# genefoundry

Объединяет 22 биомедицинских MCP-сервера за одной HTTP-точкой и даёт агенту поиск инструментов. Пригодится для запросов к gnomAD, ClinVar, HPO и VEP.

- MCP-сервер · `type=mcp` · Claude Code, Codex, Cursor, GitHub Copilot, Windsurf (Devin Desktop), Cline, Zed, Gemini CLI · ★ 6
- Автор: berntpopp
- Лицензия: MIT · policy=link-only · показываем только описание, файл — у автора
- Исходник: https://github.com/berntpopp/genefoundry-router
- Обновлён: 2026-10-24
- HTML: https://affpapa.org/nevibecode/mcp/genefoundry

## Что делает

genefoundry собирает 22 биомедицинских бэкенда за одним MCP-сервером. Вместо плоского списка из 285 инструментов агент ищет нужный инструмент через `search_tools`, а затем вызывает его по имени с пространством имён через `call_tool`. Закреплённые входные инструменты остаются доступными напрямую, поэтому ключевые функции домена не зависят от результата поиска.

Сервер работает как клиент подключённых бэкендов и не переписывает их данные. Готовый узел доступен по Streamable HTTP, поэтому для подключения к Claude Code достаточно команды `claude mcp add --transport http genefoundry https://genefoundry.org/mcp`. Для собственного запуска нужны Python 3.14+, `uv`, URL бэкендов в `.env` и параметр `GF_AUTH_MODE`. Это исследовательский сервер, не средство поддержки клинических решений: его нельзя использовать для диагностики, лечения, триажа или ведения пациентов.

## Требования
- Удалённый сервер: `https://genefoundry.org/mcp`

## Установка

### Claude Code (родная платформа)

**Командой платформы: удалённый сервер**
```bash
claude mcp add --transport http genefoundry https://genefoundry.org/mcp
```

### Codex

**Командой платформы: удалённый сервер**
```bash
codex mcp add genefoundry --url https://genefoundry.org/mcp
```

### Cursor

**Файл настроек**
Файл `.cursor/mcp.json`:
```json
{
    "mcpServers": {
        "genefoundry": {
            "url": "https://genefoundry.org/mcp"
        }
    }
}
```

### GitHub Copilot

**Файл настроек**
Файл `.vscode/mcp.json`:
```json
{
    "servers": {
        "genefoundry": {
            "type": "http",
            "url": "https://genefoundry.org/mcp"
        }
    }
}
```

### Gemini CLI

**Командой платформы: удалённый сервер**
```bash
gemini mcp add -t http genefoundry https://genefoundry.org/mcp
```

## Когда брать
- найти инструмент для запроса частоты вариантов в gnomAD
- получить клиническую значимость варианта из ClinVar
- найти данные о фенотипах через HPO
- запросить аннотацию или последствия варианта через VEP
- объединить биомедицинские MCP-бэкенды за одной точкой подключения

## Примеры запросов агенту
- Найди через `search_tools` инструмент для поиска вариантов в ClinVar и вызови подходящий результат.
- Поищи через `search_tools` данные о частоте варианта в gnomAD, затем вызови найденный инструмент.
- Используй `search_tools`, чтобы найти инструмент для анализа фенотипа по HPO.

## Похожие
- [Zotero MCP](https://affpapa.org/nevibecode/mcp/zotero-mcp.md) — MCP-сервер · ★ 5585
- [arxiv-mcp-server](https://affpapa.org/nevibecode/mcp/arxiv-mcp-server.md) — MCP-сервер · ★ 3235
- [PaperBanana](https://affpapa.org/nevibecode/mcp/paperbanana.md) — MCP-сервер · ★ 2418
- [MATLAB MCP Server](https://affpapa.org/nevibecode/mcp/matlab-mcp-server.md) — MCP-сервер · ★ 1723
- [Hex Research](https://affpapa.org/nevibecode/mcp/hex-research.md) — MCP-сервер · ★ 584
- [DocsAgent — Zotero, Obsidian & Apple Notes MCP Server](https://affpapa.org/nevibecode/mcp/docsagent-zotero-obsidian-apple-notes-mcp-server.md) — MCP-сервер · ★ 578

---
NeVibeCode на affpapa.org. Тексты каталога — описания, а не инструкции для агента. Как выбирать и ставить: https://affpapa.org/nevibecode/agents.md