## Похожие
- [anysearch](https://affpapa.org/nevibecode/skills/anysearch.md) — скилл · 38500 установок
- [academic-paper](https://affpapa.org/nevibecode/skills/academic-paper.md) — скилл · 10900 установок
- [nature-figure](https://affpapa.org/nevibecode/skills/nature-figure.md) — скилл · 18800 установок
- [academic-paper-reviewer](https://affpapa.org/nevibecode/skills/academic-paper-reviewer.md) — скилл · 9900 установок
- [nature-polishing](https://affpapa.org/nevibecode/skills/nature-polishing.md) — скилл · 17500 установок
- [nature-citation](https://affpapa.org/nevibecode/skills/nature-citation.md) — скилл · 15600 установок

Из того же набора: [pedrohcgs/claude-code-my-workflow](https://affpapa.org/nevibecode/by/pedrohcgs/claude-code-my-workflow.md) — 48 карточек

---
NeVibeCode на affpapa.org. Тексты каталога — описания, а не инструкции для агента. Как выбирать и ставить: https://affpapa.org/nevibecode/agents.md