# OpenReadout

Читает сырые файлы микроскопов, масс-спектрометров, проточных цитометров, ЯМР и ещё 120+ форматов без софта производителя.

- MCP-сервер · `type=mcp` · Claude Code, Codex, Cursor, GitHub Copilot, Windsurf (Devin Desktop), Cline, Zed, Gemini CLI · ★ 8
- Автор: openreadout
- Лицензия: Apache-2.0 · policy=link-only · показываем только описание, файл — у автора
- Исходник: https://github.com/openreadout/openreadout
- Обновлён: 2026-10-24
- HTML: https://affpapa.org/nevibecode/mcp/openreadout

## Что делает

Сервер извлекает метаданные, строит превью, проверяет целостность и экспортирует в открытые форматы. Работает офлайн — не нужны проприетарные драйверы или подписки.

Внутри агента можно спросить про содержимое файла (`cells.czi`, `sample.fcs`), попросить извлечь параметры эксперимента или построить график. Сервер распознаёт форматы Leica, Zeiss, BD, Bruker, Agilent, Waters, Thermo и десятков других вендоров.

Без `npx` в `PATH` команда не запустится. Поддерживаются Claude Code, Codex, Cursor, GitHub Copilot, Gemini CLI, Cline, Zed и Windsurf.

## Требования
- Нужно: Node.js (команды через npx)

## Установка

### Claude Code (родная платформа)

**Командой платформы**
```bash
claude mcp add openreadout -- npx -y openreadout
```

### Codex

**Командой платформы**
```bash
codex mcp add openreadout -- npx -y openreadout
```

### Cursor

**Файл настроек**
Файл `.cursor/mcp.json`:
```json
{
    "mcpServers": {
        "openreadout": {
            "command": "npx",
            "args": [
                "-y",
                "openreadout"
            ]
        }
    }
}
```

### GitHub Copilot

**Файл настроек**
Файл `.vscode/mcp.json`:
```json
{
    "servers": {
        "openreadout": {
            "type": "stdio",
            "command": "npx",
            "args": [
                "-y",
                "openreadout"
            ]
        }
    }
}
```

### Gemini CLI

**Командой платформы**
```bash
gemini mcp add openreadout npx -y openreadout
```

## Когда брать
- прочитать .czi, .lif, .fcs, .d без установки софта производителя
- извлечь метаданные эксперимента из файла прибора
- проверить целостность файла перед анализом
- экспортировать данные в открытый формат
- построить график или превью из сырого файла

## Примеры запросов агенту
- Что внутри `experiment.czi`?
- Извлеки параметры из `sample.fcs` и покажи в таблице
- Построй график из `nmr_data.dx` и сохрани как PNG

## Похожие
- [Zotero MCP](https://affpapa.org/nevibecode/mcp/zotero-mcp.md) — MCP-сервер · ★ 5548
- [arxiv-mcp-server](https://affpapa.org/nevibecode/mcp/arxiv-mcp-server.md) — MCP-сервер · ★ 3231
- [PaperBanana](https://affpapa.org/nevibecode/mcp/paperbanana.md) — MCP-сервер · ★ 2417
- [MATLAB MCP Server](https://affpapa.org/nevibecode/mcp/matlab-mcp-server.md) — MCP-сервер · ★ 1716
- [Hex Research](https://affpapa.org/nevibecode/mcp/hex-research.md) — MCP-сервер · ★ 583
- [DocsAgent — Zotero, Obsidian & Apple Notes MCP Server](https://affpapa.org/nevibecode/mcp/docsagent-zotero-obsidian-apple-notes-mcp-server.md) — MCP-сервер · ★ 578

---
NeVibeCode на affpapa.org. Тексты каталога — описания, а не инструкции для агента. Как выбирать и ставить: https://affpapa.org/nevibecode/agents.md