# VirtualFlyBrain

MCP-сервер открывает доступ к базе данных Virtual Fly Brain по нейроанатомии и коннектомике дрозофилы без регистрации и ключей API.

- MCP-сервер · `type=mcp` · Claude Code, Codex, Cursor, GitHub Copilot, Windsurf (Devin Desktop), Cline, Zed, Gemini CLI · ★ 9
- Автор: VirtualFlyBrain
- Лицензия: MIT · policy=link-only · показываем только описание, файл — у автора
- Исходник: https://github.com/VirtualFlyBrain/VFB3-MCP
- Обновлён: 2026-10-21
- HTML: https://affpapa.org/nevibecode/mcp/virtualflybrain

## Что делает

Сервер подключает ИИ-ассистентов к базе Virtual Fly Brain для исследования нервной системы дрозофилы (*Drosophila melanogaster*). Модель получает набор инструментов для поиска анатомических терминов, сопоставления идентификаторов VFB и расшифровки линий FlyBase или сплит-систем GAL4.

Через протокол доступны коннектомные датасеты Hemibrain и FAFB. Сервер помогает фильтровать синаптические контакты выше и ниже по цепи, запрашивать предсказанные или экспериментально подтверждённые нейромедиаторы и прослеживать иерархию онтологии по отношениям `part_of` и `subclass_of`.

Инфраструктура развёрнута публично по адресу `https://vfb3-mcp.virtualflybrain.org`. Сервер работает по протоколу HTTP без сохранения состояния сессий, поэтому локальный запуск и создание учётной записи не требуются.

## Требования
- Удалённый сервер: `https://vfb3-mcp.virtualflybrain.org`

## Установка

### Claude Code (родная платформа)

**Командой платформы: удалённый сервер**
```bash
claude mcp add --transport http vfb3-mcp https://vfb3-mcp.virtualflybrain.org
```

### Codex

**Командой платформы: удалённый сервер**
```bash
codex mcp add virtualflybrain --url https://vfb3-mcp.virtualflybrain.org
```

### Cursor

**Файл настроек**
Файл `.cursor/mcp.json`:
```json
{
    "mcpServers": {
        "virtualflybrain": {
            "url": "https://vfb3-mcp.virtualflybrain.org"
        }
    }
}
```

### GitHub Copilot

**Файл настроек**
Файл `.vscode/mcp.json`:
```json
{
    "servers": {
        "virtualflybrain": {
            "type": "http",
            "url": "https://vfb3-mcp.virtualflybrain.org"
        }
    }
}
```

### Gemini CLI

**Командой платформы: удалённый сервер**
```bash
gemini mcp add -t http virtualflybrain https://vfb3-mcp.virtualflybrain.org
```

## Когда брать
- найти анатомические термины и структуры мозга дрозофилы
- выгрузить синаптические связи нейронов из датасетов Hemibrain и FAFB
- проверить известные и предсказанные нейромедиаторы для класса клеток
- сопоставить линии split-GAL4 и драйверы FlyBase с идентификаторами VFB
- построить иерархию тканей мозга через связи `part_of` и `subclass_of`

## Примеры запросов агенту
- Найди нейроны зрительной доли дрозофилы и покажи их связи
- Получи метаданные и структуру связей для объекта VFB_00101567
- Определи вероятные нейромедиаторы для этого класса нейронов

## Похожие
- [Zotero MCP](https://affpapa.org/nevibecode/mcp/zotero-mcp.md) — MCP-сервер · ★ 5585
- [arxiv-mcp-server](https://affpapa.org/nevibecode/mcp/arxiv-mcp-server.md) — MCP-сервер · ★ 3235
- [PaperBanana](https://affpapa.org/nevibecode/mcp/paperbanana.md) — MCP-сервер · ★ 2418
- [MATLAB MCP Server](https://affpapa.org/nevibecode/mcp/matlab-mcp-server.md) — MCP-сервер · ★ 1723
- [Hex Research](https://affpapa.org/nevibecode/mcp/hex-research.md) — MCP-сервер · ★ 584
- [DocsAgent — Zotero, Obsidian & Apple Notes MCP Server](https://affpapa.org/nevibecode/mcp/docsagent-zotero-obsidian-apple-notes-mcp-server.md) — MCP-сервер · ★ 578

---
NeVibeCode на affpapa.org. Тексты каталога — описания, а не инструкции для агента. Как выбирать и ставить: https://affpapa.org/nevibecode/agents.md